More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1273 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1273  ribosomal protein L5  100 
 
 		 184 aa  369  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3983  ribosomal protein L5  73.91 
 
 		 184 aa  283  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  66.85 
 
 		 183 aa  251  3e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  65.54 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  67.43 
 
 		 180 aa  249  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  67.23 
 
 		 179 aa  248  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  246  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 179 aa  246  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  65.71 
 
 		 180 aa  245  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  65.71 
 
 		 180 aa  245  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  65.71 
 
 		 180 aa  245  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  66.1 
 
 		 180 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 180 aa  242  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  61.67 
 
 		 191 aa  239  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  64.25 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  64.25 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 180 aa  239  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2052  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 196 aa  238  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000691649  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 184 aa  237  9e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  63.13 
 
 		 181 aa  236  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 180 aa  235  2e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  235  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1159  50S ribosomal protein L5  61.11 
 
 		 183 aa  235  3e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000883476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3993  ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 223 aa  234  7e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13137  normal  0.956876 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 179 aa  233  8e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2284  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000542096  hitchhiker  0.00336631 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  58.1 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0385  50S ribosomal protein L5  61.11 
 
 		 183 aa  231  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  231  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0193  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 194 aa  231  5e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.368513  normal  0.701941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4737  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  231  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.498496 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1842  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 182 aa  231  6e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  231  6e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0466  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.224995  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3897  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000030586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0499  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228142  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 180 aa  229  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5067  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000562403  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0496  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3305  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 180 aa  229  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000419375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0349  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 182 aa  229  2e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000265195  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 182 aa  228  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04509  50S ribosomal protein L5  60.57 
 
 		 180 aa  228  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00526127  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  57.69 
 
 		 192 aa  228  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3007  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 180 aa  228  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00431822  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4536  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322286  normal  0.125258 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 185 aa  228  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2411  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 195 aa  228  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000885731  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 180 aa  228  5e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  58.56 
 
 		 220 aa  228  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 180 aa  227  8e-59  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  57.54 
 
 		 179 aa  227  8e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000918773  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2312  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 181 aa  226  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000116558  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2312  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.237365  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3326  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000159394  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0638  ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000106157  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 180 aa  225  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0331  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.86209e-22  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0307  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 		 180 aa  226  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000563605  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0373  50S ribosomal protein L5  58.01 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0768  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 180 aa  225  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0251429  normal  0.0345896 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  225  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  225  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>