More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0684 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0684  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 180 aa  357  3e-98  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  81.67 
 
 		 180 aa  307  5e-83  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  68.54 
 
 		 179 aa  255  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  67.42 
 
 		 179 aa  256  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  65 
 
 		 180 aa  255  2e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  65.17 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  65.17 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  65.17 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  65.17 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  65.17 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  65.17 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 		 179 aa  247  8e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 		 179 aa  246  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 179 aa  246  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  63.89 
 
 		 180 aa  245  2e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 		 179 aa  243  9e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 		 179 aa  243  9e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 183 aa  243  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  62.22 
 
 		 180 aa  243  9.999999999999999e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0607  50S ribosomal protein L5  61.67 
 
 		 180 aa  241  3.9999999999999997e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000230236  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  60.56 
 
 		 180 aa  238  2e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 178 aa  237  6.999999999999999e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 182 aa  235  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  59.44 
 
 		 180 aa  235  3e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  59.44 
 
 		 180 aa  232  2.0000000000000002e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1839  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 195 aa  231  3e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314483  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  59.09 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 		 181 aa  230  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2284  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 196 aa  230  7.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000542096  hitchhiker  0.00336631 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 		 220 aa  230  8.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2217  50S ribosomal protein L5  56.67 
 
 		 195 aa  229  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286629  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 180 aa  229  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  55.62 
 
 		 180 aa  228  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  57.63 
 
 		 181 aa  229  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 180 aa  229  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 180 aa  228  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0779  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 183 aa  228  4e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000663663  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 180 aa  228  4e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  58.99 
 
 		 179 aa  227  6e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2052  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 196 aa  227  6e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000691649  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 180 aa  226  9e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  53.37 
 
 		 180 aa  226  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0859  50S ribosomal protein L5  62.21 
 
 		 185 aa  226  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246885  hitchhiker  0.001984 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  58.43 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4926  ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000138257  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  56.18 
 
 		 179 aa  225  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  57.78 
 
 		 184 aa  225  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  53.93 
 
 		 179 aa  224  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  55 
 
 		 180 aa  224  7e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 179 aa  224  7e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2053  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 179 aa  224  7e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00300411  normal  0.056988 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2411  50S ribosomal protein L5  55 
 
 		 195 aa  223  8e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000885731  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  54.44 
 
 		 180 aa  223  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2245  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00560978  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  55.62 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 187 aa  223  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  55.62 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 179 aa  223  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  55.62 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  55.62 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  56.18 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  55.62 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  55.62 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2313  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000920139  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 179 aa  221  3e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  221  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19911  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  221  4e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1627  ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 191 aa  221  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0340  50S ribosomal protein L5  55.62 
 
 		 181 aa  221  4e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  55.06 
 
 		 179 aa  221  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 192 aa  221  4.9999999999999996e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  221  6e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1117  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  221  6e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  220  7e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000918773  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  53.33 
 
 		 180 aa  220  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  53.33 
 
 		 180 aa  220  7e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  53.33 
 
 		 180 aa  220  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  54.44 
 
 		 193 aa  220  8e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  220  9e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  53.93 
 
 		 180 aa  219  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  53.93 
 
 		 180 aa  219  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0193  50S ribosomal protein L5  53.63 
 
 		 194 aa  219  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.368513  normal  0.701941 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1159  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 183 aa  219  9.999999999999999e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000883476  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0307  50S ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 180 aa  219  9.999999999999999e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000563605  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  54.49 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>