More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0455 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0455  50S ribosomal protein L5P  100 
 
 		 165 aa  340  8e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0122847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0545  50S ribosomal protein L5P  72.5 
 
 		 165 aa  249  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  0.364222 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0577  50S ribosomal protein L5P  67.92 
 
 		 167 aa  231  5e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111203  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2240  50S ribosomal protein L5P  64.6 
 
 		 168 aa  228  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000418435  normal  0.360377 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0014  50S ribosomal protein L5P  59.39 
 
 		 169 aa  216  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  5.43993e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0097  50S ribosomal protein L5P  59.15 
 
 		 169 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000268421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0094  50S ribosomal protein L5P  54.76 
 
 		 171 aa  191  4e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.496979 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1715  50S ribosomal protein L5P  57.14 
 
 		 169 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0194222  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2305  50S ribosomal protein L5P  51.83 
 
 		 176 aa  187  5.999999999999999e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1841  50S ribosomal protein L5P  52.44 
 
 		 175 aa  184  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2231  ribosomal protein L5  50.3 
 
 		 179 aa  179  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0223  ribosomal protein L5  50.61 
 
 		 179 aa  176  9e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2436  50S ribosomal protein L5P  50 
 
 		 174 aa  176  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0657  50S ribosomal protein L5P  49.7 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15981  decreased coverage  0.0000704942 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0723  50S ribosomal protein L5P  49.1 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.305719  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1261  50S ribosomal protein L5P  48.5 
 
 		 181 aa  174  6e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0207186  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0166  50S ribosomal protein L5P  46.71 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000530308  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1397  50S ribosomal protein L5P  48.21 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1508  ribosomal protein L5  45.96 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.2694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0104  50S ribosomal protein L5P  47.17 
 
 		 174 aa  159  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000310804  unclonable  0.000000485545 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1765  ribosomal protein L5  47.8 
 
 		 179 aa  158  4e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.553857  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0242  50S ribosomal protein L5P  45.28 
 
 		 182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2221  50S ribosomal protein L5P  44.03 
 
 		 179 aa  140  9e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.183607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0907  50S ribosomal protein L5P  42.14 
 
 		 179 aa  136  1e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.46697  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30777  Ribosomal protein L11, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  43.59 
 
 		 177 aa  136  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131413 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2000  50S ribosomal protein L5P  44.03 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0764  50S ribosomal protein L5P  43.4 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.296859  normal  0.0880431 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23324  predicted protein  40.65 
 
 		 176 aa  131  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03370  60s ribosomal protein l11, putative  40.65 
 
 		 175 aa  127  7.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0821316  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1831  50S ribosomal protein L5P  39.62 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0797  50S ribosomal protein L5P  38.75 
 
 		 173 aa  120  6e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.268265 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04475  60S ribosomal protein L11 (Broad)  36.13 
 
 		 175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.147456 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72706  predicted protein  41.51 
 
 		 174 aa  114  3.9999999999999997e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0669  50S ribosomal protein L5  38.41 
 
 		 177 aa  99.8  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.29336  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  43.41 
 
 		 187 aa  98.6  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  37.5 
 
 		 181 aa  94  9e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0406  50S ribosomal protein L5  37.42 
 
 		 183 aa  93.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0381  50S ribosomal protein L5  37.42 
 
 		 183 aa  93.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  35.06 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  39.53 
 
 		 179 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  39.69 
 
 		 179 aa  92.8  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  39.53 
 
 		 179 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  39.53 
 
 		 179 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  39.53 
 
 		 179 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  40.31 
 
 		 179 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  40.31 
 
 		 179 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  40.31 
 
 		 179 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  39.69 
 
 		 179 aa  92.4  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0307  50S ribosomal protein L5  32.9 
 
 		 180 aa  92  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000563605  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  36.36 
 
 		 179 aa  92.4  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  40.31 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 179 aa  91.7  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  38.17 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  39.53 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  39.39 
 
 		 186 aa  92  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  40.15 
 
 		 179 aa  91.3  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  37.12 
 
 		 185 aa  91.3  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  35.71 
 
 		 179 aa  91.3  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  38.24 
 
 		 185 aa  91.7  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  38.76 
 
 		 179 aa  91.3  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  35.06 
 
 		 188 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  35.71 
 
 		 179 aa  90.9  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  38.64 
 
 		 179 aa  90.9  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0421  50S ribosomal protein L5  40.15 
 
 		 177 aa  90.9  8e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.889596  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0771  50S ribosomal protein L5  37.21 
 
 		 186 aa  90.5  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542997  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  37.4 
 
 		 179 aa  90.5  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  33.77 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0600  50S ribosomal protein L5  39.39 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0797735  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  37.4 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1848  ribosomal protein L5  35.1 
 
 		 187 aa  89.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.21039e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0277  50S ribosomal protein L5  40.31 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356643  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  37.4 
 
 		 179 aa  89.4  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  35.06 
 
 		 188 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  35.06 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1382  50S ribosomal protein L5  36.18 
 
 		 184 aa  89.4  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00212588  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0700  ribosomal protein L5  39.53 
 
 		 189 aa  89.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  35.06 
 
 		 188 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  37.4 
 
 		 179 aa  89.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  39.39 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  37.4 
 
 		 179 aa  89  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0349  50S ribosomal protein L5  36.64 
 
 		 182 aa  89  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000265195  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1304  50S ribosomal protein L5  36.18 
 
 		 193 aa  89  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240969  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  39.39 
 
 		 179 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  37.12 
 
 		 179 aa  88.6  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  39.39 
 
 		 179 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1842  50S ribosomal protein L5  36.64 
 
 		 182 aa  89  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  37.4 
 
 		 179 aa  89  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0466  50S ribosomal protein L5  37.4 
 
 		 179 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.224995  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  38.64 
 
 		 179 aa  88.2  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0613  50S ribosomal protein L5  37.4 
 
 		 181 aa  88.6  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.684436  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0496  50S ribosomal protein L5  37.4 
 
 		 179 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09880  LSU ribosomal protein L5P  41.54 
 
 		 180 aa  88.6  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00169364  hitchhiker  0.0000180186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0499  50S ribosomal protein L5  37.4 
 
 		 179 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228142  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  36.64 
 
 		 179 aa  88.6  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  38.64 
 
 		 180 aa  88.2  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  33.12 
 
 		 179 aa  88.2  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  35.88 
 
 		 179 aa  87.8  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  35.88 
 
 		 179 aa  87.8  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2978  50S ribosomal protein L5  39.85 
 
 		 189 aa  87.8  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  33.77 
 
 		 188 aa  87.8  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>