More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0166 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0166  50S ribosomal protein L5P  100 
 
 
181 aa  374  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000530308  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1261  50S ribosomal protein L5P  95.03 
 
 
181 aa  359  1e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0207186  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0657  50S ribosomal protein L5P  93.92 
 
 
181 aa  359  2e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15981  decreased coverage  0.0000704942 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0723  50S ribosomal protein L5P  88.4 
 
 
181 aa  335  2.9999999999999997e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.305719  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1397  50S ribosomal protein L5P  71.27 
 
 
181 aa  280  1e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1765  ribosomal protein L5  47.98 
 
 
179 aa  184  6e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.553857  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1715  50S ribosomal protein L5P  53.01 
 
 
169 aa  182  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0194222  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0455  50S ribosomal protein L5P  46.71 
 
 
165 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0122847  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0545  50S ribosomal protein L5P  43.71 
 
 
165 aa  166  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  0.364222 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0223  ribosomal protein L5  47.65 
 
 
179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0104  50S ribosomal protein L5P  45.76 
 
 
174 aa  164  5.9999999999999996e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000310804  unclonable  0.000000485545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2240  50S ribosomal protein L5P  45.24 
 
 
168 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000418435  normal  0.360377 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2231  ribosomal protein L5  45.51 
 
 
179 aa  164  8e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0577  50S ribosomal protein L5P  47.9 
 
 
167 aa  164  8e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111203  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1841  50S ribosomal protein L5P  46.11 
 
 
175 aa  164  9e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0014  50S ribosomal protein L5P  45.83 
 
 
169 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  5.43993e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2436  50S ribosomal protein L5P  44.69 
 
 
174 aa  161  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2305  50S ribosomal protein L5P  45.51 
 
 
176 aa  160  8.000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1508  ribosomal protein L5  45.93 
 
 
178 aa  157  6e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.2694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0094  50S ribosomal protein L5P  45.24 
 
 
171 aa  157  9e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.496979 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0097  50S ribosomal protein L5P  43.45 
 
 
169 aa  157  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000268421  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0242  50S ribosomal protein L5P  45.88 
 
 
182 aa  153  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2000  50S ribosomal protein L5P  48.21 
 
 
178 aa  150  8e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2221  50S ribosomal protein L5P  46.2 
 
 
179 aa  148  4e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.183607  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0797  50S ribosomal protein L5P  38.82 
 
 
173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.268265 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0907  50S ribosomal protein L5P  46.43 
 
 
179 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.46697  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0764  50S ribosomal protein L5P  45.61 
 
 
179 aa  140  7e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.296859  normal  0.0880431 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04475  60S ribosomal protein L11 (Broad)  42.42 
 
 
175 aa  137  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.147456 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03370  60s ribosomal protein l11, putative  43.53 
 
 
175 aa  137  7e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0821316  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1831  50S ribosomal protein L5P  40.7 
 
 
197 aa  137  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23324  predicted protein  42.01 
 
 
176 aa  134  7.000000000000001e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30777  Ribosomal protein L11, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  41.67 
 
 
177 aa  127  7.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.131413 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72706  predicted protein  41.67 
 
 
174 aa  123  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  37.76 
 
 
188 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  40.44 
 
 
187 aa  94  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0406  50S ribosomal protein L5  41.18 
 
 
183 aa  92.8  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0381  50S ribosomal protein L5  41.18 
 
 
183 aa  92.8  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  37.76 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  38.73 
 
 
197 aa  92.8  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  40.14 
 
 
179 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  42.54 
 
 
179 aa  90.9  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  39.44 
 
 
179 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0466  50S ribosomal protein L5  41.04 
 
 
179 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.224995  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0684  50S ribosomal protein L5  36.55 
 
 
180 aa  90.5  1e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0499  50S ribosomal protein L5  41.04 
 
 
179 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228142  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0496  50S ribosomal protein L5  41.04 
 
 
179 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116294  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  36.81 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4737  50S ribosomal protein L5  41.04 
 
 
179 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.498496 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  41.04 
 
 
179 aa  89  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  41.04 
 
 
179 aa  89  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  41.04 
 
 
179 aa  89  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  40.15 
 
 
193 aa  89  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  41.04 
 
 
179 aa  89  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  41.04 
 
 
179 aa  89  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0277  50S ribosomal protein L5  40.88 
 
 
187 aa  89  4e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356643  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  37.5 
 
 
188 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  40.3 
 
 
179 aa  89  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  35.66 
 
 
188 aa  89  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  40.3 
 
 
179 aa  88.6  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  40.3 
 
 
179 aa  89  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  40.3 
 
 
179 aa  89  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  40.3 
 
 
179 aa  88.6  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  40.3 
 
 
179 aa  89  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  38.24 
 
 
243 aa  88.6  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  40.3 
 
 
179 aa  88.6  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  41.18 
 
 
185 aa  88.2  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  40.3 
 
 
179 aa  88.2  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  39.55 
 
 
179 aa  88.2  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  39.55 
 
 
179 aa  88.2  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0613  50S ribosomal protein L5  39.57 
 
 
181 aa  87.8  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.684436  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  40.3 
 
 
179 aa  87.8  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  40.15 
 
 
192 aa  87.8  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  40.3 
 
 
179 aa  87.8  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  39.55 
 
 
179 aa  87.8  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  40.3 
 
 
179 aa  87.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  40.3 
 
 
179 aa  87.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  40.3 
 
 
179 aa  87.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  40.3 
 
 
179 aa  87.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  40.3 
 
 
179 aa  87.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  37.31 
 
 
188 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  37.31 
 
 
188 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  38.97 
 
 
185 aa  87  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  40 
 
 
185 aa  87.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  41.79 
 
 
179 aa  87.4  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  37.04 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  39.55 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4536  50S ribosomal protein L5  40.3 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322286  normal  0.125258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5067  50S ribosomal protein L5  40.3 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000562403  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3897  50S ribosomal protein L5  41.04 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000030586  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  37.23 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0710  50S ribosomal protein L5  38.97 
 
 
185 aa  86.3  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00257527  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0638  ribosomal protein L5  40.3 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000106157  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0349  50S ribosomal protein L5  39.01 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000265195  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  39.72 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0307  50S ribosomal protein L5  38.81 
 
 
180 aa  85.9  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000563605  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1842  50S ribosomal protein L5  39.01 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  39.86 
 
 
185 aa  85.5  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  37.23 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  37.68 
 
 
179 aa  85.1  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  40.3 
 
 
179 aa  85.1  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>