More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1956 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1956  ribosomal protein L5  100 
 
 
181 aa  365  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1765  50S ribosomal protein L5  77.9 
 
 
181 aa  302  2.0000000000000002e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00103364  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1021  50S ribosomal protein L5  78.45 
 
 
181 aa  302  2.0000000000000002e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000164451  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0046  50S ribosomal protein L5  79.33 
 
 
180 aa  299  1e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.772489  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1863  50S ribosomal protein L5  77.35 
 
 
181 aa  296  2e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2069  50S ribosomal protein L5  76.8 
 
 
181 aa  295  2e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1692  50S ribosomal protein L5  77.35 
 
 
181 aa  296  2e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0046073  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0071  50S ribosomal protein L5  76.24 
 
 
181 aa  292  2e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0205797  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0096  50S ribosomal protein L5  74.03 
 
 
181 aa  291  3e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.428124  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0298  50S ribosomal protein L5  64.44 
 
 
181 aa  238  2.9999999999999997e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00106254  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 
179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 
179 aa  215  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  54.75 
 
 
179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 
179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 
179 aa  214  4e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 
179 aa  214  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 
179 aa  214  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 
179 aa  214  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 
179 aa  214  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 
179 aa  214  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 
179 aa  214  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 
179 aa  214  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 
179 aa  214  5e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  54.75 
 
 
179 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  54.75 
 
 
179 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  54.75 
 
 
179 aa  209  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  54.75 
 
 
179 aa  209  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  53.63 
 
 
179 aa  207  7e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  53.63 
 
 
179 aa  207  7e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  53.67 
 
 
179 aa  205  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  53.07 
 
 
179 aa  203  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  54.29 
 
 
187 aa  202  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  52.54 
 
 
179 aa  202  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  51.41 
 
 
180 aa  202  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  51.69 
 
 
180 aa  202  3e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  52.25 
 
 
180 aa  201  3e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  53.07 
 
 
179 aa  201  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  53.63 
 
 
182 aa  201  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  51.98 
 
 
179 aa  201  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  50 
 
 
180 aa  200  8e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  49.72 
 
 
184 aa  200  9e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  51.12 
 
 
180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  52.54 
 
 
179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  53.14 
 
 
220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2762  50S ribosomal protein L5  51.4 
 
 
179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000046872  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  52.25 
 
 
179 aa  199  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  49.72 
 
 
193 aa  198  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  51.12 
 
 
180 aa  198  3e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  50.86 
 
 
180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  50.28 
 
 
179 aa  197  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  51.96 
 
 
179 aa  197  7.999999999999999e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  51.96 
 
 
181 aa  197  9e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0091  50S ribosomal protein L5  50.28 
 
 
179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0564705 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  49.15 
 
 
179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  50.85 
 
 
179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  50.85 
 
 
181 aa  195  3e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  50.28 
 
 
180 aa  195  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01290  ribosomal protein L5  49.72 
 
 
179 aa  195  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.388904  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1848  ribosomal protein L5  49.72 
 
 
187 aa  195  4.0000000000000005e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.21039e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  51.98 
 
 
179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  51.4 
 
 
179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  52.84 
 
 
185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  50.28 
 
 
179 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  48.88 
 
 
198 aa  194  6e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2312  50S ribosomal protein L5  51.98 
 
 
179 aa  194  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.237365  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  50 
 
 
180 aa  193  1e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  48.04 
 
 
179 aa  192  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2245  50S ribosomal protein L5  50.28 
 
 
179 aa  193  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00560978  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  48.6 
 
 
179 aa  193  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0672  50S ribosomal protein L5  50.28 
 
 
179 aa  193  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3897  50S ribosomal protein L5  50.28 
 
 
179 aa  193  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000030586  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  49.15 
 
 
184 aa  192  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0607  50S ribosomal protein L5  50.28 
 
 
180 aa  192  2e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000230236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0385  50S ribosomal protein L5  54.24 
 
 
183 aa  192  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1753  50S ribosomal protein L5  50.28 
 
 
179 aa  192  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.182239  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  50.86 
 
 
183 aa  192  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1304  50S ribosomal protein L5  50.28 
 
 
193 aa  192  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240969  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  50.86 
 
 
193 aa  192  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1382  50S ribosomal protein L5  50.28 
 
 
184 aa  192  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00212588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  47.43 
 
 
180 aa  192  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3326  50S ribosomal protein L5  50.28 
 
 
179 aa  191  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000159394  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  47.49 
 
 
179 aa  191  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4926  ribosomal protein L5  48.02 
 
 
179 aa  191  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000138257  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1562  ribosomal protein L5  51.69 
 
 
180 aa  191  5e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00268047  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  49.71 
 
 
180 aa  191  7e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5067  50S ribosomal protein L5  49.72 
 
 
179 aa  191  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000562403  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  48.04 
 
 
179 aa  191  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  49.14 
 
 
190 aa  190  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0335  ribosomal protein L5  47.49 
 
 
179 aa  190  8e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000680284  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  50.84 
 
 
179 aa  190  9e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2978  50S ribosomal protein L5  51.98 
 
 
189 aa  190  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  47.16 
 
 
180 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05780  ribosomal protein L5  53.11 
 
 
183 aa  189  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  49.72 
 
 
180 aa  189  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  47.16 
 
 
180 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  46.37 
 
 
179 aa  190  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0638  ribosomal protein L5  49.15 
 
 
179 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000106157  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  46.37 
 
 
179 aa  189  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  50.28 
 
 
179 aa  189  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000918773  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  48.04 
 
 
179 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>