More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2240 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2240  50S ribosomal protein L5P  100 
 
 		 168 aa  342  1e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000418435  normal  0.360377 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0455  50S ribosomal protein L5P  64.6 
 
 		 165 aa  228  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0122847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0545  50S ribosomal protein L5P  65.85 
 
 		 165 aa  226  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  0.364222 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0014  50S ribosomal protein L5P  60.48 
 
 		 169 aa  213  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  5.43993e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0577  50S ribosomal protein L5P  56.89 
 
 		 167 aa  208  3e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111203  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0097  50S ribosomal protein L5P  56.02 
 
 		 169 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000268421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0094  50S ribosomal protein L5P  54.39 
 
 		 171 aa  195  3e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.496979 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1715  50S ribosomal protein L5P  57.86 
 
 		 169 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0194222  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2305  50S ribosomal protein L5P  48.47 
 
 		 176 aa  171  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2436  50S ribosomal protein L5P  49.08 
 
 		 174 aa  171  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1397  50S ribosomal protein L5P  46.75 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1508  ribosomal protein L5  45.51 
 
 		 178 aa  166  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.2694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2231  ribosomal protein L5  50 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1261  50S ribosomal protein L5P  45.83 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0207186  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0657  50S ribosomal protein L5P  44.64 
 
 		 181 aa  164  5e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15981  decreased coverage  0.0000704942 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0166  50S ribosomal protein L5P  45.24 
 
 		 181 aa  164  5e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000530308  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1841  50S ribosomal protein L5P  47.24 
 
 		 175 aa  163  8e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0723  50S ribosomal protein L5P  45.83 
 
 		 181 aa  163  8e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.305719  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1765  ribosomal protein L5  44.58 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.553857  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0223  ribosomal protein L5  49.69 
 
 		 179 aa  160  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0104  50S ribosomal protein L5P  45.78 
 
 		 174 aa  155  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000310804  unclonable  0.000000485545 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0242  50S ribosomal protein L5P  43.37 
 
 		 182 aa  147  5e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23324  predicted protein  41.98 
 
 		 176 aa  139  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2221  50S ribosomal protein L5P  42.77 
 
 		 179 aa  135  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.183607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0907  50S ribosomal protein L5P  42.17 
 
 		 179 aa  134  4e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.46697  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03370  60s ribosomal protein l11, putative  40.24 
 
 		 175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0821316  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0797  50S ribosomal protein L5P  39.16 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.268265 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2000  50S ribosomal protein L5P  42.77 
 
 		 178 aa  132  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0764  50S ribosomal protein L5P  42.17 
 
 		 179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.296859  normal  0.0880431 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30777  Ribosomal protein L11, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  40.49 
 
 		 177 aa  130  6.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131413 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04475  60S ribosomal protein L11 (Broad)  37.42 
 
 		 175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.147456 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1831  50S ribosomal protein L5P  37.95 
 
 		 197 aa  120  8e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72706  predicted protein  39.76 
 
 		 174 aa  117  7e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  35.57 
 
 		 179 aa  94  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  35.57 
 
 		 179 aa  92  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1848  ribosomal protein L5  34.59 
 
 		 187 aa  91.7  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.21039e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  35.57 
 
 		 179 aa  91.7  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  35.57 
 
 		 179 aa  91.3  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  35.57 
 
 		 179 aa  91.3  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0406  50S ribosomal protein L5  37.67 
 
 		 183 aa  90.5  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0381  50S ribosomal protein L5  37.67 
 
 		 183 aa  90.5  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  39.68 
 
 		 179 aa  89.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  39.68 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  33.55 
 
 		 180 aa  89  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  34.23 
 
 		 179 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  34.9 
 
 		 179 aa  89  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  34.23 
 
 		 179 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  34.9 
 
 		 179 aa  89  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  34.23 
 
 		 179 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  34.23 
 
 		 179 aa  89  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  34.23 
 
 		 179 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  34.23 
 
 		 179 aa  88.6  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  31.97 
 
 		 179 aa  88.6  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  38.1 
 
 		 179 aa  88.6  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  31.41 
 
 		 188 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  31.41 
 
 		 188 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  34.23 
 
 		 179 aa  88.2  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  38.89 
 
 		 179 aa  88.2  5e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  38.89 
 
 		 179 aa  87.8  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  38.89 
 
 		 179 aa  87.8  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  38.89 
 
 		 179 aa  87.8  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  34.23 
 
 		 179 aa  87.8  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  38.89 
 
 		 179 aa  87.8  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  38.89 
 
 		 179 aa  87.8  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0613  50S ribosomal protein L5  39.68 
 
 		 181 aa  87.8  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.684436  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  38.89 
 
 		 179 aa  87.8  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  32.05 
 
 		 179 aa  87.8  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  34.23 
 
 		 179 aa  87.4  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  38.1 
 
 		 179 aa  87.4  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  30.77 
 
 		 188 aa  87.4  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  30.77 
 
 		 188 aa  87.4  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  32.89 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  32.89 
 
 		 179 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  34.23 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  35.07 
 
 		 185 aa  86.7  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  32.89 
 
 		 179 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  30.87 
 
 		 180 aa  87  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  36.51 
 
 		 179 aa  85.9  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  37.3 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  37.3 
 
 		 179 aa  85.5  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1382  50S ribosomal protein L5  36.05 
 
 		 184 aa  84.7  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00212588  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1304  50S ribosomal protein L5  36.05 
 
 		 193 aa  84.7  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240969  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  29.49 
 
 		 185 aa  84.3  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  32.21 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0470  50S ribosomal protein L5  35.43 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  35.81 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  36.51 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  32.65 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  29.53 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  32.7 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  35.71 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  28.85 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0998  50S ribosomal protein L5  34.9 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0178085 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  34.59 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0298  50S ribosomal protein L5  29.49 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00106254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  29.53 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  36.51 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  29.53 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  37.6 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  32.89 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>