More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1926 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1926  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 186 aa  375  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1627  ribosomal protein L5  65.19 
 
 		 191 aa  249  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0185  50S ribosomal protein L5  62.78 
 
 		 181 aa  238  4e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2944 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0614  ribosomal protein L5  64.17 
 
 		 188 aa  237  5.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0385  50S ribosomal protein L5  62.98 
 
 		 183 aa  238  5.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5775  ribosomal protein L5  62.3 
 
 		 184 aa  236  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0133386  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1159  50S ribosomal protein L5  63.54 
 
 		 183 aa  236  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000883476  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05780  ribosomal protein L5  61.88 
 
 		 183 aa  234  5.0000000000000005e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3150  50S ribosomal protein L5  63.39 
 
 		 184 aa  234  8e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4355  50S ribosomal protein L5  62.84 
 
 		 184 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000045958  normal  0.0455845 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  62.92 
 
 		 179 aa  231  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  62.92 
 
 		 179 aa  230  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  60 
 
 		 191 aa  226  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 179 aa  221  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1839  50S ribosomal protein L5  58.6 
 
 		 195 aa  219  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314483  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  217  7e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  217  7e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  217  7e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  217  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3993  ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 223 aa  217  8.999999999999998e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13137  normal  0.956876 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  217  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  215  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  57.38 
 
 		 183 aa  214  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  56.11 
 
 		 182 aa  214  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 180 aa  215  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3305  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 180 aa  214  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000419375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  215  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 179 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000918773  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 179 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  213  9e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  60.57 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1273  ribosomal protein L5  58.05 
 
 		 184 aa  212  1.9999999999999998e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 180 aa  212  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 180 aa  212  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 180 aa  212  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  55.56 
 
 		 182 aa  212  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 179 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 179 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 179 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 179 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2312  50S ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 179 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.237365  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 179 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 179 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2217  50S ribosomal protein L5  57.38 
 
 		 195 aa  211  4.9999999999999996e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286629  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  56.59 
 
 		 181 aa  211  4.9999999999999996e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  55.62 
 
 		 179 aa  211  5.999999999999999e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 184 aa  209  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0307  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 180 aa  210  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000563605  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  210  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  56.18 
 
 		 180 aa  210  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 180 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  56 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 180 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2052  50S ribosomal protein L5  55.74 
 
 		 196 aa  209  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000691649  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  54.19 
 
 		 180 aa  209  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0859  50S ribosomal protein L5  53.55 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246885  hitchhiker  0.001984 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0779  50S ribosomal protein L5  54.86 
 
 		 183 aa  208  3e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000663663  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  208  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  57.22 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  56 
 
 		 179 aa  208  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  208  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3326  50S ribosomal protein L5  55.62 
 
 		 179 aa  208  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000159394  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2411  50S ribosomal protein L5  56.28 
 
 		 195 aa  208  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000885731  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  55.75 
 
 		 180 aa  207  7e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 178 aa  207  7e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  54.55 
 
 		 179 aa  207  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  55.62 
 
 		 179 aa  207  7e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  207  7e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0613  50S ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 179 aa  207  8e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0487  50S ribosomal protein L5  55.06 
 
 		 179 aa  207  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0193  50S ribosomal protein L5  55 
 
 		 194 aa  207  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.368513  normal  0.701941 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 178 aa  206  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 		 179 aa  206  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  54.24 
 
 		 180 aa  206  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0613  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 181 aa  206  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.684436  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3167  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 		 180 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000061863  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1967  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  206  2e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0393  50S ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 179 aa  206  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00978346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0385  50S ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 179 aa  206  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000000334346  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0261  50S ribosomal protein L5  54.49 
 
 		 179 aa  205  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00011988  hitchhiker  0.00419611 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  53.07 
 
 		 220 aa  205  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3431  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00979614  normal  0.204364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2978  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 		 189 aa  205  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0364  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  204  4e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.731196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0779  50S ribosomal protein L5  56.18 
 
 		 179 aa  205  4e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000823313  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2827  50S ribosomal protein L5  53.93 
 
 		 179 aa  204  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000925898  normal  0.276949 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0326  50S ribosomal protein L5  53.93 
 
 		 179 aa  204  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000464858  decreased coverage  0.00283063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>