More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2313 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2313  50S ribosomal protein L5  100 
 
 
179 aa  363  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000920139  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0613  50S ribosomal protein L5  91.06 
 
 
179 aa  343  1e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554021  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0385  50S ribosomal protein L5  89.39 
 
 
179 aa  342  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000000334346  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0393  50S ribosomal protein L5  89.39 
 
 
179 aa  342  2e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00978346  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1034  50S ribosomal protein L5  88.83 
 
 
179 aa  331  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000106866  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4231  50S ribosomal protein L5  86.03 
 
 
179 aa  325  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00181244  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5058  ribosomal protein L5  86.03 
 
 
179 aa  325  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0491308  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0487  50S ribosomal protein L5  85.47 
 
 
179 aa  322  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000728696  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0332  50S ribosomal protein L5  84.92 
 
 
179 aa  320  6e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000492925  hitchhiker  0.000510256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3431  50S ribosomal protein L5  82.02 
 
 
184 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00979614  normal  0.204364 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3937  50S ribosomal protein L5  82.02 
 
 
183 aa  308  2.9999999999999997e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3167  50S ribosomal protein L5  78.09 
 
 
180 aa  299  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000061863  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3007  50S ribosomal protein L5  77.53 
 
 
180 aa  298  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00431822  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0326  50S ribosomal protein L5  77.09 
 
 
179 aa  298  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000464858  decreased coverage  0.00283063 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2827  50S ribosomal protein L5  77.09 
 
 
179 aa  298  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000925898  normal  0.276949 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3632  50S ribosomal protein L5  77.09 
 
 
179 aa  298  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000391784  decreased coverage  0.00000000000159528 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  77.09 
 
 
179 aa  297  5e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000918773  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3056  50S ribosomal protein L5  77.65 
 
 
179 aa  296  8e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000258896  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0339  50S ribosomal protein L5  76.54 
 
 
179 aa  296  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000790094  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3764  50S ribosomal protein L5  77.09 
 
 
179 aa  296  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0003555  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3459  50S ribosomal protein L5  76.54 
 
 
179 aa  296  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000529438  decreased coverage  0.00459021 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3490  50S ribosomal protein L5  77.09 
 
 
179 aa  296  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00587093  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3157  50S ribosomal protein L5  77.09 
 
 
179 aa  296  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000127372  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1936  50S ribosomal protein L5  77.09 
 
 
179 aa  296  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000916993  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2747  50S ribosomal protein L5  76.54 
 
 
179 aa  296  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000000541719  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3734  50S ribosomal protein L5  77.09 
 
 
179 aa  296  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000331998  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0360  50S ribosomal protein L5  76.54 
 
 
179 aa  296  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000501329  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3792  50S ribosomal protein L5  77.09 
 
 
179 aa  296  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0743065  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0288  50S ribosomal protein L5  76.54 
 
 
179 aa  295  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152111  normal  0.01295 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0261  50S ribosomal protein L5  77.09 
 
 
179 aa  295  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00011988  hitchhiker  0.00419611 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0279  50S ribosomal protein L5  76.54 
 
 
179 aa  295  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000228598  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2938  50S ribosomal protein L5  75.28 
 
 
180 aa  294  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000312511  hitchhiker  0.000000922003 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3285  50S ribosomal protein L5  75.28 
 
 
180 aa  294  4e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000500711  hitchhiker  0.00000237864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3305  50S ribosomal protein L5  76.97 
 
 
180 aa  294  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000419375  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2620  50S ribosomal protein L5  76.54 
 
 
179 aa  294  6e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0483122  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0065  50S ribosomal protein L5  76.27 
 
 
180 aa  291  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000146206  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0062  ribosomal protein L5  75.71 
 
 
180 aa  289  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145784  hitchhiker  1.96626e-17 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0779  50S ribosomal protein L5  73.74 
 
 
179 aa  288  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000823313  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0331  50S ribosomal protein L5  73.74 
 
 
179 aa  288  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.86209e-22  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3326  50S ribosomal protein L5  72.63 
 
 
179 aa  288  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000159394  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  73.18 
 
 
179 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2312  50S ribosomal protein L5  68.16 
 
 
179 aa  268  5e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.237365  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04509  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 
180 aa  265  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00526127  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0768  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 
180 aa  266  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0251429  normal  0.0345896 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0339  50S ribosomal protein L5  67.8 
 
 
180 aa  263  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0509  50S ribosomal protein L5  67.8 
 
 
180 aa  263  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0543565  hitchhiker  0.000000000388642 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  64.61 
 
 
179 aa  262  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  64.04 
 
 
179 aa  260  6.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 
179 aa  259  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 
179 aa  259  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  64.25 
 
 
179 aa  259  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 
179 aa  259  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 
179 aa  259  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  65.73 
 
 
179 aa  259  1e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 
179 aa  259  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  64.04 
 
 
179 aa  259  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 
179 aa  258  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  63.48 
 
 
179 aa  258  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 
179 aa  258  4e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0307  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 
180 aa  258  4e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000563605  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  65.73 
 
 
179 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  65.73 
 
 
179 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  65.73 
 
 
179 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  65.73 
 
 
179 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 
179 aa  257  5.0000000000000005e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  64.8 
 
 
179 aa  257  6e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  65.36 
 
 
179 aa  257  8e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  63.48 
 
 
179 aa  257  8e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  64.25 
 
 
179 aa  256  9e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  64.8 
 
 
179 aa  256  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  65.73 
 
 
179 aa  256  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  65.73 
 
 
179 aa  256  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  64.8 
 
 
179 aa  256  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 
179 aa  255  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  65.17 
 
 
179 aa  255  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  64.8 
 
 
179 aa  256  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  64.25 
 
 
179 aa  254  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  64.25 
 
 
179 aa  254  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 
179 aa  254  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  64.8 
 
 
179 aa  255  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0466  50S ribosomal protein L5  64.25 
 
 
179 aa  254  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.224995  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0496  50S ribosomal protein L5  64.25 
 
 
179 aa  254  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116294  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0499  50S ribosomal protein L5  64.25 
 
 
179 aa  254  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228142  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  65.36 
 
 
179 aa  254  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  64.25 
 
 
179 aa  254  6e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4737  50S ribosomal protein L5  64.25 
 
 
179 aa  253  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.498496 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 
179 aa  253  9e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  63.48 
 
 
179 aa  252  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0506  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 
179 aa  252  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0585941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  63.48 
 
 
179 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0613  50S ribosomal protein L5  62.92 
 
 
181 aa  251  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.684436  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0445  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 
179 aa  251  3e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0266949  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 
179 aa  250  8.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0406  50S ribosomal protein L5  63.13 
 
 
183 aa  249  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0381  50S ribosomal protein L5  63.13 
 
 
183 aa  249  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2312  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 
181 aa  248  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000116558  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3897  50S ribosomal protein L5  63.13 
 
 
179 aa  249  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000030586  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5067  50S ribosomal protein L5  63.13 
 
 
179 aa  248  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000562403  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0859  50S ribosomal protein L5  62.92 
 
 
185 aa  248  3e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246885  hitchhiker  0.001984 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4536  50S ribosomal protein L5  63.13 
 
 
179 aa  248  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322286  normal  0.125258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>