More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1159 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1159  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 183 aa  369  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000883476  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0385  50S ribosomal protein L5  86.89 
 
 		 183 aa  330  7.000000000000001e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05780  ribosomal protein L5  84.15 
 
 		 183 aa  320  6e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1627  ribosomal protein L5  65 
 
 		 191 aa  256  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0614  ribosomal protein L5  67.03 
 
 		 188 aa  254  5e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  65.19 
 
 		 183 aa  246  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0779  50S ribosomal protein L5  62.78 
 
 		 183 aa  244  3e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000663663  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5775  ribosomal protein L5  64.25 
 
 		 184 aa  245  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0133386  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0185  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 181 aa  244  4e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2944 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3150  50S ribosomal protein L5  67.05 
 
 		 184 aa  244  6.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  61.11 
 
 		 191 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4355  50S ribosomal protein L5  64.77 
 
 		 184 aa  242  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000045958  normal  0.0455845 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  237  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  237  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1926  50S ribosomal protein L5  63.54 
 
 		 186 aa  236  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0373  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 186 aa  236  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1727  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 186 aa  236  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  64.2 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1273  ribosomal protein L5  61.11 
 
 		 184 aa  235  3e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 180 aa  234  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0307  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 180 aa  234  4e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000563605  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  59.12 
 
 		 186 aa  234  4e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  233  9e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2522  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 186 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 180 aa  232  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2978  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 189 aa  231  4.0000000000000004e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  58.66 
 
 		 181 aa  231  4.0000000000000004e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0771  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 186 aa  231  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542997  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  231  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  231  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 191 aa  229  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0266  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 187 aa  230  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0642331  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  61.11 
 
 		 182 aa  229  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0318  50S ribosomal protein L5  56.59 
 
 		 196 aa  228  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374414 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 180 aa  228  4e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0859  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 185 aa  228  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246885  hitchhiker  0.001984 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 185 aa  228  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 181 aa  227  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 191 aa  227  8e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 185 aa  227  8e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 192 aa  227  9e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 180 aa  226  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3655  50S ribosomal protein L5  58.56 
 
 		 185 aa  226  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3326  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000159394  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 180 aa  225  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 193 aa  226  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 180 aa  226  2e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  58.89 
 
 		 192 aa  225  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 180 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3431  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 184 aa  225  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00979614  normal  0.204364 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 178 aa  225  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264  ribosomal L5P C-terminal domain protein  59.56 
 
 		 190 aa  224  4e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2052  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 196 aa  224  6e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000691649  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  224  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 180 aa  224  7e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0193  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 194 aa  224  8e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.368513  normal  0.701941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5058  50S ribosomal protein L5  56.91 
 
 		 185 aa  223  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0297  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 187 aa  223  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0261  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00011988  hitchhiker  0.00419611 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 180 aa  222  2e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3993  ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 223 aa  222  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13137  normal  0.956876 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1839  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 195 aa  222  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314483  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 		 180 aa  223  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 198 aa  222  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1376  50S ribosomal protein L5  55.25 
 
 		 185 aa  221  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 189 aa  221  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2284  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 196 aa  222  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000542096  hitchhiker  0.00336631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0326  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  221  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000464858  decreased coverage  0.00283063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>