More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3150 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3150  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 184 aa  370  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4355  50S ribosomal protein L5  77.17 
 
 		 184 aa  298  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000045958  normal  0.0455845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5775  ribosomal protein L5  78.89 
 
 		 184 aa  296  9e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0133386  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1627  ribosomal protein L5  68.62 
 
 		 191 aa  271  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0185  50S ribosomal protein L5  66.85 
 
 		 181 aa  263  8.999999999999999e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2944 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0614  ribosomal protein L5  68.51 
 
 		 188 aa  254  7e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  65.14 
 
 		 179 aa  248  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0385  50S ribosomal protein L5  67.23 
 
 		 183 aa  246  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05780  ribosomal protein L5  66.48 
 
 		 183 aa  244  4e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1159  50S ribosomal protein L5  67.05 
 
 		 183 aa  244  6.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000883476  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  65.14 
 
 		 179 aa  243  8e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  65.14 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  65.14 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  65.14 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  64 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  65.14 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  64 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  64.2 
 
 		 180 aa  238  5e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  63.33 
 
 		 180 aa  235  2e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  63.89 
 
 		 180 aa  236  2e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 181 aa  235  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 180 aa  235  3e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 191 aa  234  7e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1926  50S ribosomal protein L5  63.39 
 
 		 186 aa  234  8e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 183 aa  232  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  61.33 
 
 		 182 aa  231  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 180 aa  228  5e-59  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0779  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 183 aa  226  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000663663  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  56.18 
 
 		 180 aa  226  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 179 aa  225  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  57.47 
 
 		 179 aa  224  7e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  58.33 
 
 		 180 aa  223  1e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0607  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 180 aa  222  2e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000230236  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 180 aa  222  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 180 aa  221  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  56.57 
 
 		 178 aa  221  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  53.98 
 
 		 193 aa  219  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  56 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 179 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 178 aa  219  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  56 
 
 		 179 aa  219  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  53.63 
 
 		 182 aa  218  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  56.57 
 
 		 184 aa  218  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3655  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 185 aa  218  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 178 aa  218  3e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2312  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 179 aa  218  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.237365  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 179 aa  219  3e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0771  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 186 aa  218  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542997  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 185 aa  218  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  53.14 
 
 		 180 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 179 aa  218  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2307  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 185 aa  218  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0101823  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  55.43 
 
 		 179 aa  218  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 179 aa  217  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 193 aa  217  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 179 aa  217  6e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0487  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  218  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1273  ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 184 aa  218  6e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  56 
 
 		 179 aa  217  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2052  50S ribosomal protein L5  55.43 
 
 		 196 aa  217  7e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000691649  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  217  7e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2217  50S ribosomal protein L5  56.57 
 
 		 195 aa  217  7e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286629  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  56.57 
 
 		 180 aa  217  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 193 aa  217  7.999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 179 aa  217  7.999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  55.43 
 
 		 179 aa  217  8.999999999999998e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  54.75 
 
 		 179 aa  217  8.999999999999998e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 179 aa  217  8.999999999999998e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01290  ribosomal protein L5  55.75 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.388904  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0335  ribosomal protein L5  56.57 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000680284  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4926  ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000138257  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1376  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 185 aa  216  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  55.06 
 
 		 185 aa  215  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  55.43 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  54.19 
 
 		 182 aa  216  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>