More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0486 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0486  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 179 aa  367  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000104072  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_429  ribosomal protein L5  99.44 
 
 		 179 aa  365  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169896  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0463  50S ribosomal protein L5  95.53 
 
 		 179 aa  352  2e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153089  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  64.8 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  231  5e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  61.05 
 
 		 180 aa  229  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  227  6e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  59.54 
 
 		 180 aa  227  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  60.57 
 
 		 183 aa  227  7e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 181 aa  226  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 180 aa  223  8e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 178 aa  223  9e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 180 aa  223  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  56.9 
 
 		 180 aa  219  9.999999999999999e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 180 aa  219  9.999999999999999e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 180 aa  218  3e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 		 179 aa  218  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  218  5e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 		 179 aa  218  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  218  5e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 180 aa  217  7e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  56.57 
 
 		 180 aa  216  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  55 
 
 		 180 aa  215  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 180 aa  214  5e-55  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  214  7e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  214  7e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  214  7e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 180 aa  213  8e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2607  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 182 aa  213  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000613532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 180 aa  211  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 		 182 aa  211  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4495  ribosomal protein L5  54.55 
 
 		 184 aa  211  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 		 179 aa  210  7e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  52.05 
 
 		 180 aa  210  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  56.18 
 
 		 179 aa  210  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  210  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0607  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 180 aa  210  1e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000230236  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  53.07 
 
 		 179 aa  210  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1304  50S ribosomal protein L5  55.09 
 
 		 180 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  54.44 
 
 		 181 aa  208  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0720  50S ribosomal protein L5  55.36 
 
 		 179 aa  208  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  54.24 
 
 		 179 aa  207  8e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 		 179 aa  206  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2245  50S ribosomal protein L5  53.63 
 
 		 179 aa  206  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00560978  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2220  50S ribosomal protein L5  55.95 
 
 		 179 aa  206  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.985503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  51.96 
 
 		 179 aa  206  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  51.96 
 
 		 179 aa  206  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  51.4 
 
 		 179 aa  206  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01290  ribosomal protein L5  55.75 
 
 		 179 aa  205  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.388904  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  51.4 
 
 		 179 aa  205  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  60.36 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  49.72 
 
 		 179 aa  204  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1753  50S ribosomal protein L5  54.19 
 
 		 179 aa  204  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.182239  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  51.4 
 
 		 179 aa  204  5e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  55.09 
 
 		 191 aa  204  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  51.96 
 
 		 179 aa  204  7e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  51.96 
 
 		 179 aa  204  7e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  52.12 
 
 		 182 aa  204  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0091  50S ribosomal protein L5  53.07 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0564705 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  52.12 
 
 		 182 aa  202  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  53.11 
 
 		 180 aa  203  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2762  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000046872  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  54.24 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4926  ribosomal protein L5  54.24 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000138257  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  51.4 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  51.4 
 
 		 179 aa  201  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  54.24 
 
 		 179 aa  202  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  50.84 
 
 		 179 aa  201  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  50.84 
 
 		 179 aa  201  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  50.28 
 
 		 179 aa  201  5e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  50.84 
 
 		 179 aa  201  7e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  53.94 
 
 		 191 aa  201  7e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2895  ribosomal protein L5  51.12 
 
 		 182 aa  200  7e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  50.84 
 
 		 179 aa  201  7e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  49.16 
 
 		 179 aa  200  8e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2053  50S ribosomal protein L5  51.4 
 
 		 179 aa  200  8e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00300411  normal  0.056988 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0672  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 		 179 aa  200  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1173  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 180 aa  199  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00494805  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  50.84 
 
 		 179 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  53.61 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  52.73 
 
 		 180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  48.6 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  52.73 
 
 		 180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  50.84 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  50.84 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  50.84 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>