More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0545 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0545  50S ribosomal protein L5P  100 
 
 		 165 aa  336  7e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  0.364222 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0455  50S ribosomal protein L5P  72.5 
 
 		 165 aa  249  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0122847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0577  50S ribosomal protein L5P  67.07 
 
 		 167 aa  238  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111203  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2240  50S ribosomal protein L5P  65.85 
 
 		 168 aa  226  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000418435  normal  0.360377 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0014  50S ribosomal protein L5P  62.8 
 
 		 169 aa  218  3e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  5.43993e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0097  50S ribosomal protein L5P  59.76 
 
 		 169 aa  207  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000268421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0094  50S ribosomal protein L5P  55.09 
 
 		 171 aa  189  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.496979 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1715  50S ribosomal protein L5P  57.86 
 
 		 169 aa  187  7e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0194222  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1397  50S ribosomal protein L5P  50.9 
 
 		 181 aa  176  9e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0223  ribosomal protein L5  49.39 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2305  50S ribosomal protein L5P  48.17 
 
 		 176 aa  176  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1508  ribosomal protein L5  49.09 
 
 		 178 aa  175  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.2694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2436  50S ribosomal protein L5P  49.39 
 
 		 174 aa  174  4e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2231  ribosomal protein L5  49.39 
 
 		 179 aa  174  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0723  50S ribosomal protein L5P  47.9 
 
 		 181 aa  174  5e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.305719  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1841  50S ribosomal protein L5P  46.95 
 
 		 175 aa  170  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1765  ribosomal protein L5  48.17 
 
 		 179 aa  167  6e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.553857  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0657  50S ribosomal protein L5P  45.51 
 
 		 181 aa  167  8e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15981  decreased coverage  0.0000704942 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1261  50S ribosomal protein L5P  45.51 
 
 		 181 aa  167  8e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0207186  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0166  50S ribosomal protein L5P  43.71 
 
 		 181 aa  166  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000530308  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0104  50S ribosomal protein L5P  48.17 
 
 		 174 aa  166  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000310804  unclonable  0.000000485545 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0242  50S ribosomal protein L5P  46.95 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0907  50S ribosomal protein L5P  43.9 
 
 		 179 aa  138  3e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.46697  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2221  50S ribosomal protein L5P  43.9 
 
 		 179 aa  135  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.183607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2000  50S ribosomal protein L5P  43.9 
 
 		 178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03370  60s ribosomal protein l11, putative  39.38 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0821316  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0764  50S ribosomal protein L5P  44.51 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.296859  normal  0.0880431 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30777  Ribosomal protein L11, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  39.75 
 
 		 177 aa  130  9e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131413 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1831  50S ribosomal protein L5P  41.46 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23324  predicted protein  35.62 
 
 		 176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72706  predicted protein  40.85 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04475  60S ribosomal protein L11 (Broad)  34.55 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.147456 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0797  50S ribosomal protein L5P  39.02 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.268265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2978  50S ribosomal protein L5  38.76 
 
 		 189 aa  84.7  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  39.06 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0307  50S ribosomal protein L5  35.38 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000563605  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  37.01 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1304  50S ribosomal protein L5  36.05 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240969  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1382  50S ribosomal protein L5  36.05 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00212588  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0669  50S ribosomal protein L5  37.6 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.29336  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  38.4 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  38.71 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  39.52 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  36.36 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  39.37 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  35.88 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  35.94 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  38.71 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  35.88 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  38.58 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0684  50S ribosomal protein L5  37.01 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  35.88 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  35.88 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  35.88 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  35.88 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  37.1 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0406  50S ribosomal protein L5  33.99 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0381  50S ribosomal protein L5  33.99 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1842  50S ribosomal protein L5  37.01 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  36.22 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  35.43 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0421  50S ribosomal protein L5  37.8 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.889596  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  37.3 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3172  50S ribosomal protein L5  35.94 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  34.09 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  37.9 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  34.93 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0349  50S ribosomal protein L5  37.01 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000265195  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  36.8 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0613  50S ribosomal protein L5  38.1 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.684436  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0600  50S ribosomal protein L5  37.01 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0797735  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  36.51 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  33.56 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  37.9 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  35.88 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  34.09 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  37.9 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  36.22 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  35.48 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  35.88 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  35.43 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  37.1 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  36.29 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  36.29 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  36.29 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  34.09 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  36.29 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  37.9 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1848  ribosomal protein L5  30.82 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.21039e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  36.51 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  37.4 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  35.16 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  37.01 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5058  50S ribosomal protein L5  34.38 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  38.28 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  34.09 
 
 		 179 aa  77  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3436  50S ribosomal protein L5  34.38 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160205  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  35.94 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  36.22 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1557  50S ribosomal protein L5  33.59 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>