More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0603 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0603  50S ribosomal protein L5  100 
 
 
186 aa  383  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697001  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0297  50S ribosomal protein L5  81.28 
 
 
187 aa  322  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0771  50S ribosomal protein L5  77.01 
 
 
186 aa  298  4e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542997  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0266  50S ribosomal protein L5  75.4 
 
 
187 aa  296  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0642331  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0373  50S ribosomal protein L5  75.68 
 
 
186 aa  293  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1727  50S ribosomal protein L5  75.14 
 
 
186 aa  292  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2522  50S ribosomal protein L5  71.89 
 
 
186 aa  281  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  67.74 
 
 
186 aa  260  8.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  65.05 
 
 
185 aa  250  6e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  62.01 
 
 
188 aa  245  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 
188 aa  244  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  63.74 
 
 
185 aa  244  6e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  64.64 
 
 
185 aa  243  9e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  64.64 
 
 
185 aa  243  9e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  61.88 
 
 
185 aa  242  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  59.67 
 
 
185 aa  240  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  62.98 
 
 
185 aa  239  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  60.77 
 
 
243 aa  236  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  59.02 
 
 
188 aa  236  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  59.56 
 
 
188 aa  236  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  61.67 
 
 
197 aa  235  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  58.47 
 
 
188 aa  234  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  58.47 
 
 
188 aa  234  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0710  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 
185 aa  234  4e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00257527  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1853  50S ribosomal protein L5  63.69 
 
 
185 aa  234  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282205  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0998  50S ribosomal protein L5  64.8 
 
 
185 aa  234  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0178085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5058  50S ribosomal protein L5  58.92 
 
 
185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1376  50S ribosomal protein L5  56.76 
 
 
185 aa  232  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1442  50S ribosomal protein L5  62.43 
 
 
185 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  61.67 
 
 
192 aa  232  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1344  50S ribosomal protein L5  62.98 
 
 
185 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000471517  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2307  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 
185 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0101823  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  61.67 
 
 
193 aa  230  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3655  50S ribosomal protein L5  56.76 
 
 
185 aa  228  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  59.67 
 
 
193 aa  228  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3436  50S ribosomal protein L5  56.76 
 
 
185 aa  226  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160205  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 
179 aa  224  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  58.56 
 
 
183 aa  223  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3172  50S ribosomal protein L5  54.59 
 
 
185 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 
179 aa  222  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 
179 aa  222  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1557  50S ribosomal protein L5  54.59 
 
 
185 aa  222  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 
179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2978  50S ribosomal protein L5  59.12 
 
 
189 aa  219  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 
179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 
179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 
179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 
179 aa  218  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 
179 aa  218  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 
179 aa  218  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 
179 aa  218  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 
179 aa  218  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 
179 aa  217  7.999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  58.66 
 
 
186 aa  216  1e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 
185 aa  216  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  55.68 
 
 
179 aa  216  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 
179 aa  216  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 
178 aa  215  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 
179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  56.25 
 
 
179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 
178 aa  214  4e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1159  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 
183 aa  214  7e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000883476  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
179 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 
179 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 
179 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 
180 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 
179 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 
179 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  56 
 
 
179 aa  212  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 
179 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0385  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 
183 aa  212  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 
179 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 
179 aa  212  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 
179 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 
179 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 
179 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  53.41 
 
 
179 aa  210  9e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 
179 aa  209  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  52.41 
 
 
187 aa  209  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 
179 aa  209  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 
179 aa  210  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  54.55 
 
 
179 aa  209  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  54.55 
 
 
179 aa  209  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 
180 aa  209  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  53.41 
 
 
179 aa  209  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 
179 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 
179 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 
179 aa  208  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 
179 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 
179 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 
179 aa  208  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000918773  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  54.49 
 
 
180 aa  208  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0779  50S ribosomal protein L5  54.14 
 
 
183 aa  207  5e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000663663  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5058  ribosomal protein L5  57.39 
 
 
179 aa  207  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0491308  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3937  50S ribosomal protein L5  55.25 
 
 
183 aa  207  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  56.5 
 
 
180 aa  207  7e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  53.98 
 
 
179 aa  207  8e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  52.84 
 
 
179 aa  207  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>