More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_30777 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009357  OSTLU_30777  Ribosomal protein L11, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  100 
 
 
177 aa  368  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.131413 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23324  predicted protein  67.43 
 
 
176 aa  253  7e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04475  60S ribosomal protein L11 (Broad)  64.71 
 
 
175 aa  238  5e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.147456 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03370  60s ribosomal protein l11, putative  62.07 
 
 
175 aa  227  8e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0821316  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72706  predicted protein  61.14 
 
 
174 aa  211  5.999999999999999e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0242  50S ribosomal protein L5P  41.57 
 
 
182 aa  149  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1765  ribosomal protein L5  41.62 
 
 
179 aa  148  4e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.553857  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0455  50S ribosomal protein L5P  43.59 
 
 
165 aa  136  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0122847  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0014  50S ribosomal protein L5P  41.72 
 
 
169 aa  135  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  5.43993e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0104  50S ribosomal protein L5P  35.98 
 
 
174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000310804  unclonable  0.000000485545 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0723  50S ribosomal protein L5P  42.77 
 
 
181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.305719  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1831  50S ribosomal protein L5P  40.12 
 
 
197 aa  131  5e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1508  ribosomal protein L5  41.04 
 
 
178 aa  131  6e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.2694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2240  50S ribosomal protein L5P  40.49 
 
 
168 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000418435  normal  0.360377 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0545  50S ribosomal protein L5P  39.75 
 
 
165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  0.364222 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1261  50S ribosomal protein L5P  43.37 
 
 
181 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0207186  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0657  50S ribosomal protein L5P  43.37 
 
 
181 aa  129  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15981  decreased coverage  0.0000704942 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0097  50S ribosomal protein L5P  38.04 
 
 
169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000268421  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0166  50S ribosomal protein L5P  41.67 
 
 
181 aa  127  6e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000530308  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0094  50S ribosomal protein L5P  42.68 
 
 
171 aa  127  8.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.496979 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0577  50S ribosomal protein L5P  40.99 
 
 
167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111203  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2000  50S ribosomal protein L5P  40.85 
 
 
178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2305  50S ribosomal protein L5P  38.65 
 
 
176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2221  50S ribosomal protein L5P  41.46 
 
 
179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.183607  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0223  ribosomal protein L5  40.74 
 
 
179 aa  125  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1841  50S ribosomal protein L5P  40.12 
 
 
175 aa  125  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0797  50S ribosomal protein L5P  37.87 
 
 
173 aa  125  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.268265 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0907  50S ribosomal protein L5P  41.1 
 
 
179 aa  124  6e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.46697  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2231  ribosomal protein L5  38.27 
 
 
179 aa  124  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2436  50S ribosomal protein L5P  34.32 
 
 
174 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1715  50S ribosomal protein L5P  45.86 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0194222  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1397  50S ribosomal protein L5P  38.79 
 
 
181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0764  50S ribosomal protein L5P  41.46 
 
 
179 aa  116  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.296859  normal  0.0880431 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  36.5 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  35.77 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  35.77 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  35.77 
 
 
188 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  36.03 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  36.03 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  36.5 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  35.04 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  36.5 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  35.04 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  32.59 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  33.58 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  35.04 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0406  50S ribosomal protein L5  34.09 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0381  50S ribosomal protein L5  34.09 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3172  50S ribosomal protein L5  35.29 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  35.04 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  32.85 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  32.85 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  30.37 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  32.85 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  35.04 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  30.15 
 
 
193 aa  63.2  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  31.65 
 
 
185 aa  62.4  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  32.37 
 
 
179 aa  62.4  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0669  50S ribosomal protein L5  31.85 
 
 
177 aa  61.2  0.000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.29336  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  32.84 
 
 
186 aa  61.6  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0277  50S ribosomal protein L5  32.59 
 
 
187 aa  61.6  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356643  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3655  50S ribosomal protein L5  33.82 
 
 
185 aa  61.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  32.85 
 
 
179 aa  61.2  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  32.85 
 
 
179 aa  61.2  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2307  50S ribosomal protein L5  33.82 
 
 
185 aa  60.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0101823  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  34.07 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  33.08 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  33.08 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1562  ribosomal protein L5  31.62 
 
 
180 aa  59.7  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00268047  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  33.08 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  33.08 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0710  50S ribosomal protein L5  32.59 
 
 
185 aa  59.7  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00257527  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  31.34 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0603  50S ribosomal protein L5  31.39 
 
 
186 aa  59.7  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697001  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  33.08 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  31.82 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  33.59 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  33.08 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  31.82 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  33.83 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  32.84 
 
 
179 aa  59.3  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  29.85 
 
 
185 aa  59.3  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  29.1 
 
 
192 aa  58.9  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  30.43 
 
 
180 aa  59.3  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  30.6 
 
 
179 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  30.6 
 
 
179 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  31.34 
 
 
179 aa  58.5  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  31.58 
 
 
179 aa  58.5  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5058  50S ribosomal protein L5  33.09 
 
 
185 aa  58.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3436  50S ribosomal protein L5  33.82 
 
 
185 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160205  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  30 
 
 
179 aa  58.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0445  50S ribosomal protein L5  28.89 
 
 
179 aa  58.2  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0266949  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0506  50S ribosomal protein L5  28.15 
 
 
179 aa  58.2  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0585941  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  32.85 
 
 
180 aa  58.2  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  28.68 
 
 
180 aa  58.2  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  29.5 
 
 
182 aa  58.2  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1853  50S ribosomal protein L5  35.37 
 
 
185 aa  58.2  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282205  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04509  50S ribosomal protein L5  29.1 
 
 
180 aa  57.8  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00526127  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  29.41 
 
 
180 aa  58.2  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  27.94 
 
 
179 aa  58.2  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>