More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0797 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0797  50S ribosomal protein L5P  100 
 
 		 173 aa  349  1e-95  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.268265 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2000  50S ribosomal protein L5P  46.11 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1765  ribosomal protein L5  43.45 
 
 		 179 aa  160  6e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.553857  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2221  50S ribosomal protein L5P  45.51 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.183607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0907  50S ribosomal protein L5P  45.56 
 
 		 179 aa  157  8e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.46697  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0764  50S ribosomal protein L5P  46.71 
 
 		 179 aa  155  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.296859  normal  0.0880431 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0242  50S ribosomal protein L5P  43.45 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0104  50S ribosomal protein L5P  39.88 
 
 		 174 aa  150  7e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000310804  unclonable  0.000000485545 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1831  50S ribosomal protein L5P  41.07 
 
 		 197 aa  148  4e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0166  50S ribosomal protein L5P  38.82 
 
 		 181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000530308  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0723  50S ribosomal protein L5P  39.41 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.305719  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1397  50S ribosomal protein L5P  40.59 
 
 		 181 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0657  50S ribosomal protein L5P  40 
 
 		 181 aa  143  9e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15981  decreased coverage  0.0000704942 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1261  50S ribosomal protein L5P  39.41 
 
 		 181 aa  143  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0207186  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2436  50S ribosomal protein L5P  39.77 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04475  60S ribosomal protein L11 (Broad)  40.74 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.147456 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23324  predicted protein  39.66 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2231  ribosomal protein L5  38.41 
 
 		 179 aa  133  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2240  50S ribosomal protein L5P  39.16 
 
 		 168 aa  132  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000418435  normal  0.360377 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0223  ribosomal protein L5  38.18 
 
 		 179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0014  50S ribosomal protein L5P  40.36 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  5.43993e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1841  50S ribosomal protein L5P  38.79 
 
 		 175 aa  129  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03370  60s ribosomal protein l11, putative  39.51 
 
 		 175 aa  129  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0821316  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2305  50S ribosomal protein L5P  36.97 
 
 		 176 aa  127  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1508  ribosomal protein L5  35.47 
 
 		 178 aa  127  7.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.2694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30777  Ribosomal protein L11, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  37.87 
 
 		 177 aa  125  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131413 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0545  50S ribosomal protein L5P  39.02 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  0.364222 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1715  50S ribosomal protein L5P  40.13 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0194222  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0455  50S ribosomal protein L5P  38.75 
 
 		 165 aa  120  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0122847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0577  50S ribosomal protein L5P  37.95 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111203  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72706  predicted protein  38.95 
 
 		 174 aa  117  7e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0097  50S ribosomal protein L5P  36.63 
 
 		 169 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000268421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0094  50S ribosomal protein L5P  33.14 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.496979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  36.96 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  37.23 
 
 		 187 aa  88.2  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  36.23 
 
 		 180 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  36.23 
 
 		 180 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  36.23 
 
 		 180 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  36.5 
 
 		 179 aa  85.5  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0277  50S ribosomal protein L5  37.96 
 
 		 187 aa  85.9  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356643  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  35.51 
 
 		 180 aa  85.1  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  36.96 
 
 		 179 aa  84.3  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0466  50S ribosomal protein L5  38.73 
 
 		 179 aa  84  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.224995  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0499  50S ribosomal protein L5  38.73 
 
 		 179 aa  84  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228142  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0496  50S ribosomal protein L5  38.73 
 
 		 179 aa  84  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0349  50S ribosomal protein L5  38.17 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000265195  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5058  ribosomal protein L5  35.25 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0491308  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1842  50S ribosomal protein L5  38.17 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  39.37 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3007  50S ribosomal protein L5  35.77 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00431822  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0613  50S ribosomal protein L5  37.23 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.684436  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  36.64 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  39.37 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  39.53 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  39.53 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  35.29 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4737  50S ribosomal protein L5  38.03 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.498496 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  34.31 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  32.85 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0385  50S ribosomal protein L5  34.78 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000000334346  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0393  50S ribosomal protein L5  34.78 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00978346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1273  ribosomal protein L5  32.39 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3305  50S ribosomal protein L5  35.25 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000419375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  36.96 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  35.17 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0613  50S ribosomal protein L5  35.51 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  35.1 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  33.58 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0720  50S ribosomal protein L5  34.33 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4536  50S ribosomal protein L5  38.03 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322286  normal  0.125258 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  34.53 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  34.78 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  35.29 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  34.27 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  35.29 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  34.78 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  35.07 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3167  50S ribosomal protein L5  35.25 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000061863  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  36.64 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0410  ribosomal protein L5  35.11 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  35.07 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  35.07 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0261  50S ribosomal protein L5  35.77 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00011988  hitchhiker  0.00419611 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  35.07 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  35.07 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2313  50S ribosomal protein L5  34.06 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000920139  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  35.07 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  36.69 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  35.29 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  34.56 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3056  50S ribosomal protein L5  35.77 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000258896  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  33.79 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2938  50S ribosomal protein L5  35.25 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000312511  hitchhiker  0.000000922003 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  36.57 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3285  50S ribosomal protein L5  35.25 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000500711  hitchhiker  0.00000237864 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  33.82 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0487  50S ribosomal protein L5  34.06 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  33.82 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0065  50S ribosomal protein L5  34.53 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000146206  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0360  50S ribosomal protein L5  35.04 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000501329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>