More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1765 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1765  ribosomal protein L5  100 
 
 		 179 aa  361  3e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.553857  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0104  50S ribosomal protein L5P  68.45 
 
 		 174 aa  250  8.000000000000001e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000310804  unclonable  0.000000485545 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0242  50S ribosomal protein L5P  56.14 
 
 		 182 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1508  ribosomal protein L5  51.76 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.2694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0657  50S ribosomal protein L5P  50.29 
 
 		 181 aa  184  5e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15981  decreased coverage  0.0000704942 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0166  50S ribosomal protein L5P  47.98 
 
 		 181 aa  184  6e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000530308  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1261  50S ribosomal protein L5P  49.71 
 
 		 181 aa  184  6e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0207186  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2221  50S ribosomal protein L5P  50.89 
 
 		 179 aa  181  7e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.183607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2000  50S ribosomal protein L5P  51.48 
 
 		 178 aa  179  1e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0907  50S ribosomal protein L5P  51.2 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.46697  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1831  50S ribosomal protein L5P  47.02 
 
 		 197 aa  176  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0723  50S ribosomal protein L5P  48.55 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.305719  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2436  50S ribosomal protein L5P  47.65 
 
 		 174 aa  173  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1397  50S ribosomal protein L5P  47.09 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0014  50S ribosomal protein L5P  49.1 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  5.43993e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0764  50S ribosomal protein L5P  50.89 
 
 		 179 aa  171  6.999999999999999e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.296859  normal  0.0880431 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0577  50S ribosomal protein L5P  50.61 
 
 		 167 aa  167  5e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111203  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0545  50S ribosomal protein L5P  48.17 
 
 		 165 aa  167  7e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  0.364222 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1715  50S ribosomal protein L5P  51.23 
 
 		 169 aa  166  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0194222  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2240  50S ribosomal protein L5P  44.58 
 
 		 168 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000418435  normal  0.360377 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04475  60S ribosomal protein L11 (Broad)  44.85 
 
 		 175 aa  161  5.0000000000000005e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.147456 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0797  50S ribosomal protein L5P  43.45 
 
 		 173 aa  160  7e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.268265 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0097  50S ribosomal protein L5P  44.91 
 
 		 169 aa  159  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000268421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0455  50S ribosomal protein L5P  47.8 
 
 		 165 aa  158  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0122847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1841  50S ribosomal protein L5P  42.17 
 
 		 175 aa  155  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2231  ribosomal protein L5  43.71 
 
 		 179 aa  153  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0223  ribosomal protein L5  43.9 
 
 		 179 aa  151  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2305  50S ribosomal protein L5P  40.85 
 
 		 176 aa  151  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23324  predicted protein  42.59 
 
 		 176 aa  150  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30777  Ribosomal protein L11, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  41.62 
 
 		 177 aa  148  4e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131413 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03370  60s ribosomal protein l11, putative  41.62 
 
 		 175 aa  147  8e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0821316  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0094  50S ribosomal protein L5P  43.83 
 
 		 171 aa  141  6e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.496979 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72706  predicted protein  41.76 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0466  50S ribosomal protein L5  40 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.224995  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0499  50S ribosomal protein L5  40 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228142  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0496  50S ribosomal protein L5  40 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  41.04 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  41.04 
 
 		 179 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  40.3 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04509  50S ribosomal protein L5  38.81 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00526127  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4737  50S ribosomal protein L5  40 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.498496 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 180 aa  89  3e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0684  50S ribosomal protein L5  37.88 
 
 		 180 aa  89  3e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  37.78 
 
 		 185 aa  88.6  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0335  ribosomal protein L5  40 
 
 		 179 aa  88.6  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000680284  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  41.48 
 
 		 179 aa  88.2  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1382  50S ribosomal protein L5  40.62 
 
 		 184 aa  88.2  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00212588  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  37.31 
 
 		 180 aa  88.2  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  40.3 
 
 		 187 aa  87.8  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1304  50S ribosomal protein L5  40.62 
 
 		 193 aa  87.4  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240969  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  37.78 
 
 		 179 aa  87.4  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  37.04 
 
 		 180 aa  87  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  39.39 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  40.62 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  35.56 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0307  50S ribosomal protein L5  37.21 
 
 		 180 aa  86.7  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000563605  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0768  50S ribosomal protein L5  38.81 
 
 		 180 aa  86.3  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0251429  normal  0.0345896 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  39.26 
 
 		 180 aa  86.3  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  36.57 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  38.64 
 
 		 179 aa  85.5  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0406  50S ribosomal protein L5  39.84 
 
 		 183 aa  85.5  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0381  50S ribosomal protein L5  39.84 
 
 		 183 aa  85.5  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5058  ribosomal protein L5  38.52 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0491308  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  37.12 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1562  ribosomal protein L5  39.06 
 
 		 180 aa  85.5  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00268047  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  36.57 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0393  50S ribosomal protein L5  38.06 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00978346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  37.78 
 
 		 180 aa  85.1  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0385  50S ribosomal protein L5  38.06 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000000334346  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  37.12 
 
 		 179 aa  85.5  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  39.69 
 
 		 185 aa  85.5  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  35.82 
 
 		 180 aa  85.1  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 179 aa  85.1  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  35.56 
 
 		 188 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0445  50S ribosomal protein L5  36.3 
 
 		 179 aa  85.1  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0266949  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  35.82 
 
 		 180 aa  85.1  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 179 aa  85.1  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  35.82 
 
 		 180 aa  85.1  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  37.12 
 
 		 179 aa  85.1  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  36.57 
 
 		 188 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0638  ribosomal protein L5  39.55 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000106157  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4536  50S ribosomal protein L5  39.26 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322286  normal  0.125258 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5067  50S ribosomal protein L5  39.26 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000562403  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3897  50S ribosomal protein L5  39.55 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000030586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2313  50S ribosomal protein L5  38.06 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000920139  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3172  50S ribosomal protein L5  37.31 
 
 		 185 aa  84.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0506  50S ribosomal protein L5  36.3 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0585941  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0613  50S ribosomal protein L5  38.64 
 
 		 181 aa  84.7  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.684436  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0470  50S ribosomal protein L5  38.81 
 
 		 179 aa  84.3  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  37.88 
 
 		 179 aa  84.7  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  36.84 
 
 		 188 aa  84.3  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  36.84 
 
 		 188 aa  84.3  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  37.31 
 
 		 186 aa  84.3  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  38.52 
 
 		 179 aa  84.3  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  39.55 
 
 		 179 aa  84.3  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  37.12 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>