More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2436 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2436  50S ribosomal protein L5P  100 
 
 		 174 aa  354  2.9999999999999997e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2231  ribosomal protein L5  73.14 
 
 		 179 aa  263  7e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0223  ribosomal protein L5  71.1 
 
 		 179 aa  262  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1841  50S ribosomal protein L5P  67.63 
 
 		 175 aa  249  9.000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2305  50S ribosomal protein L5P  66.67 
 
 		 176 aa  244  4e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0097  50S ribosomal protein L5P  56.29 
 
 		 169 aa  203  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000268421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0014  50S ribosomal protein L5P  55.69 
 
 		 169 aa  197  9e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  5.43993e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0577  50S ribosomal protein L5P  50.61 
 
 		 167 aa  178  4e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111203  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0455  50S ribosomal protein L5P  50 
 
 		 165 aa  176  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0122847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0545  50S ribosomal protein L5P  49.39 
 
 		 165 aa  174  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  0.364222 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1765  ribosomal protein L5  47.65 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.553857  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2240  50S ribosomal protein L5P  49.08 
 
 		 168 aa  171  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000418435  normal  0.360377 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1715  50S ribosomal protein L5P  48.78 
 
 		 169 aa  168  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0194222  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1397  50S ribosomal protein L5P  45.56 
 
 		 181 aa  165  4e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1261  50S ribosomal protein L5P  47.19 
 
 		 181 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0207186  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0723  50S ribosomal protein L5P  45.25 
 
 		 181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.305719  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0657  50S ribosomal protein L5P  45.25 
 
 		 181 aa  161  3e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15981  decreased coverage  0.0000704942 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1508  ribosomal protein L5  44 
 
 		 178 aa  161  4.0000000000000004e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.2694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0166  50S ribosomal protein L5P  44.69 
 
 		 181 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000530308  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0242  50S ribosomal protein L5P  45.18 
 
 		 182 aa  160  9e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0094  50S ribosomal protein L5P  44.64 
 
 		 171 aa  155  4e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.496979 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0104  50S ribosomal protein L5P  43.35 
 
 		 174 aa  151  4e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000310804  unclonable  0.000000485545 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2221  50S ribosomal protein L5P  41.92 
 
 		 179 aa  148  3e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.183607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0907  50S ribosomal protein L5P  39.64 
 
 		 179 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.46697  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2000  50S ribosomal protein L5P  41.57 
 
 		 178 aa  141  4e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0764  50S ribosomal protein L5P  40.96 
 
 		 179 aa  140  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.296859  normal  0.0880431 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0797  50S ribosomal protein L5P  39.77 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.268265 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1831  50S ribosomal protein L5P  37.72 
 
 		 197 aa  134  4e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04475  60S ribosomal protein L11 (Broad)  36.05 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.147456 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23324  predicted protein  35.71 
 
 		 176 aa  127  8.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03370  60s ribosomal protein l11, putative  35.67 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0821316  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30777  Ribosomal protein L11, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  34.32 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131413 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72706  predicted protein  32.37 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  41.09 
 
 		 179 aa  95.5  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  39.1 
 
 		 179 aa  95.1  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  39.1 
 
 		 179 aa  93.2  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  39.1 
 
 		 179 aa  93.2  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  38.64 
 
 		 179 aa  92.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  38.52 
 
 		 179 aa  90.9  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  37.78 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  37.12 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  36.92 
 
 		 179 aa  89  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  36.62 
 
 		 180 aa  88.6  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  35.25 
 
 		 179 aa  88.2  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  37.12 
 
 		 179 aa  88.2  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  36.92 
 
 		 179 aa  88.2  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  36.92 
 
 		 179 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  36.92 
 
 		 179 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1848  ribosomal protein L5  34.81 
 
 		 187 aa  88.2  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.21039e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  36.92 
 
 		 179 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  36.92 
 
 		 179 aa  87.8  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0238  50S ribosomal protein L5  38.35 
 
 		 184 aa  87.8  7e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  36.92 
 
 		 179 aa  87.8  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  35.97 
 
 		 185 aa  87.8  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  37.04 
 
 		 179 aa  87.4  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1021  50S ribosomal protein L5  34.59 
 
 		 181 aa  87.4  8e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000164451  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  37.41 
 
 		 180 aa  87.8  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  33.8 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4737  50S ribosomal protein L5  35.86 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.498496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5067  50S ribosomal protein L5  35.86 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000562403  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0096  50S ribosomal protein L5  33.58 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.428124  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  37.88 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  35.92 
 
 		 180 aa  87  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  34.27 
 
 		 185 aa  86.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2069  50S ribosomal protein L5  33.09 
 
 		 181 aa  86.7  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0466  50S ribosomal protein L5  35.17 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.224995  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  35.92 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  36.15 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1863  50S ribosomal protein L5  32.37 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0499  50S ribosomal protein L5  35.17 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228142  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3897  50S ribosomal protein L5  34.51 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000030586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  35.92 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  36.15 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0496  50S ribosomal protein L5  35.17 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1765  50S ribosomal protein L5  34.59 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00103364  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  34.51 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1692  50S ribosomal protein L5  32.37 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0046073  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  36.62 
 
 		 179 aa  85.5  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1956  ribosomal protein L5  32.59 
 
 		 181 aa  85.9  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4536  50S ribosomal protein L5  35.17 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322286  normal  0.125258 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0298  50S ribosomal protein L5  31.34 
 
 		 181 aa  85.9  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00106254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  36.15 
 
 		 179 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0266  50S ribosomal protein L5  32.14 
 
 		 187 aa  85.9  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0642331  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  37.78 
 
 		 179 aa  85.5  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  34.51 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  37.78 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  35.21 
 
 		 179 aa  85.5  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  33.8 
 
 		 179 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  35 
 
 		 180 aa  85.1  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  37.88 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  34.53 
 
 		 179 aa  84.7  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  37.32 
 
 		 178 aa  84.7  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  34.81 
 
 		 185 aa  84.7  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0406  50S ribosomal protein L5  35.21 
 
 		 183 aa  84.7  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0381  50S ribosomal protein L5  35.21 
 
 		 183 aa  84.7  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  40.94 
 
 		 181 aa  84.7  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0971  50S ribosomal protein L5  36.3 
 
 		 154 aa  84.7  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000280468  hitchhiker  0.00000101885 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  34.81 
 
 		 185 aa  84.7  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  38.58 
 
 		 182 aa  84.3  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  34.81 
 
 		 180 aa  84.7  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>