More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2152 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 188 aa  390  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  98.4 
 
 		 188 aa  387  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  98.4 
 
 		 188 aa  387  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  92.02 
 
 		 188 aa  362  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  83.51 
 
 		 188 aa  335  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  81.91 
 
 		 188 aa  332  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  77.13 
 
 		 185 aa  308  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  76.67 
 
 		 243 aa  304  4.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  76.11 
 
 		 197 aa  298  4e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  72.13 
 
 		 185 aa  288  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  70.74 
 
 		 185 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  69.68 
 
 		 185 aa  281  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  69.68 
 
 		 185 aa  281  3.0000000000000004e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3172  50S ribosomal protein L5  67.02 
 
 		 185 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1376  50S ribosomal protein L5  65.96 
 
 		 185 aa  278  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3655  50S ribosomal protein L5  68.09 
 
 		 185 aa  278  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2307  50S ribosomal protein L5  67.55 
 
 		 185 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0101823  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3436  50S ribosomal protein L5  67.76 
 
 		 185 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160205  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1557  50S ribosomal protein L5  66.49 
 
 		 185 aa  276  9e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5058  50S ribosomal protein L5  66.49 
 
 		 185 aa  276  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1442  50S ribosomal protein L5  73.94 
 
 		 185 aa  275  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0998  50S ribosomal protein L5  73.22 
 
 		 185 aa  274  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0178085 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0710  50S ribosomal protein L5  68.54 
 
 		 185 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00257527  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1853  50S ribosomal protein L5  75 
 
 		 185 aa  271  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282205  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1344  50S ribosomal protein L5  72.34 
 
 		 185 aa  269  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000471517  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  68.72 
 
 		 185 aa  267  5.9999999999999995e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  67.74 
 
 		 185 aa  266  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  66.12 
 
 		 193 aa  264  5e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  63.89 
 
 		 192 aa  262  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  66.11 
 
 		 193 aa  258  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  68.57 
 
 		 185 aa  257  8e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2978  50S ribosomal protein L5  64.71 
 
 		 189 aa  252  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 186 aa  252  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0373  50S ribosomal protein L5  63.19 
 
 		 186 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1727  50S ribosomal protein L5  63.19 
 
 		 186 aa  251  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2522  50S ribosomal protein L5  64.29 
 
 		 186 aa  251  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0771  50S ribosomal protein L5  62.09 
 
 		 186 aa  251  6e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542997  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0779  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  248  5e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000823313  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0297  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 187 aa  246  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0266  50S ribosomal protein L5  60.54 
 
 		 187 aa  241  3.9999999999999997e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0642331  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  65.14 
 
 		 179 aa  240  9e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5058  ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0491308  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  59.67 
 
 		 187 aa  237  8e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0603  50S ribosomal protein L5  59.02 
 
 		 186 aa  236  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000918773  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  235  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  58.89 
 
 		 186 aa  235  3e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  59.89 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  61.67 
 
 		 183 aa  235  4e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  58.19 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04509  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 180 aa  234  7e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00526127  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  233  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  233  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  233  9e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  233  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  233  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  233  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3007  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00431822  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0331  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.86209e-22  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  60.57 
 
 		 193 aa  233  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0261  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00011988  hitchhiker  0.00419611 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3431  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 184 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00979614  normal  0.204364 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3167  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 180 aa  232  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000061863  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0326  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000464858  decreased coverage  0.00283063 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3632  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000391784  decreased coverage  0.00000000000159528 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2827  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000925898  normal  0.276949 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0768  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 180 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0251429  normal  0.0345896 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0332  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000492925  hitchhiker  0.000510256 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0487  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  231  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  231  5e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 179 aa  230  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0385  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  230  8.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000000334346  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0393  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  230  8.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00978346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3459  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  230  9e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000529438  decreased coverage  0.00459021 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0613  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  230  9e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0339  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  230  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000790094  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2747  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  230  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000000541719  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0360  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  230  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000501329  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3764  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0003555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>