More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1715 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1715  50S ribosomal protein L5P  100 
 
 		 169 aa  337  4e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0194222  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0014  50S ribosomal protein L5P  59.63 
 
 		 169 aa  207  5e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  5.43993e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0097  50S ribosomal protein L5P  57.41 
 
 		 169 aa  202  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000268421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0455  50S ribosomal protein L5P  57.14 
 
 		 165 aa  201  5e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0122847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0545  50S ribosomal protein L5P  57.86 
 
 		 165 aa  199  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  0.364222 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1261  50S ribosomal protein L5P  54.82 
 
 		 181 aa  195  3e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0207186  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0166  50S ribosomal protein L5P  53.01 
 
 		 181 aa  194  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000530308  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2240  50S ribosomal protein L5P  57.86 
 
 		 168 aa  193  9e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000418435  normal  0.360377 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0657  50S ribosomal protein L5P  53.61 
 
 		 181 aa  193  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15981  decreased coverage  0.0000704942 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0723  50S ribosomal protein L5P  53.61 
 
 		 181 aa  193  1e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.305719  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2305  50S ribosomal protein L5P  53.09 
 
 		 176 aa  187  5.999999999999999e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0577  50S ribosomal protein L5P  57.23 
 
 		 167 aa  185  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111203  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2231  ribosomal protein L5  50.91 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1841  50S ribosomal protein L5P  51.83 
 
 		 175 aa  181  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1397  50S ribosomal protein L5P  49.7 
 
 		 181 aa  181  3e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0223  ribosomal protein L5  51.23 
 
 		 179 aa  180  8.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0094  50S ribosomal protein L5P  52.44 
 
 		 171 aa  180  9.000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.496979 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2436  50S ribosomal protein L5P  48.78 
 
 		 174 aa  178  4e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1765  ribosomal protein L5  51.23 
 
 		 179 aa  175  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.553857  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0104  50S ribosomal protein L5P  46.58 
 
 		 174 aa  160  8.000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000310804  unclonable  0.000000485545 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0242  50S ribosomal protein L5P  50.62 
 
 		 182 aa  160  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1508  ribosomal protein L5  45.4 
 
 		 178 aa  156  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.2694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2000  50S ribosomal protein L5P  53.46 
 
 		 178 aa  152  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0907  50S ribosomal protein L5P  50.31 
 
 		 179 aa  148  3e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.46697  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0764  50S ribosomal protein L5P  52.2 
 
 		 179 aa  148  3e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.296859  normal  0.0880431 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2221  50S ribosomal protein L5P  50.94 
 
 		 179 aa  148  3e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.183607  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04475  60S ribosomal protein L11 (Broad)  45.57 
 
 		 175 aa  147  5e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.147456 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03370  60s ribosomal protein l11, putative  48.73 
 
 		 175 aa  147  9e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0821316  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1831  50S ribosomal protein L5P  44.72 
 
 		 197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23324  predicted protein  41.77 
 
 		 176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30777  Ribosomal protein L11, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  45.86 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131413 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72706  predicted protein  43.29 
 
 		 174 aa  128  5.0000000000000004e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0797  50S ribosomal protein L5P  40.13 
 
 		 173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.268265 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  41.54 
 
 		 179 aa  88.2  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  38.76 
 
 		 179 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  38.76 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  38.76 
 
 		 179 aa  86.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  36.72 
 
 		 180 aa  86.7  1e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  38.76 
 
 		 179 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  38.76 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  39.53 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  38.76 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  39.06 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  38.76 
 
 		 179 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  39.53 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  38.28 
 
 		 180 aa  85.9  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  36.15 
 
 		 185 aa  86.3  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  37.5 
 
 		 179 aa  85.5  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  37.98 
 
 		 179 aa  85.5  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  39.53 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  39.23 
 
 		 197 aa  85.1  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  37.98 
 
 		 179 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  37.98 
 
 		 179 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  38.17 
 
 		 180 aa  84.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  37.98 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  38.46 
 
 		 186 aa  84.3  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0297  50S ribosomal protein L5  34.62 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  36.92 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  41.98 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  38.76 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  37.69 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  34.11 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  36.15 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  36.15 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  39.84 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  32.45 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  41.09 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  36.92 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1562  ribosomal protein L5  35.16 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00268047  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  40.46 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0684  50S ribosomal protein L5  35.94 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  37.69 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  33.11 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  40.46 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0613  50S ribosomal protein L5  36.43 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.684436  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  33.11 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  35.38 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  35.94 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  33.11 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  41.22 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0771  50S ribosomal protein L5  34.62 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542997  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  39.53 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0238  50S ribosomal protein L5  37.01 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  36.15 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  36.15 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  35.38 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  35.38 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  35.38 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  35.38 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  35.38 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  36.15 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  34.88 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  35.38 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0406  50S ribosomal protein L5  36.15 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0381  50S ribosomal protein L5  36.15 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4926  ribosomal protein L5  37.5 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000138257  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0971  50S ribosomal protein L5  34.88 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000280468  hitchhiker  0.00000101885 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  35.66 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0998  50S ribosomal protein L5  38.46 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0178085 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  34.88 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>