More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0385 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0385  50S ribosomal protein L5  100 
 
 
183 aa  365  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1159  50S ribosomal protein L5  86.89 
 
 
183 aa  330  7.000000000000001e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000883476  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05780  ribosomal protein L5  86.34 
 
 
183 aa  324  5e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1627  ribosomal protein L5  65.56 
 
 
191 aa  258  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5775  ribosomal protein L5  68.33 
 
 
184 aa  253  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0133386  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0185  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 
181 aa  252  2.0000000000000002e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2944 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0614  ribosomal protein L5  64.84 
 
 
188 aa  248  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4355  50S ribosomal protein L5  66.1 
 
 
184 aa  246  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000045958  normal  0.0455845 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3150  50S ribosomal protein L5  67.23 
 
 
184 aa  246  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  61.67 
 
 
191 aa  240  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  63.54 
 
 
183 aa  238  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 
179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 
179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  62.43 
 
 
186 aa  238  2.9999999999999997e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_002950  PG1926  50S ribosomal protein L5  62.98 
 
 
186 aa  238  5e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
179 aa  237  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
179 aa  237  5.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
179 aa  237  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
179 aa  237  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
179 aa  237  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
179 aa  237  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 
179 aa  237  6.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0779  50S ribosomal protein L5  59.44 
 
 
183 aa  236  1e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000663663  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  61.24 
 
 
180 aa  234  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 
179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 
179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 
179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0373  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 
186 aa  234  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1727  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 
186 aa  234  6e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
179 aa  234  7e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 
179 aa  233  8e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 
180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0266  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 
187 aa  232  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0642331  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0307  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 
180 aa  232  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000563605  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1273  ribosomal protein L5  61.11 
 
 
184 aa  231  4.0000000000000004e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2522  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 
186 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  64 
 
 
185 aa  231  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 
179 aa  229  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 
179 aa  229  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 
179 aa  229  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 
179 aa  229  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 
179 aa  229  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3326  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
179 aa  229  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000159394  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  59.32 
 
 
179 aa  229  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0771  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 
186 aa  228  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542997  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3431  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 
184 aa  228  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00979614  normal  0.204364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 
191 aa  228  5e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  58.19 
 
 
179 aa  228  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 
179 aa  227  8e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  59.66 
 
 
179 aa  227  9e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
179 aa  227  9e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 
179 aa  227  9e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 
193 aa  226  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 
185 aa  226  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 
179 aa  226  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 
179 aa  226  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2052  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
196 aa  226  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000691649  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 
181 aa  225  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  59.22 
 
 
192 aa  226  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  59.32 
 
 
179 aa  226  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  58.66 
 
 
181 aa  226  2e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 
180 aa  225  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 
179 aa  225  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 
192 aa  225  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 
180 aa  225  3e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 
179 aa  225  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  58.19 
 
 
179 aa  224  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
179 aa  224  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 
179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5058  50S ribosomal protein L5  58.56 
 
 
185 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 
179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 
179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 
179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 
179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2978  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 
189 aa  224  5.0000000000000005e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 
179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 
179 aa  224  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  58.76 
 
 
179 aa  224  6e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 
179 aa  224  7e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3655  50S ribosomal protein L5  58.56 
 
 
185 aa  224  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2827  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
179 aa  223  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000925898  normal  0.276949 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  58.19 
 
 
179 aa  223  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264  ribosomal L5P C-terminal domain protein  60 
 
 
190 aa  223  1e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 
182 aa  223  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  59.89 
 
 
180 aa  223  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0261  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
179 aa  223  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00011988  hitchhiker  0.00419611 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0326  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
179 aa  223  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000464858  decreased coverage  0.00283063 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3632  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
179 aa  223  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000391784  decreased coverage  0.00000000000159528 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  59.22 
 
 
191 aa  223  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3007  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 
180 aa  222  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00431822  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 
179 aa  222  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3305  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 
180 aa  222  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000419375  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 
179 aa  222  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0859  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 
185 aa  223  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246885  hitchhiker  0.001984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>