More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0277 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0277  50S ribosomal protein L5  100 
 
 
187 aa  376  1e-103  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356643  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  72.04 
 
 
187 aa  282  2.0000000000000002e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  66.1 
 
 
183 aa  245  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
179 aa  235  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
179 aa  236  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0406  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 
183 aa  235  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0381  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 
183 aa  235  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  60.23 
 
 
179 aa  235  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  59.43 
 
 
193 aa  234  5.0000000000000005e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 
179 aa  234  6e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 
180 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 
179 aa  230  9e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
179 aa  230  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
179 aa  230  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
179 aa  229  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
179 aa  229  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
179 aa  229  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  64 
 
 
179 aa  229  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
179 aa  229  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
179 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
179 aa  228  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 
179 aa  228  4e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 
179 aa  227  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 
179 aa  227  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
179 aa  226  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  56.5 
 
 
180 aa  226  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
188 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 
180 aa  226  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1842  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 
182 aa  225  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
180 aa  225  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0349  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 
182 aa  225  3e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000265195  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 
179 aa  224  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 
179 aa  224  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  58.52 
 
 
179 aa  224  6e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 
179 aa  224  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 
179 aa  224  6e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  58.52 
 
 
179 aa  224  7e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 
179 aa  223  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 
179 aa  223  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  59.2 
 
 
191 aa  223  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 
180 aa  223  1e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  57.95 
 
 
197 aa  223  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  61.71 
 
 
185 aa  223  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
188 aa  222  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 
179 aa  222  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  61.49 
 
 
180 aa  222  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  56.82 
 
 
243 aa  222  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
179 aa  221  3e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  54.86 
 
 
179 aa  221  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 
179 aa  221  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 
179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000918773  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  58.76 
 
 
180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 
178 aa  221  4.9999999999999996e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  57.95 
 
 
179 aa  221  6e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  57.8 
 
 
180 aa  220  9e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 
193 aa  219  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 
179 aa  219  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 
179 aa  219  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 
179 aa  220  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 
188 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 
188 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 
179 aa  219  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0779  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 
179 aa  220  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000823313  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  53.93 
 
 
180 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 
179 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 
179 aa  219  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  53.93 
 
 
180 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  58.96 
 
 
180 aa  220  9.999999999999999e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 
179 aa  219  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 
185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  56.32 
 
 
193 aa  219  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  55.75 
 
 
192 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 
179 aa  219  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 
179 aa  219  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 
179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  54.59 
 
 
192 aa  218  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0613  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 
181 aa  218  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.684436  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 
180 aa  218  5e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  56.25 
 
 
179 aa  218  5e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3167  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
180 aa  218  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000061863  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 
189 aa  217  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  54.59 
 
 
187 aa  217  7.999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2607  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 
182 aa  217  7.999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000613532  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 
180 aa  217  8.999999999999998e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 
179 aa  216  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 
179 aa  216  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0710  50S ribosomal protein L5  57.46 
 
 
185 aa  216  1e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00257527  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 
179 aa  216  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  58.62 
 
 
179 aa  216  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 
179 aa  216  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 
179 aa  216  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 
179 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 
180 aa  215  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 
179 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 
179 aa  216  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 
179 aa  216  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0261  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
179 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00011988  hitchhiker  0.00419611 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  56.82 
 
 
179 aa  216  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>