More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2217 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2217  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 195 aa  397  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286629  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2411  50S ribosomal protein L5  88.21 
 
 		 195 aa  356  9e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000885731  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0301  50S ribosomal protein L5  83.08 
 
 		 195 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.433186  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2052  50S ribosomal protein L5  82.14 
 
 		 196 aa  328  3e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000691649  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1839  50S ribosomal protein L5  79.49 
 
 		 195 aa  327  6e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314483  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2284  50S ribosomal protein L5  79.08 
 
 		 196 aa  324  5e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000542096  hitchhiker  0.00336631 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0193  50S ribosomal protein L5  79.9 
 
 		 194 aa  322  2e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.368513  normal  0.701941 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 191 aa  234  6e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0859  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246885  hitchhiker  0.001984 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  231  7.000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  231  7.000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 179 aa  230  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  58.43 
 
 		 179 aa  230  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0684  50S ribosomal protein L5  56.67 
 
 		 180 aa  229  2e-59  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000918773  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2312  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 179 aa  228  5e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.237365  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 179 aa  228  6e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 179 aa  228  6e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  58.89 
 
 		 180 aa  227  1e-58  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 185 aa  227  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 180 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1627  ribosomal protein L5  58.79 
 
 		 191 aa  225  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5775  ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 184 aa  225  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0133386  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  55.62 
 
 		 179 aa  225  4e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  57.69 
 
 		 189 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01290  ribosomal protein L5  55.81 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.388904  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  56.18 
 
 		 179 aa  224  7e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3632  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  224  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000391784  decreased coverage  0.00000000000159528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0326  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  224  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000464858  decreased coverage  0.00283063 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4355  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 184 aa  224  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000045958  normal  0.0455845 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2827  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  224  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000925898  normal  0.276949 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 178 aa  224  7e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  56.18 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2620  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0483122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 180 aa  223  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5058  ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0491308  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3764  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0003555  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3157  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000127372  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3056  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000258896  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3792  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0743065  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1936  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000916993  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3734  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000331998  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1273  ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 184 aa  222  3e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3490  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00587093  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0288  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  221  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152111  normal  0.01295 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0279  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  221  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000228598  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0261  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00011988  hitchhiker  0.00419611 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3459  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000529438  decreased coverage  0.00459021 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2747  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000000541719  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0360  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000501329  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0339  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000790094  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  54.19 
 
 		 184 aa  221  6e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0768  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 180 aa  221  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0251429  normal  0.0345896 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04509  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 		 180 aa  221  6e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00526127  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0509  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 		 180 aa  221  7e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0543565  hitchhiker  0.000000000388642 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  221  7e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  221  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  221  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2312  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 181 aa  221  7e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000116558  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  221  7e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0339  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 		 180 aa  221  7e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  221  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  221  7e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 180 aa  221  8e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 180 aa  221  8e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 180 aa  220  8e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  55.43 
 
 		 181 aa  220  8e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  220  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  220  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 183 aa  220  9e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 193 aa  219  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3431  50S ribosomal protein L5  54.95 
 
 		 184 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00979614  normal  0.204364 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1172  ribosomal protein L5  56.11 
 
 		 180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0444943  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  55.06 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3937  50S ribosomal protein L5  55.62 
 
 		 183 aa  219  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0307  50S ribosomal protein L5  54.75 
 
 		 180 aa  218  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000563605  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0779  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  218  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000823313  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  55.62 
 
 		 179 aa  218  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 		 179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0185  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 181 aa  218  3.9999999999999997e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2944 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05780  ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 183 aa  218  3.9999999999999997e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>