More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2284 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2284  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000542096  hitchhiker  0.00336631 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2052  50S ribosomal protein L5  84.18 
 
 		 196 aa  344  5e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000691649  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2217  50S ribosomal protein L5  79.08 
 
 		 195 aa  324  5e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286629  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2411  50S ribosomal protein L5  77.55 
 
 		 195 aa  322  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000885731  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0301  50S ribosomal protein L5  77.84 
 
 		 195 aa  320  7e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.433186  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0193  50S ribosomal protein L5  77.44 
 
 		 194 aa  318  3.9999999999999996e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.368513  normal  0.701941 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1839  50S ribosomal protein L5  80.11 
 
 		 195 aa  314  6e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314483  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  63.48 
 
 		 191 aa  241  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 179 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 178 aa  236  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 179 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 179 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 179 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 179 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0859  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 185 aa  236  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246885  hitchhiker  0.001984 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  60.67 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2827  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000925898  normal  0.276949 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3632  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000391784  decreased coverage  0.00000000000159528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0326  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000464858  decreased coverage  0.00283063 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1273  ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 184 aa  233  1.0000000000000001e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3734  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000331998  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2620  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0483122  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3792  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0743065  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3764  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0003555  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3490  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00587093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1936  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000916993  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3157  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000127372  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3056  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000258896  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  58.99 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0261  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00011988  hitchhiker  0.00419611 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0288  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152111  normal  0.01295 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0393  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00978346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3459  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000529438  decreased coverage  0.00459021 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0385  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000000334346  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2747  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000000541719  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3431  50S ribosomal protein L5  56.91 
 
 		 184 aa  232  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00979614  normal  0.204364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0279  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000228598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0360  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000501329  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0339  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000790094  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 		 179 aa  231  6e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 180 aa  230  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0684  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 180 aa  230  9e-60  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  230  9e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 180 aa  229  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 180 aa  229  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 180 aa  229  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 180 aa  228  3e-59  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2313  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  229  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000920139  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  56.18 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 181 aa  228  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 179 aa  228  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 193 aa  227  9e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 179 aa  227  9e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 180 aa  227  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0613  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  57.3 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 183 aa  226  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  56.18 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5058  ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0491308  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3326  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000159394  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 180 aa  225  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  225  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1034  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  224  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000106866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  225  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03159  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000411475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0405  ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4631  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000345599  normal  0.589642 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3693  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000052658  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03110  hypothetical protein  61.24 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000280639  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3502  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000625147  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3791  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000522149  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  56.57 
 
 		 182 aa  224  5.0000000000000005e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3603  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337541  normal  0.028029 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0405  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000176742  hitchhiker  0.0000151548 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3810  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  224  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000450853  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  56.18 
 
 		 179 aa  224  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05780  ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 183 aa  224  6e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3989  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  224  6e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0243679  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3305  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 180 aa  224  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000419375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3167  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 180 aa  224  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000061863  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04509  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 180 aa  224  7e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00526127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>