More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1627 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1627  ribosomal protein L5  100 
 
 		 191 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3150  50S ribosomal protein L5  68.62 
 
 		 184 aa  271  3e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0614  ribosomal protein L5  68.28 
 
 		 188 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5775  ribosomal protein L5  71.02 
 
 		 184 aa  267  8.999999999999999e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0133386  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0185  50S ribosomal protein L5  69.1 
 
 		 181 aa  266  1e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4355  50S ribosomal protein L5  66.85 
 
 		 184 aa  264  5.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000045958  normal  0.0455845 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0385  50S ribosomal protein L5  65.56 
 
 		 183 aa  258  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05780  ribosomal protein L5  64.44 
 
 		 183 aa  256  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1159  50S ribosomal protein L5  65 
 
 		 183 aa  256  2e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000883476  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  64.8 
 
 		 191 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1926  50S ribosomal protein L5  65.19 
 
 		 186 aa  249  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  61.67 
 
 		 183 aa  238  4e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  64.2 
 
 		 179 aa  237  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  235  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  233  9e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1839  50S ribosomal protein L5  60.44 
 
 		 195 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314483  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  231  6e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  58.38 
 
 		 187 aa  228  4e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 180 aa  228  5e-59  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 179 aa  228  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 182 aa  225  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2217  50S ribosomal protein L5  58.79 
 
 		 195 aa  225  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286629  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0193  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 194 aa  223  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.368513  normal  0.701941 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 180 aa  223  1e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2052  50S ribosomal protein L5  57.69 
 
 		 196 aa  223  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000691649  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  60.57 
 
 		 180 aa  221  3e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 180 aa  222  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0684  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0307  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 180 aa  220  9e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000563605  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  56 
 
 		 179 aa  220  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0301  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 195 aa  219  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.433186  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0779  50S ribosomal protein L5  55.25 
 
 		 183 aa  219  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000663663  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 		 180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 180 aa  218  3e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  218  6e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2411  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 195 aa  218  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000885731  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  217  7e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1273  ribosomal protein L5  55.8 
 
 		 184 aa  217  8.999999999999998e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3431  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 184 aa  216  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00979614  normal  0.204364 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2284  50S ribosomal protein L5  53.8 
 
 		 196 aa  216  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000542096  hitchhiker  0.00336631 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3326  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  217  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000159394  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  54.55 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  55.43 
 
 		 179 aa  217  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  55.43 
 
 		 179 aa  217  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  53.55 
 
 		 198 aa  216  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2245  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00560978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 181 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  53.98 
 
 		 178 aa  216  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0261  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00011988  hitchhiker  0.00419611 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  55.06 
 
 		 193 aa  216  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  57.92 
 
 		 180 aa  216  2e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5058  ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0491308  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0406  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 183 aa  215  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0381  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 183 aa  215  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  53.41 
 
 		 178 aa  215  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5058  50S ribosomal protein L5  55.43 
 
 		 185 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0487  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 179 aa  215  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  58.47 
 
 		 180 aa  214  4e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 179 aa  215  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01290  ribosomal protein L5  55.17 
 
 		 179 aa  214  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.388904  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 179 aa  215  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 179 aa  215  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  214  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000918773  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  56.57 
 
 		 180 aa  214  5e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1376  50S ribosomal protein L5  54.89 
 
 		 185 aa  214  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  52.97 
 
 		 186 aa  214  5.9999999999999996e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  53.37 
 
 		 191 aa  214  8e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 180 aa  214  8e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  214  8e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  214  9e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3632  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000391784  decreased coverage  0.00000000000159528 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0613  50S ribosomal protein L5  53.98 
 
 		 181 aa  213  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.684436  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2827  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000925898  normal  0.276949 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  53.48 
 
 		 193 aa  213  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0326  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000464858  decreased coverage  0.00283063 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  54.55 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>