More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2231 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2231  ribosomal protein L5  100 
 
 
179 aa  363  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0223  ribosomal protein L5  87.71 
 
 
179 aa  319  9.999999999999999e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2436  50S ribosomal protein L5P  73.14 
 
 
174 aa  263  7e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1841  50S ribosomal protein L5P  73.56 
 
 
175 aa  263  1e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2305  50S ribosomal protein L5P  68.97 
 
 
176 aa  256  1e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0014  50S ribosomal protein L5P  56.36 
 
 
169 aa  191  5e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  5.43993e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0097  50S ribosomal protein L5P  56.1 
 
 
169 aa  191  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000268421  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0455  50S ribosomal protein L5P  50.3 
 
 
165 aa  179  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0122847  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0577  50S ribosomal protein L5P  50.61 
 
 
167 aa  176  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111203  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0545  50S ribosomal protein L5P  49.39 
 
 
165 aa  174  5e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  0.364222 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1397  50S ribosomal protein L5P  46.11 
 
 
181 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1715  50S ribosomal protein L5P  50.91 
 
 
169 aa  170  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0194222  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0723  50S ribosomal protein L5P  47.19 
 
 
181 aa  168  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.305719  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2240  50S ribosomal protein L5P  50 
 
 
168 aa  166  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000418435  normal  0.360377 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0657  50S ribosomal protein L5P  46.07 
 
 
181 aa  166  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15981  decreased coverage  0.0000704942 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1261  50S ribosomal protein L5P  46.63 
 
 
181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0207186  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0166  50S ribosomal protein L5P  45.51 
 
 
181 aa  164  8e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000530308  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0104  50S ribosomal protein L5P  46.34 
 
 
174 aa  155  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000310804  unclonable  0.000000485545 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0242  50S ribosomal protein L5P  46.39 
 
 
182 aa  154  4e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0094  50S ribosomal protein L5P  44.97 
 
 
171 aa  154  8e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.496979 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1765  ribosomal protein L5  43.71 
 
 
179 aa  153  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.553857  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0907  50S ribosomal protein L5P  45.51 
 
 
179 aa  150  7e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.46697  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2221  50S ribosomal protein L5P  44.91 
 
 
179 aa  149  3e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.183607  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0764  50S ribosomal protein L5P  44.91 
 
 
179 aa  144  9e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.296859  normal  0.0880431 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1508  ribosomal protein L5  41.42 
 
 
178 aa  142  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.2694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2000  50S ribosomal protein L5P  43.11 
 
 
178 aa  141  5e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0797  50S ribosomal protein L5P  38.41 
 
 
173 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.268265 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04475  60S ribosomal protein L11 (Broad)  37.79 
 
 
175 aa  131  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.147456 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1831  50S ribosomal protein L5P  39.39 
 
 
197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03370  60s ribosomal protein l11, putative  38.37 
 
 
175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0821316  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23324  predicted protein  37.71 
 
 
176 aa  125  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30777  Ribosomal protein L11, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  38.27 
 
 
177 aa  124  8.000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.131413 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72706  predicted protein  37.2 
 
 
174 aa  105  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  39.86 
 
 
179 aa  101  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 
187 aa  100  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  39.86 
 
 
179 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  41.79 
 
 
185 aa  99.4  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  41.98 
 
 
179 aa  99  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  41.98 
 
 
179 aa  98.2  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1848  ribosomal protein L5  38.93 
 
 
187 aa  98.2  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.21039e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  41.04 
 
 
185 aa  97.1  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  38.81 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  38.97 
 
 
179 aa  96.7  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0971  50S ribosomal protein L5  38.64 
 
 
154 aa  96.7  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000280468  hitchhiker  0.00000101885 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  38.81 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  39.06 
 
 
185 aa  96.3  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  39.39 
 
 
179 aa  96.7  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1842  50S ribosomal protein L5  37.12 
 
 
182 aa  95.5  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  41.22 
 
 
179 aa  95.1  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0349  50S ribosomal protein L5  37.12 
 
 
182 aa  95.5  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000265195  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 
179 aa  95.1  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0710  50S ribosomal protein L5  38.41 
 
 
185 aa  95.1  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00257527  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0669  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 
177 aa  94.7  6e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.29336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  40.46 
 
 
184 aa  94.7  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  38.64 
 
 
179 aa  94.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01290  ribosomal protein L5  42.42 
 
 
179 aa  94.4  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.388904  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  38.64 
 
 
179 aa  94.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  38.64 
 
 
179 aa  94.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  38.64 
 
 
179 aa  94.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  38.64 
 
 
179 aa  94.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  39.39 
 
 
179 aa  94.4  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  36.76 
 
 
186 aa  94  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  38.17 
 
 
179 aa  93.6  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0613  50S ribosomal protein L5  37.88 
 
 
181 aa  93.6  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.684436  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  37.88 
 
 
179 aa  93.6  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  40.46 
 
 
179 aa  93.6  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  38.17 
 
 
179 aa  93.6  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  37.88 
 
 
179 aa  93.6  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  37.88 
 
 
179 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  40.15 
 
 
179 aa  94  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  38.64 
 
 
179 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  39.01 
 
 
185 aa  93.6  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  38.17 
 
 
179 aa  93.6  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 
179 aa  93.6  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0466  50S ribosomal protein L5  37.88 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.224995  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  37.12 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0638  ribosomal protein L5  38.17 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000106157  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  35.34 
 
 
185 aa  93.2  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0496  50S ribosomal protein L5  37.88 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116294  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  38.17 
 
 
179 aa  93.2  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1967  50S ribosomal protein L5  39.55 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  38.24 
 
 
180 aa  92.8  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3810  50S ribosomal protein L5  39.39 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000450853  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  37.68 
 
 
180 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3989  50S ribosomal protein L5  39.39 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0243679  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  37.68 
 
 
180 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  37.68 
 
 
180 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0499  50S ribosomal protein L5  37.88 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228142  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4536  50S ribosomal protein L5  37.88 
 
 
179 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322286  normal  0.125258 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  39.85 
 
 
184 aa  92.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  37.12 
 
 
179 aa  92.4  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  35.88 
 
 
179 aa  92  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  35.88 
 
 
179 aa  92  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 
179 aa  92  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0096  50S ribosomal protein L5  33.83 
 
 
181 aa  92  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.428124  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  36.5 
 
 
192 aa  92  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  37.12 
 
 
179 aa  92  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0277  50S ribosomal protein L5  37.12 
 
 
187 aa  92  4e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356643  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0406  50S ribosomal protein L5  37.4 
 
 
183 aa  91.7  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0381  50S ribosomal protein L5  37.4 
 
 
183 aa  91.7  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>