More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5775 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5775  ribosomal protein L5  100 
 
 		 184 aa  370  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0133386  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4355  50S ribosomal protein L5  82.61 
 
 		 184 aa  318  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000045958  normal  0.0455845 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3150  50S ribosomal protein L5  78.89 
 
 		 184 aa  296  9e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0185  50S ribosomal protein L5  68.16 
 
 		 181 aa  276  1e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1627  ribosomal protein L5  71.02 
 
 		 191 aa  267  8e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0385  50S ribosomal protein L5  68.33 
 
 		 183 aa  253  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0614  ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 188 aa  246  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05780  ribosomal protein L5  64.25 
 
 		 183 aa  246  2e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1159  50S ribosomal protein L5  64.25 
 
 		 183 aa  245  3e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000883476  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  62.92 
 
 		 191 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  237  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1926  50S ribosomal protein L5  62.3 
 
 		 186 aa  236  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  63.13 
 
 		 180 aa  236  1e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 181 aa  234  7e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 183 aa  230  7.000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 182 aa  228  4e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01290  ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 179 aa  227  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.388904  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0779  50S ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 183 aa  226  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000663663  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 180 aa  226  1e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1839  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 195 aa  226  1e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314483  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 180 aa  226  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 180 aa  226  1e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 180 aa  225  2e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2052  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 196 aa  226  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000691649  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2217  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 195 aa  225  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286629  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  58.62 
 
 		 180 aa  224  4e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 180 aa  224  4e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 180 aa  224  5.0000000000000005e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0301  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 195 aa  222  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.433186  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 179 aa  221  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  221  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 180 aa  221  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  56.67 
 
 		 184 aa  221  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 180 aa  221  6e-57  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  57.06 
 
 		 191 aa  220  9e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  220  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0307  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000563605  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  56.42 
 
 		 192 aa  219  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1172  ribosomal protein L5  55.62 
 
 		 180 aa  218  3e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0444943  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2284  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 196 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000542096  hitchhiker  0.00336631 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  56 
 
 		 179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 		 180 aa  218  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 193 aa  218  5e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0607  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 180 aa  218  5e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000230236  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2411  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 195 aa  218  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000885731  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3431  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 184 aa  217  6e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00979614  normal  0.204364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2978  50S ribosomal protein L5  56.67 
 
 		 189 aa  217  7.999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 180 aa  216  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  53.63 
 
 		 189 aa  216  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2522  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 186 aa  216  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0859  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 185 aa  216  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246885  hitchhiker  0.001984 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  56.18 
 
 		 180 aa  216  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  56.57 
 
 		 179 aa  215  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1727  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 186 aa  215  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  54.55 
 
 		 179 aa  215  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0373  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 186 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0771  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 186 aa  215  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542997  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  214  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2166  ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 183 aa  214  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3937  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 183 aa  214  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1273  ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 184 aa  214  5.9999999999999996e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  55.62 
 
 		 191 aa  214  5.9999999999999996e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  54.24 
 
 		 180 aa  214  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  56.57 
 
 		 179 aa  214  7e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0193  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 194 aa  214  8e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.368513  normal  0.701941 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5058  ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 179 aa  214  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0491308  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 193 aa  214  8e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  51.67 
 
 		 193 aa  214  8e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  213  9e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 185 aa  213  9e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 		 192 aa  213  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 186 aa  213  9.999999999999999e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29620  LSU ribosomal protein L5P  55.62 
 
 		 189 aa  213  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  55.17 
 
 		 181 aa  213  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  54.86 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  53.71 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  54.75 
 
 		 182 aa  212  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>