More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0278 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0278  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 177 aa  362  1e-99  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000073879  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  49.71 
 
 		 187 aa  195  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2053  50S ribosomal protein L5  50.86 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00300411  normal  0.056988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  46.86 
 
 		 179 aa  191  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  47.43 
 
 		 188 aa  191  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  46.86 
 
 		 188 aa  191  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  47.43 
 
 		 188 aa  191  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1753  50S ribosomal protein L5  50.29 
 
 		 179 aa  190  8e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.182239  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  46.29 
 
 		 179 aa  190  8e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  46.29 
 
 		 179 aa  190  8e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  47.43 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1848  ribosomal protein L5  48.3 
 
 		 187 aa  189  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.21039e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  47.43 
 
 		 178 aa  189  1e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1376  50S ribosomal protein L5  50.86 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  47.43 
 
 		 178 aa  190  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0091  50S ribosomal protein L5  49.71 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0564705 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  48 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  45.71 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  46.29 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  46.29 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  46.29 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  46.29 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  45.71 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  45.71 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  50.29 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  45.71 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  50.29 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  45.14 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  46.29 
 
 		 188 aa  187  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  47.43 
 
 		 197 aa  187  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  45.71 
 
 		 179 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  49.71 
 
 		 185 aa  187  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  46.29 
 
 		 188 aa  187  7e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  46.29 
 
 		 188 aa  187  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  47.16 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  46.59 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  44.57 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2307  50S ribosomal protein L5  48.57 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0101823  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  45.14 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  46.2 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  44.57 
 
 		 243 aa  185  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  45.14 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1557  50S ribosomal protein L5  49.71 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0438  50S ribosomal protein L5  44.57 
 
 		 178 aa  185  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121232  hitchhiker  0.000103446 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3655  50S ribosomal protein L5  48 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  46.55 
 
 		 193 aa  185  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  48.28 
 
 		 185 aa  184  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5058  50S ribosomal protein L5  48 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  45.45 
 
 		 179 aa  184  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0600  50S ribosomal protein L5  46.86 
 
 		 177 aa  184  6e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0797735  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  46.78 
 
 		 179 aa  184  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0672  50S ribosomal protein L5  49.14 
 
 		 179 aa  184  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  44.57 
 
 		 179 aa  184  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  44.57 
 
 		 179 aa  184  7e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04509  50S ribosomal protein L5  46.02 
 
 		 180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00526127  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  45.71 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0421  50S ribosomal protein L5  46.86 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.889596  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  44 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  45.98 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  43.43 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  45.71 
 
 		 181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  44.89 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3172  50S ribosomal protein L5  46.29 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  49.68 
 
 		 192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  47.73 
 
 		 180 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  46.29 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  44 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  47.73 
 
 		 180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  47.73 
 
 		 180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  47.73 
 
 		 180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  43.43 
 
 		 179 aa  181  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0779  50S ribosomal protein L5  44.89 
 
 		 179 aa  181  6e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000823313  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  54.61 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2245  50S ribosomal protein L5  47.43 
 
 		 179 aa  180  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00560978  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  46.29 
 
 		 179 aa  180  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  43.43 
 
 		 179 aa  180  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  43.43 
 
 		 179 aa  180  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  43.43 
 
 		 179 aa  180  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  43.43 
 
 		 179 aa  180  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  43.43 
 
 		 179 aa  180  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  44 
 
 		 179 aa  180  9.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  44 
 
 		 179 aa  180  9.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  47.43 
 
 		 178 aa  180  9.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  43.18 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0965  50S ribosomal protein L5  47.43 
 
 		 182 aa  179  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.190105  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0349  50S ribosomal protein L5  44.32 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000265195  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  44 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  45.14 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  42.86 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  44.57 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  43.43 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0335  ribosomal protein L5  44 
 
 		 179 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000680284  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  44 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1842  50S ribosomal protein L5  44.32 
 
 		 182 aa  179  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0768  50S ribosomal protein L5  43.75 
 
 		 180 aa  178  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0251429  normal  0.0345896 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  43.43 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0710  50S ribosomal protein L5  53.59 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00257527  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0340  50S ribosomal protein L5  42.29 
 
 		 181 aa  178  4e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0771  50S ribosomal protein L5  45.98 
 
 		 186 aa  178  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542997  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  44.57 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>