More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4662 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4662  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 
480 aa  922    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3371  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  65.49 
 
 
484 aa  503  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00556392  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4021  RND efflux system outer membrane lipoprotein  63.18 
 
 
483 aa  481  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227062  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3900  RND efflux system outer membrane lipoprotein  58.74 
 
 
488 aa  434  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.362136  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4106  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  50.11 
 
 
485 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0438089  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2412  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  51.5 
 
 
498 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  45.53 
 
 
525 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3473  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  45.53 
 
 
525 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0809824  normal  0.12883 
 
 
-
 
NC_003296  RS01780  outer membrane CHANEL lipoprotein  45.37 
 
 
522 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05806  putative outer membrane lipoprotein  43.14 
 
 
490 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2135  putative outer membrane channel lipoprotein  44.7 
 
 
483 aa  276  8e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0693732  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2620  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.15 
 
 
476 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250647  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2969  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.06 
 
 
521 aa  269  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0473901 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7487  nodulation protein T precursor  34.79 
 
 
490 aa  260  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5661  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.92 
 
 
474 aa  249  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.434988 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1415  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  37 
 
 
520 aa  194  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3560  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.1 
 
 
493 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3184  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.83 
 
 
475 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3547  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.09 
 
 
477 aa  169  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.138729  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1872  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.06 
 
 
509 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0321  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.71 
 
 
480 aa  168  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.94 
 
 
496 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.94 
 
 
496 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.78 
 
 
489 aa  167  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2616  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.76 
 
 
501 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2799  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.72 
 
 
495 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0814  outer membrane protein  32.75 
 
 
479 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6200  multidrug efflux system outer membrane subunit  30.56 
 
 
504 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.584656  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2819  outer membrane protein OprJ  31.57 
 
 
468 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.980235 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.11 
 
 
487 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1481  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.84 
 
 
491 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.290116  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0387  Fis family transcriptional regulator  32.3 
 
 
492 aa  161  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0316  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.03 
 
 
481 aa  160  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.464824  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.29 
 
 
504 aa  160  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3590  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  31.47 
 
 
491 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.97 
 
 
489 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4150  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.75 
 
 
472 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4060  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.73 
 
 
492 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1884  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.43 
 
 
464 aa  157  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0017284  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5237  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.44 
 
 
516 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776503  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.64 
 
 
486 aa  156  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0812696  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.51 
 
 
475 aa  156  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0722212  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3442  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.74 
 
 
496 aa  156  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.811835  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2332  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.8 
 
 
496 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3582  RND efflux transporter  30.6 
 
 
496 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109729  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1595  multidrug efflux system outer membrane subunit  28.57 
 
 
520 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2680  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.01 
 
 
490 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1591  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.84 
 
 
481 aa  155  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000292967 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2189  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.6 
 
 
496 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.250734  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0783  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.26 
 
 
493 aa  154  5e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436637  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2240  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.8 
 
 
518 aa  153  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.72 
 
 
482 aa  153  8e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1855  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.62 
 
 
464 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.859631  normal  0.291675 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.98 
 
 
495 aa  152  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2695  outer membrane efflux protein  31.69 
 
 
512 aa  151  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2809  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.33 
 
 
497 aa  151  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2283  outer membrane efflux protein  30.32 
 
 
501 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0628456 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3923  outer membrane efflux protein  29.07 
 
 
569 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.19723 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2756  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.65 
 
 
469 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0415066  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6027  nodulation protein T precursor  30.67 
 
 
483 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1683  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.9 
 
 
479 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1397  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.35 
 
 
483 aa  150  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0470639  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0699  hypothetical protein  27.27 
 
 
489 aa  150  7e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5856  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.43 
 
 
493 aa  150  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2742  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.29 
 
 
517 aa  149  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3497  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.08 
 
 
470 aa  149  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2820  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.29 
 
 
517 aa  149  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  32.47 
 
 
491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2524  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.02 
 
 
489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670028  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0811  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.88 
 
 
517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173561 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.69 
 
 
467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.41681  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2816  outer membrane efflux family protein  32.91 
 
 
482 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.719657  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  29.55 
 
 
503 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.85 
 
 
499 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.79 
 
 
477 aa  146  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2756  outer membrane efflux protein  28.31 
 
 
490 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0289  outer membrane protein OmpK  27.65 
 
 
474 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0400  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.78 
 
 
494 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3443  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.06 
 
 
486 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267273  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  27.45 
 
 
479 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.16 
 
 
493 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2451  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.52 
 
 
514 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1557  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.94 
 
 
495 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.275301  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2178  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.02 
 
 
479 aa  144  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6609  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.12 
 
 
510 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64888  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0887  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.54 
 
 
586 aa  144  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000421492  hitchhiker  0.0000263613 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.36 
 
 
477 aa  144  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.321053 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0105  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.96 
 
 
457 aa  144  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265235  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.11 
 
 
489 aa  143  5e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.01 
 
 
501 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  28.72 
 
 
498 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2963  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  32.39 
 
 
487 aa  143  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.84 
 
 
505 aa  143  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2559  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.66 
 
 
527 aa  143  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2194  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.6 
 
 
518 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0247365  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1570  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.13 
 
 
473 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28780  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.17 
 
 
512 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506262  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1871  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.36 
 
 
485 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.97882  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.88 
 
 
474 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  33.55 
 
 
471 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>