More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0713 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 184 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  72.73 
 
 		 179 aa  277  8e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  73.3 
 
 		 179 aa  276  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  72.73 
 
 		 179 aa  272  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  69.89 
 
 		 179 aa  271  5.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  70.45 
 
 		 179 aa  269  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  69.89 
 
 		 179 aa  267  8e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  69.32 
 
 		 179 aa  261  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  65.91 
 
 		 179 aa  260  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  68.75 
 
 		 220 aa  256  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4926  ribosomal protein L5  65.34 
 
 		 179 aa  255  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000138257  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 		 179 aa  252  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  65.54 
 
 		 179 aa  250  8.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 		 180 aa  250  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 		 180 aa  249  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 		 180 aa  249  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 		 180 aa  249  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  66.1 
 
 		 179 aa  250  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 180 aa  249  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  65.54 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  248  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  64.61 
 
 		 180 aa  248  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  247  8e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  63.48 
 
 		 179 aa  246  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  65.34 
 
 		 179 aa  246  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 180 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2312  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.237365  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 180 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0720  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  245  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  245  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  62.78 
 
 		 180 aa  245  3e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 179 aa  244  6e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  244  6.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4536  50S ribosomal protein L5  64.2 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322286  normal  0.125258 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  65.91 
 
 		 180 aa  243  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3983  ribosomal protein L5  66.1 
 
 		 184 aa  243  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 178 aa  242  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0638  ribosomal protein L5  64.2 
 
 		 179 aa  242  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000106157  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  63.33 
 
 		 180 aa  241  3e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0466  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.224995  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0496  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4737  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.498496 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0499  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228142  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 180 aa  241  5e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3305  50S ribosomal protein L5  62.92 
 
 		 180 aa  241  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000419375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5067  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 179 aa  241  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000562403  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0470  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  240  7e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3897  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  240  7e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000030586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3326  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000159394  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  59.12 
 
 		 192 aa  239  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3167  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000061863  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0339  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 180 aa  238  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3993  ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 223 aa  238  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13137  normal  0.956876 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0509  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 180 aa  238  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0543565  hitchhiker  0.000000000388642 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  62.78 
 
 		 180 aa  238  5e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1967  50S ribosomal protein L5  63.22 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 180 aa  237  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000918773  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  61.33 
 
 		 184 aa  237  8e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1273  ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 184 aa  237  9e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2245  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 179 aa  237  9e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00560978  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2938  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 180 aa  237  9e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000312511  hitchhiker  0.000000922003 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3285  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 180 aa  237  9e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000500711  hitchhiker  0.00000237864 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 182 aa  236  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  56.83 
 
 		 193 aa  236  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 183 aa  236  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  60.56 
 
 		 180 aa  236  1e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  61.11 
 
 		 180 aa  235  2e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  61.49 
 
 		 180 aa  235  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1173  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 180 aa  236  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00494805  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  62.78 
 
 		 180 aa  235  3e-61  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 181 aa  235  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  59.44 
 
 		 191 aa  234  4e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  59.44 
 
 		 180 aa  234  4e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0364  50S ribosomal protein L5  63.22 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.731196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  58.89 
 
 		 180 aa  234  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 182 aa  234  7e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0261  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  234  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00011988  hitchhiker  0.00419611 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  57.87 
 
 		 179 aa  233  9e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1117  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  233  9e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0062  ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145784  hitchhiker  1.96626e-17 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19911  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 181 aa  233  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>