More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0046 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0046  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 180 aa  363  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.772489  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1765  50S ribosomal protein L5  87.15 
 
 		 181 aa  325  2.0000000000000001e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00103364  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1021  50S ribosomal protein L5  87.15 
 
 		 181 aa  324  4.0000000000000003e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000164451  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1863  50S ribosomal protein L5  84.44 
 
 		 181 aa  315  3e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1692  50S ribosomal protein L5  84.44 
 
 		 181 aa  315  3e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0046073  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2069  50S ribosomal protein L5  83.89 
 
 		 181 aa  314  4e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0071  50S ribosomal protein L5  83.33 
 
 		 181 aa  311  2.9999999999999996e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0205797  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0096  50S ribosomal protein L5  82.12 
 
 		 181 aa  308  2e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.428124  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1956  ribosomal protein L5  79.33 
 
 		 181 aa  299  1e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0298  50S ribosomal protein L5  66.85 
 
 		 181 aa  245  2e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00106254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  210  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  210  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  210  7e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  210  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  210  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  210  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  54.49 
 
 		 198 aa  210  7.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  210  9e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  207  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 		 179 aa  208  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  53.71 
 
 		 180 aa  206  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  53.67 
 
 		 179 aa  206  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0965  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 182 aa  206  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.190105  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  52.25 
 
 		 179 aa  206  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  54.29 
 
 		 193 aa  204  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1382  50S ribosomal protein L5  53.67 
 
 		 184 aa  204  5e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00212588  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1304  50S ribosomal protein L5  53.67 
 
 		 193 aa  204  7e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240969  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  54.02 
 
 		 179 aa  204  7e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  53.71 
 
 		 179 aa  203  9e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  53.71 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0778  50S ribosomal protein L5  54.55 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.807556  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  51.98 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  53.41 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  52.54 
 
 		 179 aa  202  3e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  53.11 
 
 		 180 aa  202  3e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1727  50S ribosomal protein L5  54.29 
 
 		 186 aa  201  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  52.57 
 
 		 192 aa  201  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  51.41 
 
 		 179 aa  201  6e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0373  50S ribosomal protein L5  53.71 
 
 		 186 aa  200  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  50.86 
 
 		 179 aa  200  8e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  51.98 
 
 		 179 aa  200  9e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  51.98 
 
 		 179 aa  200  9e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  51.98 
 
 		 180 aa  199  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  53.71 
 
 		 193 aa  199  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  52 
 
 		 179 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  52.81 
 
 		 182 aa  199  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0771  50S ribosomal protein L5  54.29 
 
 		 186 aa  200  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542997  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  50.85 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0297  50S ribosomal protein L5  52.27 
 
 		 187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  52 
 
 		 178 aa  198  3e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  51.98 
 
 		 179 aa  198  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  54.86 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0438  50S ribosomal protein L5  52 
 
 		 178 aa  199  3e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121232  hitchhiker  0.000103446 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  53.67 
 
 		 180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  49.72 
 
 		 184 aa  197  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  52 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  51.43 
 
 		 178 aa  197  5e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2762  50S ribosomal protein L5  50.57 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000046872  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  51.98 
 
 		 180 aa  197  5e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  50.28 
 
 		 179 aa  197  6e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2522  50S ribosomal protein L5  52.57 
 
 		 186 aa  197  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  50.28 
 
 		 179 aa  197  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  51.41 
 
 		 179 aa  197  7e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  51.41 
 
 		 179 aa  197  7e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2312  50S ribosomal protein L5  53.14 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.237365  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  51.43 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0091  50S ribosomal protein L5  51.98 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0564705 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  52.57 
 
 		 220 aa  196  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  51.41 
 
 		 180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  52 
 
 		 179 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  53.14 
 
 		 179 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000918773  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  52 
 
 		 187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  51.41 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  49.72 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  52.57 
 
 		 190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3897  50S ribosomal protein L5  51.43 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000030586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  52.84 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2312  50S ribosomal protein L5  50.29 
 
 		 181 aa  195  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000116558  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0672  50S ribosomal protein L5  51.41 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1562  ribosomal protein L5  53.11 
 
 		 180 aa  195  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00268047  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  50 
 
 		 180 aa  195  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  52.57 
 
 		 188 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  52.57 
 
 		 188 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  51.74 
 
 		 179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  50.28 
 
 		 179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  51.14 
 
 		 179 aa  194  5.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  53.14 
 
 		 189 aa  194  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  49.71 
 
 		 180 aa  194  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1126  50S ribosomal protein L5  52.27 
 
 		 184 aa  194  5.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0974998  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  49.71 
 
 		 180 aa  194  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  50.28 
 
 		 179 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  50.28 
 
 		 179 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2245  50S ribosomal protein L5  51.41 
 
 		 179 aa  194  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00560978  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1753  50S ribosomal protein L5  51.41 
 
 		 179 aa  194  6e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.182239  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  50.28 
 
 		 179 aa  194  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  50.57 
 
 		 180 aa  194  6e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>