More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ03370 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006679  CNJ03370  60s ribosomal protein l11, putative  100 
 
 		 175 aa  357  6e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0821316  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04475  60S ribosomal protein L11 (Broad)  74.71 
 
 		 175 aa  280  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.147456 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72706  predicted protein  76.36 
 
 		 174 aa  251  4.0000000000000004e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23324  predicted protein  66.67 
 
 		 176 aa  243  8e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30777  Ribosomal protein L11, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  62.07 
 
 		 177 aa  227  8e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131413 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0014  50S ribosomal protein L5P  45.68 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  5.43993e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1765  ribosomal protein L5  41.62 
 
 		 179 aa  147  7e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.553857  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0242  50S ribosomal protein L5P  45 
 
 		 182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0104  50S ribosomal protein L5P  41.07 
 
 		 174 aa  143  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000310804  unclonable  0.000000485545 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0723  50S ribosomal protein L5P  46.34 
 
 		 181 aa  143  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.305719  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0097  50S ribosomal protein L5P  42.59 
 
 		 169 aa  140  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000268421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1508  ribosomal protein L5  43.9 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.2694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1715  50S ribosomal protein L5P  48.73 
 
 		 169 aa  139  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0194222  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0166  50S ribosomal protein L5P  43.53 
 
 		 181 aa  137  6e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000530308  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1261  50S ribosomal protein L5P  44.71 
 
 		 181 aa  137  6e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0207186  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0657  50S ribosomal protein L5P  44.71 
 
 		 181 aa  137  7e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15981  decreased coverage  0.0000704942 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2000  50S ribosomal protein L5P  45 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2305  50S ribosomal protein L5P  38.73 
 
 		 176 aa  136  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2240  50S ribosomal protein L5P  40.24 
 
 		 168 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000418435  normal  0.360377 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0545  50S ribosomal protein L5P  39.38 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  0.364222 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1841  50S ribosomal protein L5P  40.23 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0907  50S ribosomal protein L5P  42.5 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.46697  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1831  50S ribosomal protein L5P  43.75 
 
 		 197 aa  131  3.9999999999999996e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2221  50S ribosomal protein L5P  43.12 
 
 		 179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.183607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0223  ribosomal protein L5  38.86 
 
 		 179 aa  131  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0797  50S ribosomal protein L5P  39.51 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.268265 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1397  50S ribosomal protein L5P  42.77 
 
 		 181 aa  127  8.000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0455  50S ribosomal protein L5P  40.65 
 
 		 165 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0122847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2231  ribosomal protein L5  38.37 
 
 		 179 aa  127  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2436  50S ribosomal protein L5P  35.67 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0764  50S ribosomal protein L5P  43.75 
 
 		 179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.296859  normal  0.0880431 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0577  50S ribosomal protein L5P  41.25 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111203  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0094  50S ribosomal protein L5P  41.72 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.496979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  35.92 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  37.31 
 
 		 197 aa  80.9  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  34.75 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  34.75 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  35.82 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  33.8 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  36.09 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  35.34 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  33.1 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1344  50S ribosomal protein L5  36.62 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000471517  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  33.8 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  33.58 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1853  50S ribosomal protein L5  34.72 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282205  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  38.06 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  35.21 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0998  50S ribosomal protein L5  37.32 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0178085 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  33.1 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  32.84 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  32.84 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  32.84 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  36.57 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3436  50S ribosomal protein L5  32.39 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160205  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  36.57 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1442  50S ribosomal protein L5  34.51 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3172  50S ribosomal protein L5  31.69 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  31.69 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5058  50S ribosomal protein L5  32.39 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  35.07 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  32.35 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0710  50S ribosomal protein L5  33.8 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00257527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04509  50S ribosomal protein L5  32.33 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00526127  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0406  50S ribosomal protein L5  35.43 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0381  50S ribosomal protein L5  35.43 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0684  50S ribosomal protein L5  33.33 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  36.72 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  33.33 
 
 		 185 aa  67.4  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0506  50S ribosomal protein L5  30.83 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0585941  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  31.25 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  32.58 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  32.58 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  34.85 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  32.58 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0331  50S ribosomal protein L5  33.59 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.86209e-22  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  32.58 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  32.58 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2307  50S ribosomal protein L5  32.39 
 
 		 185 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0101823  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0603  50S ribosomal protein L5  31.69 
 
 		 186 aa  67  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  32.58 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  31.25 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1557  50S ribosomal protein L5  31.69 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  32.59 
 
 		 220 aa  67  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  31.25 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  30.08 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5058  ribosomal protein L5  31.21 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0491308  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0669  50S ribosomal protein L5  33.58 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.29336  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  29.79 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  35.82 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  31.69 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  31.82 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0445  50S ribosomal protein L5  30.83 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0266949  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  31.69 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3655  50S ribosomal protein L5  31.69 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  31.69 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  31.69 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  32.61 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  30.28 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3326  50S ribosomal protein L5  33.59 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000159394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>