More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0568 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  100 
 
 		 243 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  87.43 
 
 		 197 aa  342  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  80.77 
 
 		 185 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  76.67 
 
 		 188 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  76.67 
 
 		 188 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  76.67 
 
 		 188 aa  304  7e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  76.67 
 
 		 188 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  76.67 
 
 		 188 aa  301  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  76.67 
 
 		 188 aa  301  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  75.27 
 
 		 185 aa  297  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  75.28 
 
 		 185 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  73.6 
 
 		 185 aa  288  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  73.6 
 
 		 185 aa  288  4e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1376  50S ribosomal protein L5  70.56 
 
 		 185 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3655  50S ribosomal protein L5  71.11 
 
 		 185 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3436  50S ribosomal protein L5  69.44 
 
 		 185 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160205  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3172  50S ribosomal protein L5  69.44 
 
 		 185 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  73.89 
 
 		 185 aa  282  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0710  50S ribosomal protein L5  72.32 
 
 		 185 aa  281  5.000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00257527  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2307  50S ribosomal protein L5  70 
 
 		 185 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0101823  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5058  50S ribosomal protein L5  69.44 
 
 		 185 aa  278  8e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  73.6 
 
 		 193 aa  275  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1557  50S ribosomal protein L5  67.78 
 
 		 185 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1442  50S ribosomal protein L5  73.63 
 
 		 185 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  69.1 
 
 		 185 aa  270  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  69.27 
 
 		 192 aa  270  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0373  50S ribosomal protein L5  67.6 
 
 		 186 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0998  50S ribosomal protein L5  72.78 
 
 		 185 aa  268  7e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0178085 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1727  50S ribosomal protein L5  67.6 
 
 		 186 aa  268  8e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1853  50S ribosomal protein L5  72.78 
 
 		 185 aa  267  8.999999999999999e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282205  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2522  50S ribosomal protein L5  68.72 
 
 		 186 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0771  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 186 aa  267  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542997  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1344  50S ribosomal protein L5  73.08 
 
 		 185 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000471517  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  69.66 
 
 		 193 aa  264  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  66.11 
 
 		 186 aa  255  5e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0297  50S ribosomal protein L5  64.09 
 
 		 187 aa  251  7e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 		 185 aa  249  3e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 179 aa  249  4e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  247  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2312  50S ribosomal protein L5  64.2 
 
 		 181 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000116558  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  65.34 
 
 		 179 aa  244  6e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000918773  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  244  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2312  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.237365  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2978  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 189 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0779  50S ribosomal protein L5  65.34 
 
 		 179 aa  242  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000823313  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  61.11 
 
 		 186 aa  242  5e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  241  6e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  241  9e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  240  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  240  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  240  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  240  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  61.02 
 
 		 179 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0266  50S ribosomal protein L5  61.33 
 
 		 187 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0642331  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 187 aa  238  5e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  238  8e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5058  ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 179 aa  238  9e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0491308  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  238  9e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 183 aa  238  9e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0062  ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 180 aa  237  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145784  hitchhiker  1.96626e-17 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  237  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3897  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  237  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000030586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0065  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 180 aa  237  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000146206  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  237  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3007  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 180 aa  236  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00431822  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  237  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3167  50S ribosomal protein L5  63.13 
 
 		 180 aa  236  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000061863  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0470  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 180 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0406  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 183 aa  236  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0381  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 183 aa  236  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3305  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 180 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000419375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 180 aa  236  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  236  3e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  61.02 
 
 		 179 aa  236  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  236  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>