More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2221 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2221  50S ribosomal protein L5P  100 
 
 		 179 aa  358  2e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.183607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0907  50S ribosomal protein L5P  91.62 
 
 		 179 aa  326  1.0000000000000001e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.46697  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0764  50S ribosomal protein L5P  89.94 
 
 		 179 aa  314  5e-85  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.296859  normal  0.0880431 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2000  50S ribosomal protein L5P  90.34 
 
 		 178 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1831  50S ribosomal protein L5P  60.23 
 
 		 197 aa  220  8e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0242  50S ribosomal protein L5P  60.23 
 
 		 182 aa  214  4e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1765  ribosomal protein L5  50.89 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.553857  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0104  50S ribosomal protein L5P  51.76 
 
 		 174 aa  189  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000310804  unclonable  0.000000485545 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0797  50S ribosomal protein L5P  45.51 
 
 		 173 aa  164  5e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.268265 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1261  50S ribosomal protein L5P  47.37 
 
 		 181 aa  157  9e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0207186  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0723  50S ribosomal protein L5P  47.95 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.305719  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0657  50S ribosomal protein L5P  46.78 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15981  decreased coverage  0.0000704942 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0166  50S ribosomal protein L5P  46.2 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000530308  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1397  50S ribosomal protein L5P  44.19 
 
 		 181 aa  155  4e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0577  50S ribosomal protein L5P  48.78 
 
 		 167 aa  153  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111203  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2436  50S ribosomal protein L5P  41.92 
 
 		 174 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2231  ribosomal protein L5  44.91 
 
 		 179 aa  152  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1715  50S ribosomal protein L5P  50.94 
 
 		 169 aa  145  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0194222  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0455  50S ribosomal protein L5P  44.03 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0122847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0223  ribosomal protein L5  43.37 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0014  50S ribosomal protein L5P  42.26 
 
 		 169 aa  143  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  5.43993e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0094  50S ribosomal protein L5P  44.05 
 
 		 171 aa  142  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.496979 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0545  50S ribosomal protein L5P  43.9 
 
 		 165 aa  142  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  0.364222 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1508  ribosomal protein L5  42.86 
 
 		 178 aa  140  7e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.2694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0097  50S ribosomal protein L5P  44.51 
 
 		 169 aa  140  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000268421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2240  50S ribosomal protein L5P  42.77 
 
 		 168 aa  139  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000418435  normal  0.360377 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2305  50S ribosomal protein L5P  37.95 
 
 		 176 aa  137  8.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1841  50S ribosomal protein L5P  39.76 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23324  predicted protein  40.74 
 
 		 176 aa  134  5e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03370  60s ribosomal protein l11, putative  43.12 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0821316  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30777  Ribosomal protein L11, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  41.46 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131413 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04475  60S ribosomal protein L11 (Broad)  39.38 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.147456 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72706  predicted protein  39.13 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0277  50S ribosomal protein L5  41.61 
 
 		 187 aa  98.2  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356643  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  41.27 
 
 		 185 aa  97.1  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  40.74 
 
 		 187 aa  95.9  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  36.57 
 
 		 185 aa  95.1  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  39.1 
 
 		 188 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  39.1 
 
 		 188 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  43.51 
 
 		 179 aa  94.4  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  37.59 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  38.69 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  38.97 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  36.81 
 
 		 180 aa  92.8  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  38.97 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  42.54 
 
 		 185 aa  92.8  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  39.23 
 
 		 180 aa  92  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  42.54 
 
 		 185 aa  91.7  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 179 aa  91.7  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 179 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  42.54 
 
 		 185 aa  91.7  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 179 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 179 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  39.55 
 
 		 179 aa  91.3  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  39.55 
 
 		 197 aa  91.3  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  37.31 
 
 		 188 aa  90.9  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  38.35 
 
 		 185 aa  90.1  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  42.54 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  38.17 
 
 		 179 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  38.81 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  36.09 
 
 		 180 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  38.17 
 
 		 179 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  38.17 
 
 		 179 aa  89.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  40.46 
 
 		 180 aa  89.4  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  38.1 
 
 		 179 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4926  ribosomal protein L5  37.41 
 
 		 179 aa  89.4  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000138257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  38.1 
 
 		 179 aa  88.6  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  36.09 
 
 		 180 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  36.09 
 
 		 180 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  36.09 
 
 		 180 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  38.1 
 
 		 179 aa  88.6  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0710  50S ribosomal protein L5  38.81 
 
 		 185 aa  88.2  6e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00257527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  37.31 
 
 		 179 aa  88.2  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0071  50S ribosomal protein L5  35.82 
 
 		 181 aa  87.8  7e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0205797  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1382  50S ribosomal protein L5  38.71 
 
 		 184 aa  87.8  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00212588  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2052  50S ribosomal protein L5  37.6 
 
 		 196 aa  87.4  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000691649  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1304  50S ribosomal protein L5  38.71 
 
 		 193 aa  87.4  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240969  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  37.3 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 180 aa  87.4  1e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  39.52 
 
 		 180 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  42.86 
 
 		 184 aa  87  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  37.68 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  39.52 
 
 		 180 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  38.89 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  38.1 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0298  50S ribosomal protein L5  34.33 
 
 		 181 aa  85.9  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00106254  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  38.89 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  38.89 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  35.07 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1562  ribosomal protein L5  35.71 
 
 		 180 aa  85.5  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00268047  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  37.3 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  37.3 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  40.32 
 
 		 183 aa  85.5  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  37.5 
 
 		 180 aa  85.1  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  37.3 
 
 		 193 aa  85.1  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>