More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0014 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0014  50S ribosomal protein L5P  100 
 
 		 169 aa  345  2e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  5.43993e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0097  50S ribosomal protein L5P  73.81 
 
 		 169 aa  266  7e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000268421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0545  50S ribosomal protein L5P  62.8 
 
 		 165 aa  218  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  0.364222 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0455  50S ribosomal protein L5P  59.39 
 
 		 165 aa  216  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0122847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2240  50S ribosomal protein L5P  60.48 
 
 		 168 aa  213  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000418435  normal  0.360377 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0577  50S ribosomal protein L5P  58.54 
 
 		 167 aa  204  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111203  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2436  50S ribosomal protein L5P  55.69 
 
 		 174 aa  197  7.999999999999999e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2305  50S ribosomal protein L5P  56.71 
 
 		 176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2231  ribosomal protein L5  56.36 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1715  50S ribosomal protein L5P  59.63 
 
 		 169 aa  189  2e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0194222  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0223  ribosomal protein L5  56.1 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1841  50S ribosomal protein L5P  53.66 
 
 		 175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0094  50S ribosomal protein L5P  51.19 
 
 		 171 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.496979 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1765  ribosomal protein L5  49.1 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.553857  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0723  50S ribosomal protein L5P  48.81 
 
 		 181 aa  170  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.305719  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1397  50S ribosomal protein L5P  47.65 
 
 		 181 aa  168  4e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1508  ribosomal protein L5  46.15 
 
 		 178 aa  168  4e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.2694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0242  50S ribosomal protein L5P  47.9 
 
 		 182 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0657  50S ribosomal protein L5P  47.62 
 
 		 181 aa  164  8e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15981  decreased coverage  0.0000704942 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1261  50S ribosomal protein L5P  47.62 
 
 		 181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0207186  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0166  50S ribosomal protein L5P  45.83 
 
 		 181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000530308  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0104  50S ribosomal protein L5P  44.91 
 
 		 174 aa  161  5.0000000000000005e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000310804  unclonable  0.000000485545 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03370  60s ribosomal protein l11, putative  45.68 
 
 		 175 aa  148  3e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0821316  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23324  predicted protein  46.01 
 
 		 176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04475  60S ribosomal protein L11 (Broad)  44.79 
 
 		 175 aa  145  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.147456 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1831  50S ribosomal protein L5P  42.77 
 
 		 197 aa  144  6e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2221  50S ribosomal protein L5P  42.26 
 
 		 179 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.183607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0907  50S ribosomal protein L5P  42.51 
 
 		 179 aa  137  1e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.46697  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0764  50S ribosomal protein L5P  43.71 
 
 		 179 aa  136  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.296859  normal  0.0880431 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2000  50S ribosomal protein L5P  42.26 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30777  Ribosomal protein L11, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  41.72 
 
 		 177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131413 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72706  predicted protein  44.31 
 
 		 174 aa  130  9e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0797  50S ribosomal protein L5P  40.36 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.268265 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  36.36 
 
 		 188 aa  94  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  36.36 
 
 		 188 aa  94  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  36.6 
 
 		 188 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23151  50S ribosomal protein L5  39.86 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  37.66 
 
 		 185 aa  92.4  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0421  50S ribosomal protein L5  40.15 
 
 		 177 aa  92.4  3e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.889596  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0600  50S ribosomal protein L5  39.42 
 
 		 177 aa  92  4e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0797735  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  41.79 
 
 		 180 aa  91.3  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  39.85 
 
 		 179 aa  91.3  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  35.29 
 
 		 188 aa  91.3  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5067  50S ribosomal protein L5  40.74 
 
 		 179 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000562403  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  35.48 
 
 		 179 aa  91.3  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0859  50S ribosomal protein L5  33.54 
 
 		 185 aa  90.9  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246885  hitchhiker  0.001984 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  36.76 
 
 		 180 aa  90.9  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  39.85 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  40 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4536  50S ribosomal protein L5  40 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322286  normal  0.125258 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1848  ribosomal protein L5  36.03 
 
 		 187 aa  90.1  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.21039e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  35.67 
 
 		 179 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  40.46 
 
 		 179 aa  89.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0710  50S ribosomal protein L5  38.06 
 
 		 185 aa  89.4  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00257527  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  40.46 
 
 		 179 aa  89.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 179 aa  89.4  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  41.35 
 
 		 187 aa  89.4  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0638  ribosomal protein L5  40 
 
 		 179 aa  89  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000106157  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  39.55 
 
 		 179 aa  89  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  38.52 
 
 		 188 aa  89  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  39.26 
 
 		 179 aa  88.6  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  39.26 
 
 		 179 aa  88.6  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  38.69 
 
 		 179 aa  88.6  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  37.31 
 
 		 188 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  38.52 
 
 		 179 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_002978  WD0669  50S ribosomal protein L5  34.62 
 
 		 177 aa  88.2  5e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.29336  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  38.06 
 
 		 180 aa  88.2  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  38.06 
 
 		 179 aa  88.2  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3897  50S ribosomal protein L5  39.26 
 
 		 179 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000030586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  39.55 
 
 		 179 aa  88.2  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  37.78 
 
 		 179 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  41.04 
 
 		 179 aa  87.8  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  37.23 
 
 		 179 aa  87.4  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0364  50S ribosomal protein L5  38.24 
 
 		 179 aa  87.4  9e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.731196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  39.69 
 
 		 179 aa  87.4  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1956  ribosomal protein L5  35.29 
 
 		 181 aa  87.4  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0466  50S ribosomal protein L5  38.52 
 
 		 179 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.224995  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5058  50S ribosomal protein L5  35.56 
 
 		 185 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  36.57 
 
 		 179 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2166  ribosomal protein L5  37.86 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0499  50S ribosomal protein L5  38.52 
 
 		 179 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228142  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  36.57 
 
 		 179 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3655  50S ribosomal protein L5  37.04 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1967  50S ribosomal protein L5  37.5 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4737  50S ribosomal protein L5  39.26 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.498496 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  37.59 
 
 		 193 aa  86.7  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  39.69 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  39.69 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  39.69 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  39.69 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  39.69 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  38.17 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0496  50S ribosomal protein L5  38.52 
 
 		 179 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  39.53 
 
 		 181 aa  85.9  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  35.37 
 
 		 180 aa  86.7  2e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  36.57 
 
 		 179 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0684  50S ribosomal protein L5  35.07 
 
 		 180 aa  86.3  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  38.06 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  38.97 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  37.23 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>