More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1221 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 185 aa  380  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 185 aa  380  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  95.68 
 
 		 185 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  84.32 
 
 		 185 aa  332  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0710  50S ribosomal protein L5  79.46 
 
 		 185 aa  311  3.9999999999999997e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00257527  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0998  50S ribosomal protein L5  81.08 
 
 		 185 aa  298  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0178085 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  75.96 
 
 		 185 aa  295  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1442  50S ribosomal protein L5  79.46 
 
 		 185 aa  293  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1853  50S ribosomal protein L5  79.46 
 
 		 185 aa  291  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282205  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  71.35 
 
 		 185 aa  291  4e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1344  50S ribosomal protein L5  78.92 
 
 		 185 aa  289  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000471517  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  73.6 
 
 		 243 aa  289  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  74.72 
 
 		 197 aa  288  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  70.74 
 
 		 188 aa  287  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  69.68 
 
 		 188 aa  282  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  69.68 
 
 		 188 aa  281  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  69.15 
 
 		 188 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  69.15 
 
 		 188 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  69.68 
 
 		 188 aa  280  7.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3655  50S ribosomal protein L5  69.73 
 
 		 185 aa  277  8e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  72.16 
 
 		 185 aa  276  9e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2307  50S ribosomal protein L5  69.73 
 
 		 185 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0101823  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1376  50S ribosomal protein L5  68.11 
 
 		 185 aa  274  5e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  71.58 
 
 		 193 aa  274  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5058  50S ribosomal protein L5  69.19 
 
 		 185 aa  273  7e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3436  50S ribosomal protein L5  68.11 
 
 		 185 aa  272  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160205  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3172  50S ribosomal protein L5  67.03 
 
 		 185 aa  270  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2522  50S ribosomal protein L5  71.02 
 
 		 186 aa  270  9e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1727  50S ribosomal protein L5  70.45 
 
 		 186 aa  266  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1557  50S ribosomal protein L5  66.49 
 
 		 185 aa  266  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0373  50S ribosomal protein L5  70.45 
 
 		 186 aa  266  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0771  50S ribosomal protein L5  67.96 
 
 		 186 aa  266  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542997  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  69.32 
 
 		 192 aa  265  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0266  50S ribosomal protein L5  67.03 
 
 		 187 aa  260  8e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0642331  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  67.6 
 
 		 193 aa  258  3e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0297  50S ribosomal protein L5  66.1 
 
 		 187 aa  256  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  69.44 
 
 		 186 aa  254  7e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4536  50S ribosomal protein L5  64.8 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322286  normal  0.125258 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3897  50S ribosomal protein L5  64.8 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000030586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  64.8 
 
 		 179 aa  245  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0638  ribosomal protein L5  64.8 
 
 		 179 aa  244  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000106157  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 193 aa  244  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5067  50S ribosomal protein L5  64.25 
 
 		 179 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000562403  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2312  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 		 179 aa  243  8e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.237365  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  64.25 
 
 		 179 aa  243  8e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0603  50S ribosomal protein L5  64.64 
 
 		 186 aa  243  9e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697001  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0466  50S ribosomal protein L5  63.69 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.224995  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  63.69 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0499  50S ribosomal protein L5  63.69 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228142  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0496  50S ribosomal protein L5  63.69 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  242  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4737  50S ribosomal protein L5  63.13 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.498496 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  60.54 
 
 		 186 aa  241  5e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0406  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 183 aa  239  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0381  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 183 aa  239  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2978  50S ribosomal protein L5  62.64 
 
 		 189 aa  238  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  61.33 
 
 		 193 aa  237  5.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  59.22 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 183 aa  236  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  61.2 
 
 		 185 aa  236  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  234  8e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 180 aa  233  9e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 187 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  61.63 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3989  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0243679  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000918773  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3810  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000450853  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  61.88 
 
 		 192 aa  232  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0470  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 		 178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  61.63 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0335  ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000680284  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  57.54 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1334  50S ribosomal protein L5  61.41 
 
 		 188 aa  232  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000410283  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  61.88 
 
 		 187 aa  231  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  231  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  231  5e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  231  5e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>