More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0577 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0577  50S ribosomal protein L5P  100 
 
 		 167 aa  342  1e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111203  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0545  50S ribosomal protein L5P  67.07 
 
 		 165 aa  238  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  0.364222 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0455  50S ribosomal protein L5P  67.92 
 
 		 165 aa  231  5e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0122847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2240  50S ribosomal protein L5P  56.89 
 
 		 168 aa  208  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000418435  normal  0.360377 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0014  50S ribosomal protein L5P  58.54 
 
 		 169 aa  204  3e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  5.43993e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0097  50S ribosomal protein L5P  56.63 
 
 		 169 aa  204  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000268421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0094  50S ribosomal protein L5P  54.12 
 
 		 171 aa  188  4e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.496979 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2305  50S ribosomal protein L5P  51.83 
 
 		 176 aa  178  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2436  50S ribosomal protein L5P  50.61 
 
 		 174 aa  178  4e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2231  ribosomal protein L5  50.61 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0223  ribosomal protein L5  51.22 
 
 		 179 aa  174  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1715  50S ribosomal protein L5P  57.23 
 
 		 169 aa  170  7.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0194222  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1397  50S ribosomal protein L5P  51.85 
 
 		 181 aa  169  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0723  50S ribosomal protein L5P  50.3 
 
 		 181 aa  170  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.305719  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1261  50S ribosomal protein L5P  50.9 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0207186  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1508  ribosomal protein L5  49.7 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.2694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0657  50S ribosomal protein L5P  49.7 
 
 		 181 aa  168  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15981  decreased coverage  0.0000704942 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1765  ribosomal protein L5  50.61 
 
 		 179 aa  167  4e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.553857  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1841  50S ribosomal protein L5P  48.78 
 
 		 175 aa  168  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0104  50S ribosomal protein L5P  48.17 
 
 		 174 aa  165  2.9999999999999998e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000310804  unclonable  0.000000485545 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0166  50S ribosomal protein L5P  47.9 
 
 		 181 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000530308  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0907  50S ribosomal protein L5P  50 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.46697  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0242  50S ribosomal protein L5P  46.34 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2221  50S ribosomal protein L5P  48.78 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.183607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2000  50S ribosomal protein L5P  48.78 
 
 		 178 aa  149  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0764  50S ribosomal protein L5P  49.39 
 
 		 179 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.296859  normal  0.0880431 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23324  predicted protein  41.36 
 
 		 176 aa  134  5e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1831  50S ribosomal protein L5P  43.67 
 
 		 197 aa  131  5e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30777  Ribosomal protein L11, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  40.99 
 
 		 177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131413 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03370  60s ribosomal protein l11, putative  41.25 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0821316  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72706  predicted protein  42.17 
 
 		 174 aa  120  9e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0797  50S ribosomal protein L5P  37.95 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.268265 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04475  60S ribosomal protein L11 (Broad)  36.88 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.147456 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0406  50S ribosomal protein L5  41.72 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0381  50S ribosomal protein L5  41.72 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0669  50S ribosomal protein L5  37.5 
 
 		 177 aa  95.1  4e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.29336  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  41.33 
 
 		 188 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  36.3 
 
 		 179 aa  94.7  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  40.67 
 
 		 188 aa  94.4  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  40 
 
 		 188 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  45.97 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  44.88 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  40 
 
 		 185 aa  92.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  44.09 
 
 		 188 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  44.09 
 
 		 188 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0349  50S ribosomal protein L5  38.89 
 
 		 182 aa  91.7  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000265195  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1842  50S ribosomal protein L5  38.89 
 
 		 182 aa  91.7  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  40.41 
 
 		 179 aa  91.3  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1382  50S ribosomal protein L5  38.19 
 
 		 184 aa  91.3  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00212588  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1304  50S ribosomal protein L5  38.19 
 
 		 193 aa  91.3  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240969  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  42.52 
 
 		 193 aa  90.5  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  40.94 
 
 		 185 aa  90.1  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  42 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  42.67 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0600  50S ribosomal protein L5  40.16 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0797735  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0421  50S ribosomal protein L5  40.94 
 
 		 177 aa  89.7  2e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.889596  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  42 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  36.91 
 
 		 185 aa  89.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  42.4 
 
 		 180 aa  89  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3172  50S ribosomal protein L5  37.58 
 
 		 185 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  37.67 
 
 		 185 aa  89  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2978  50S ribosomal protein L5  38.51 
 
 		 189 aa  88.2  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  43.31 
 
 		 179 aa  88.2  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  39.63 
 
 		 193 aa  88.2  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0710  50S ribosomal protein L5  38.78 
 
 		 185 aa  87.8  6e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00257527  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2307  50S ribosomal protein L5  42.86 
 
 		 185 aa  87.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0101823  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3655  50S ribosomal protein L5  42.86 
 
 		 185 aa  87.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  38.19 
 
 		 179 aa  86.7  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0096  50S ribosomal protein L5  34.93 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.428124  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1848  ribosomal protein L5  35.62 
 
 		 187 aa  86.7  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.21039e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  41.35 
 
 		 192 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  38.17 
 
 		 179 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  36.3 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  34.93 
 
 		 179 aa  85.5  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0071  50S ribosomal protein L5  35.37 
 
 		 181 aa  85.5  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0205797  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1562  ribosomal protein L5  34.25 
 
 		 180 aa  85.5  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00268047  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  36.3 
 
 		 179 aa  85.5  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0470  50S ribosomal protein L5  35.43 
 
 		 179 aa  85.5  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  35.62 
 
 		 185 aa  85.5  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  36.3 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  36.5 
 
 		 180 aa  85.1  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  36.99 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  39.68 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  36.3 
 
 		 179 aa  84.7  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  36.22 
 
 		 179 aa  84.7  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  37.58 
 
 		 243 aa  84.7  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2069  50S ribosomal protein L5  35.62 
 
 		 181 aa  84.3  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  36.3 
 
 		 179 aa  84.3  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  40.32 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  40.32 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  40.32 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  37.58 
 
 		 197 aa  84.7  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5058  50S ribosomal protein L5  38.89 
 
 		 185 aa  84.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 179 aa  84.3  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01290  ribosomal protein L5  34.9 
 
 		 179 aa  84.3  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.388904  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  35.62 
 
 		 179 aa  84.3  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  40.48 
 
 		 186 aa  84.3  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0965  50S ribosomal protein L5  37.41 
 
 		 182 aa  84.3  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.190105  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1376  50S ribosomal protein L5  40.94 
 
 		 185 aa  84  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  34.9 
 
 		 180 aa  84.3  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>