More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0614 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0614  ribosomal protein L5  100 
 
 		 188 aa  378  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1627  ribosomal protein L5  68.28 
 
 		 191 aa  268  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1159  50S ribosomal protein L5  67.03 
 
 		 183 aa  254  5e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000883476  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3150  50S ribosomal protein L5  68.51 
 
 		 184 aa  254  8e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05780  ribosomal protein L5  64.84 
 
 		 183 aa  250  1e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0385  50S ribosomal protein L5  64.84 
 
 		 183 aa  248  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5775  ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 184 aa  246  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0133386  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0185  50S ribosomal protein L5  63.13 
 
 		 181 aa  243  9.999999999999999e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2944 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  59.57 
 
 		 191 aa  241  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4355  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 184 aa  242  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000045958  normal  0.0455845 
 
 
-
 
NC_002950  PG1926  50S ribosomal protein L5  64.17 
 
 		 186 aa  237  5.999999999999999e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  230  7.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  230  9e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  228  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 183 aa  228  5e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  224  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  58.89 
 
 		 179 aa  224  8e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  223  9e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0779  50S ribosomal protein L5  55 
 
 		 183 aa  222  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000663663  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  55.38 
 
 		 192 aa  223  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 193 aa  220  7e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  220  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  220  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2052  50S ribosomal protein L5  55.8 
 
 		 196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000691649  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  55.08 
 
 		 193 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 180 aa  218  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  218  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3993  ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 223 aa  217  7.999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13137  normal  0.956876 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 182 aa  216  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0193  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 		 194 aa  216  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.368513  normal  0.701941 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  56.67 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  54.44 
 
 		 189 aa  216  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2217  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 195 aa  215  2.9999999999999998e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286629  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1839  50S ribosomal protein L5  55.8 
 
 		 195 aa  215  2.9999999999999998e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314483  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1273  ribosomal protein L5  55.31 
 
 		 184 aa  215  2.9999999999999998e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 180 aa  215  4e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  55 
 
 		 179 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2978  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 189 aa  214  5.9999999999999996e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  214  8e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 181 aa  214  9e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  52.75 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  55 
 
 		 186 aa  213  9.999999999999999e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 180 aa  213  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  52.84 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  52.84 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  54.49 
 
 		 180 aa  213  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2411  50S ribosomal protein L5  54.75 
 
 		 195 aa  213  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000885731  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  54.19 
 
 		 198 aa  213  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  53.01 
 
 		 187 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3326  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000159394  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  53.59 
 
 		 191 aa  211  2.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  53.93 
 
 		 180 aa  212  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  53.67 
 
 		 179 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 		 180 aa  212  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 180 aa  211  2.9999999999999995e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  54.19 
 
 		 185 aa  211  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 181 aa  211  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2522  50S ribosomal protein L5  53.63 
 
 		 186 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3655  50S ribosomal protein L5  54.7 
 
 		 185 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 180 aa  211  4.9999999999999996e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0307  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 		 180 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000563605  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0266  50S ribosomal protein L5  53.59 
 
 		 187 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0642331  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0771  50S ribosomal protein L5  52.49 
 
 		 186 aa  211  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542997  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  53.41 
 
 		 179 aa  211  5.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1727  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 		 186 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 179 aa  210  7e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  55.87 
 
 		 192 aa  210  7e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  55.06 
 
 		 185 aa  210  7.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 180 aa  210  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0373  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 		 186 aa  210  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 		 179 aa  210  7.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0297  50S ribosomal protein L5  51.38 
 
 		 187 aa  209  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  51.96 
 
 		 179 aa  210  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  55.62 
 
 		 179 aa  210  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000918773  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4495  ribosomal protein L5  53.41 
 
 		 184 aa  209  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  52.25 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2307  50S ribosomal protein L5  54.7 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0101823  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  54.44 
 
 		 191 aa  209  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3983  ribosomal protein L5  54.44 
 
 		 184 aa  209  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  53.93 
 
 		 180 aa  209  2e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  53.33 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  53.59 
 
 		 193 aa  208  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  50.84 
 
 		 179 aa  208  3e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>