More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1841 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1841  50S ribosomal protein L5P  100 
 
 		 175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2305  50S ribosomal protein L5P  77.27 
 
 		 176 aa  279  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2231  ribosomal protein L5  73.56 
 
 		 179 aa  263  8.999999999999999e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0223  ribosomal protein L5  73.26 
 
 		 179 aa  262  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2436  50S ribosomal protein L5P  67.63 
 
 		 174 aa  249  9.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0097  50S ribosomal protein L5P  53.05 
 
 		 169 aa  185  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000268421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0455  50S ribosomal protein L5P  52.44 
 
 		 165 aa  184  4e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0122847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0014  50S ribosomal protein L5P  53.66 
 
 		 169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  5.43993e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0545  50S ribosomal protein L5P  46.95 
 
 		 165 aa  170  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  0.364222 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0577  50S ribosomal protein L5P  48.78 
 
 		 167 aa  168  4e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111203  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1715  50S ribosomal protein L5P  51.83 
 
 		 169 aa  168  4e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0194222  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1397  50S ribosomal protein L5P  44.38 
 
 		 181 aa  167  6e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1261  50S ribosomal protein L5P  47.9 
 
 		 181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0207186  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0723  50S ribosomal protein L5P  46.71 
 
 		 181 aa  165  4e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.305719  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0657  50S ribosomal protein L5P  47.31 
 
 		 181 aa  164  5e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15981  decreased coverage  0.0000704942 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0166  50S ribosomal protein L5P  46.11 
 
 		 181 aa  164  8e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000530308  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2240  50S ribosomal protein L5P  47.24 
 
 		 168 aa  163  9e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000418435  normal  0.360377 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1765  ribosomal protein L5  42.17 
 
 		 179 aa  155  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.553857  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0094  50S ribosomal protein L5P  45.83 
 
 		 171 aa  155  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.496979 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0104  50S ribosomal protein L5P  40.85 
 
 		 174 aa  147  5e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000310804  unclonable  0.000000485545 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0242  50S ribosomal protein L5P  40.12 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04475  60S ribosomal protein L11 (Broad)  40.12 
 
 		 175 aa  137  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.147456 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1508  ribosomal protein L5  37.13 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.2694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03370  60s ribosomal protein l11, putative  40.23 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0821316  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2221  50S ribosomal protein L5P  39.76 
 
 		 179 aa  132  3e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.183607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0907  50S ribosomal protein L5P  38.55 
 
 		 179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.46697  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2000  50S ribosomal protein L5P  38.55 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0797  50S ribosomal protein L5P  38.79 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.268265 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0764  50S ribosomal protein L5P  38.55 
 
 		 179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.296859  normal  0.0880431 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1831  50S ribosomal protein L5P  35.76 
 
 		 197 aa  127  9.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30777  Ribosomal protein L11, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  40.12 
 
 		 177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131413 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23324  predicted protein  38.82 
 
 		 176 aa  124  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72706  predicted protein  38.41 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  44.36 
 
 		 185 aa  104  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  40.79 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  40.79 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0669  50S ribosomal protein L5  41.22 
 
 		 177 aa  101  6e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.29336  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0600  50S ribosomal protein L5  40.14 
 
 		 177 aa  100  8e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0797735  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0421  50S ribosomal protein L5  40.14 
 
 		 177 aa  100  9e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.889596  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0613  50S ribosomal protein L5  40.91 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.684436  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  40.62 
 
 		 185 aa  99.8  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  41.98 
 
 		 187 aa  99  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  42.14 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  42.42 
 
 		 179 aa  97.8  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  41.35 
 
 		 185 aa  97.8  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  41.67 
 
 		 179 aa  97.8  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  42.75 
 
 		 179 aa  97.8  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  41.67 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  39.69 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  40.15 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  39.33 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  39.39 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  40.15 
 
 		 179 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  38.56 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  40.91 
 
 		 179 aa  95.9  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  40.91 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  38.56 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  38.56 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  38.56 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  41.67 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  40.15 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  40.15 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  38.67 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  38.56 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  40.15 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  38 
 
 		 179 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  38 
 
 		 179 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  41.67 
 
 		 179 aa  95.5  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  41.3 
 
 		 180 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  38 
 
 		 179 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  41.3 
 
 		 180 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  39.86 
 
 		 179 aa  95.9  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  38.35 
 
 		 185 aa  95.9  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  39.85 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  41.3 
 
 		 180 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  38 
 
 		 179 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  39.69 
 
 		 179 aa  95.9  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0406  50S ribosomal protein L5  38.17 
 
 		 183 aa  95.1  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0381  50S ribosomal protein L5  38.17 
 
 		 183 aa  95.1  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  36.54 
 
 		 179 aa  95.5  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  39.49 
 
 		 179 aa  94.7  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01290  ribosomal protein L5  41.48 
 
 		 179 aa  94.7  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.388904  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0710  50S ribosomal protein L5  39.1 
 
 		 185 aa  94.7  6e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00257527  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  39.39 
 
 		 179 aa  94.7  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3436  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 185 aa  94.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160205  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  39.13 
 
 		 185 aa  94.4  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  36.67 
 
 		 179 aa  94.4  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  39.39 
 
 		 179 aa  94.4  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  39.69 
 
 		 179 aa  94  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3989  50S ribosomal protein L5  43.18 
 
 		 179 aa  94  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0243679  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3810  50S ribosomal protein L5  43.18 
 
 		 179 aa  94  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000450853  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  38.17 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0266  50S ribosomal protein L5  34.33 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0642331  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  39.39 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  41.22 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0466  50S ribosomal protein L5  37.4 
 
 		 179 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.224995  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  39.69 
 
 		 179 aa  92.8  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0971  50S ribosomal protein L5  37.88 
 
 		 154 aa  93.2  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000280468  hitchhiker  0.00000101885 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3172  50S ribosomal protein L5  36.64 
 
 		 185 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  39.39 
 
 		 179 aa  92.8  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>