More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3983 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3983  ribosomal protein L5  100 
 
 
184 aa  367  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1273  ribosomal protein L5  73.91 
 
 
184 aa  283  1.0000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  64.2 
 
 
179 aa  244  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  66.1 
 
 
184 aa  243  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  65.34 
 
 
179 aa  241  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  64.77 
 
 
179 aa  239  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  62.92 
 
 
179 aa  239  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  62.36 
 
 
191 aa  237  8e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  62.92 
 
 
179 aa  235  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  59.89 
 
 
179 aa  235  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  60.89 
 
 
183 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 
179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 
179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 
179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 
179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 
179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 
179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 
179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 
220 aa  231  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 
179 aa  231  5e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000918773  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 
179 aa  231  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 
179 aa  230  7.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0779  50S ribosomal protein L5  57.69 
 
 
183 aa  230  8.000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000663663  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 
178 aa  230  8.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 
179 aa  229  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
179 aa  229  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
179 aa  229  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
179 aa  229  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
180 aa  229  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
179 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  62.21 
 
 
180 aa  229  2e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2052  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 
196 aa  228  4e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000691649  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
179 aa  228  5e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
182 aa  227  6e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
180 aa  227  6e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  60.23 
 
 
180 aa  227  7e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  58.43 
 
 
181 aa  227  9e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  60.8 
 
 
180 aa  226  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09880  LSU ribosomal protein L5P  59.09 
 
 
180 aa  226  2e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00169364  hitchhiker  0.0000180186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3326  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
179 aa  226  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000159394  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 
182 aa  226  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1172  ribosomal protein L5  58.43 
 
 
180 aa  226  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0444943  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 
179 aa  226  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
180 aa  225  3e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 
180 aa  224  4e-58  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  58.38 
 
 
185 aa  224  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 
180 aa  224  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 
180 aa  224  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 
180 aa  224  4e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  56.42 
 
 
179 aa  224  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 
180 aa  224  4e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  62.5 
 
 
180 aa  224  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
180 aa  224  6e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 
179 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3993  ribosomal protein L5  58.19 
 
 
223 aa  224  7e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13137  normal  0.956876 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 
179 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 
179 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 
179 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 
179 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4926  ribosomal protein L5  59.09 
 
 
179 aa  223  9e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000138257  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 
181 aa  223  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0364  50S ribosomal protein L5  61.99 
 
 
179 aa  223  1e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.731196  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  56.42 
 
 
179 aa  223  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 
180 aa  223  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2313  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
179 aa  223  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000920139  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 
179 aa  222  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  56.04 
 
 
186 aa  222  2e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0613  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 
179 aa  222  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554021  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1967  50S ribosomal protein L5  60.82 
 
 
179 aa  222  2e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 
179 aa  222  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 
179 aa  222  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23151  50S ribosomal protein L5  60.82 
 
 
179 aa  222  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2411  50S ribosomal protein L5  57.92 
 
 
195 aa  223  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000885731  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0193  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 
194 aa  221  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.368513  normal  0.701941 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  56.98 
 
 
179 aa  221  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 
179 aa  221  3e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 
179 aa  222  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 
180 aa  221  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 
180 aa  221  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 
180 aa  221  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3305  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 
180 aa  221  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000419375  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 
179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4737  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.498496 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  55.31 
 
 
179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  60.47 
 
 
179 aa  221  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0393  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
179 aa  221  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00978346  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0385  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
179 aa  221  6e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000000334346  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0339  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
180 aa  220  7e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0509  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
180 aa  220  7e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0543565  hitchhiker  0.000000000388642 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1842  50S ribosomal protein L5  58.72 
 
 
182 aa  220  7e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 
179 aa  221  7e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 
179 aa  221  7e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0720  50S ribosomal protein L5  56.57 
 
 
179 aa  220  7e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 
179 aa  220  8e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 
179 aa  220  8e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 
179 aa  220  8e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1839  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 
195 aa  220  9e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314483  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01290  ribosomal protein L5  60.47 
 
 
179 aa  220  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.388904  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 
179 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>