1212 genes were found for organism Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 13    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Rpic12D_3462  CDS  NC_012857  67  1413  +  1347  homogentisate 1,2-dioxygenase  YP_002983397  normal  0.311936  normal  0.0988393  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3463  CDS  NC_012857  1720  2991  +  1272  fumarylacetoacetase  YP_002983398  normal  1  normal  0.211156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3464  CDS  NC_012857  3031  3669  -  639  FMN-binding negative transcriptional regulator  YP_002983399  normal  1  normal  0.272985  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3465  CDS  NC_012857  3793  5103  -  1311  ABC transporter related  YP_002983400  normal  1  normal  0.320704  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3466  CDS  NC_012857  5109  6842  -  1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002983401  normal  1  normal  0.222584  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3467  CDS  NC_012857  6980  8137  -  1158  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  YP_002983402  normal  1  normal  0.0842785  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3468  CDS  NC_012857  8250  9170  +  921  transcriptional regulator, LysR family  YP_002983403  normal  1  normal  0.127829  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3469  CDS  NC_012857  9171  10088  -  918  transcriptional regulator, LysR family  YP_002983404  normal  1  normal  0.0811329  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3470  CDS  NC_012857  10209  12539  +  2331  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine S-methyltransferase  YP_002983405  normal  1  normal  0.0697271  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3471  CDS  NC_012857  12656  15757  -  3102  acriflavin resistance protein  YP_002983406  normal  0.0282385  normal  0.0800862  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3472  CDS  NC_012857  15754  16893  -  1140  efflux transporter, RND family, MFP subunit  YP_002983407  decreased coverage  0.000321827  normal  0.111591  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3473  CDS  NC_012857  16890  18467  -  1578  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  YP_002983408  normal  0.0809824  normal  0.12883  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3474  CDS  NC_012857  18600  18755  -  156  hypothetical protein  YP_002983409  normal  0.0167723  normal  0.141558  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3475  CDS  NC_012857  18942  19823  +  882  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  YP_002983410  normal  0.128821  normal  0.109237  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3476  CDS  NC_012857  19910  21124  +  1215  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002983411  normal  0.375815  normal  0.126781  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3477  CDS  NC_012857  21135  21701  -  567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  YP_002983412  normal  1  normal  0.112409  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3478  CDS  NC_012857  21713  22684  -  972  Mg2 transporter protein CorA family protein  YP_002983413  normal  1  normal  0.119189  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3479  CDS  NC_012857  22703  23200  -  498  transcriptional regulator, MarR family  YP_002983414  normal  0.891709  normal  0.101861  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3480  CDS  NC_012857  23263  24855  -  1593  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002983415  normal  1  normal  0.129698  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3481  CDS  NC_012857  25044  27629  -  2586  bifunctional aconitate hydratase 2/2-methylisocitrate dehydratase  YP_002983416  normal  0.62532  normal  0.249237  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3482  CDS  NC_012857  28002  28295  +  294  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  YP_002983417  normal  0.688617  normal  0.1473  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3483  CDS  NC_012857  28409  29353  -  945  hypothetical protein  YP_002983418  normal  0.556411  normal  0.164721  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3484  CDS  NC_012857  29476  30354  -  879  transcriptional regulator, LysR family  YP_002983419  normal  0.5787  normal  0.103031  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3485  CDS  NC_012857  30452  32035  +  1584  NADH dehydrogenase subunit L  YP_002983420  normal  1  normal  0.343885  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3486  CDS  NC_012857  32056  34638  +  2583  hypothetical protein  YP_002983421  normal  1  normal  0.4063  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3487  CDS  NC_012857  34705  35892  +  1188  acyltransferase 3  YP_002983422  normal  0.547681  normal  0.220575  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3488  CDS  NC_012857  35882  36700  -  819  Methyltransferase type 11  YP_002983423  normal  1  normal  0.299223  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3489    NC_012857  36845  37347  +  503      normal  1  normal  0.280482  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3490  CDS  NC_012857  37411  38034  +  624  transcriptional regulator, TetR family  YP_002983424  normal  1  normal  0.20919  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3491  CDS  NC_012857  38019  39113  -  1095  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  YP_002983425  normal  1  normal  0.168778  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3492  CDS  NC_012857  39123  39674  -  552  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  YP_002983426  normal  1  normal  0.318396  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3493  CDS  NC_012857  39668  40468  -  801  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaI subunit  YP_002983427  normal  1  normal  0.236613  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3494  CDS  NC_012857  40478  40765  -  288  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaB  YP_002983428  normal  1  normal  0.144039  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3495  CDS  NC_012857  40782  41801  -  1020  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  YP_002983429  normal  1  normal  0.174719  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3496  CDS  NC_012857  41946  43394  -  1449  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  YP_002983430  normal  0.152282  normal  0.192769  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3497  CDS  NC_012857  43494  43925  -  432  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  YP_002983431  normal  0.35175  normal  0.404774  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3498  CDS  NC_012857  44074  44457  -  384  Ketosteroid isomerase-like protein  YP_002983432  normal  0.481588  normal  0.403551  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3499  CDS  NC_012857  44579  45223  +  645  transcriptional regulator, TetR family  YP_002983433  normal  0.553383  normal  0.3226  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3500  CDS  NC_012857  45300  45821  +  522  hypothetical protein  YP_002983434  normal  0.0357475  normal  0.416536  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3501  CDS  NC_012857  45876  46826  -  951  response regulator receiver modulated CheW protein  YP_002983435  normal  0.096074  normal  0.598076  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3502  CDS  NC_012857  47566  48864  -  1299  hypothetical protein  YP_002983436  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3503  CDS  NC_012857  48861  49898  -  1038  AAA ATPase  YP_002983437  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3504  CDS  NC_012857  49908  52610  -  2703  Integrase catalytic region  YP_002983438  normal  0.661692  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3505  CDS  NC_012857  52759  53058  +  300  hypothetical protein  YP_002983439  normal  0.121248  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3506  CDS  NC_012857  53893  54282  +  390  hypothetical protein  YP_002983440  normal  0.226474  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3507  CDS  NC_012857  54557  54886  -  330  hypothetical protein  YP_002983441  normal  0.446944  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3508  CDS  NC_012857  55244  55396  -  153  hypothetical protein  YP_002983442  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3509  CDS  NC_012857  55650  55940  -  291  hypothetical protein  YP_002983443  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3510  CDS  NC_012857  56247  57260  -  1014  hypothetical protein  YP_002983444  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3511  CDS  NC_012857  57263  58270  -  1008  hypothetical protein  YP_002983445  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3512    NC_012857  58925  59407  +  483      normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3513  CDS  NC_012857  59662  60387  -  726  17 kDa surface antigen  YP_002983446  normal  0.673151  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3514  CDS  NC_012857  60754  60957  -  204  hypothetical protein  YP_002983447  normal  0.264165  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3515  CDS  NC_012857  61702  61836  +  135  hypothetical protein  YP_002983448  normal  0.339614  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3516  CDS  NC_012857  61931  62323  +  393  hypothetical protein  YP_002983449  normal  0.313891  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3517  CDS  NC_012857  62491  63141  +  651  hypothetical protein  YP_002983450  normal  0.0467126  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3518  CDS  NC_012857  63989  64747  -  759  protein of unknown function DUF347  YP_002983451  normal  0.301714  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3519  CDS  NC_012857  65456  66769  +  1314  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002983452  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3520  CDS  NC_012857  66887  67447  -  561  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  YP_002983453  normal  0.857138  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3521  CDS  NC_012857  67773  68324  -  552  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_002983454  normal  0.351274  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3522  CDS  NC_012857  68328  68537  -  210  hypothetical protein  YP_002983455  normal  0.115812  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3523  CDS  NC_012857  68643  69083  -  441  hypothetical protein  YP_002983456  normal  0.0134748  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3524  CDS  NC_012857  69196  69924  -  729  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  YP_002983457  normal  0.239201  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3525  CDS  NC_012857  69924  70310  -  387  Thioredoxin domain protein  YP_002983458  normal  0.513907  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3526  CDS  NC_012857  70494  70733  +  240  hypothetical protein  YP_002983459  normal  0.28808  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3527  CDS  NC_012857  70703  71431  +  729  hypothetical protein  YP_002983460  normal  0.942845  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3528  CDS  NC_012857  71744  72643  -  900  transcriptional regulator, LysR family  YP_002983461  normal  0.365912  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3529  CDS  NC_012857  72709  73275  +  567  hypothetical protein  YP_002983462  normal  0.0813209  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3530    NC_012857  73344  73542  +  199      normal  0.0207925  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3531  CDS  NC_012857  73548  73979  +  432  copper resistance protein CopC  YP_002983463  normal  0.0355537  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3532  CDS  NC_012857  73979  74923  +  945  copper resistance D domain protein  YP_002983464  normal  0.264949  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3533  CDS  NC_012857  75135  77495  +  2361  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_002983465  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3534  CDS  NC_012857  77850  78710  -  861  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  YP_002983466  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3535  CDS  NC_012857  79314  79889  +  576  transcriptional regulator, TetR family  YP_002983467  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3536  CDS  NC_012857  80217  81980  +  1764  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  YP_002983468  normal  0.220147  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3537  CDS  NC_012857  82256  83680  +  1425  Phospholipase C  YP_002983469  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3538  CDS  NC_012857  83684  84898  +  1215  phosphoesterase  YP_002983470  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3539  CDS  NC_012857  85053  86279  +  1227  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  YP_002983471  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3540  CDS  NC_012857  86542  86733  -  192  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  YP_002983472  normal  0.963519  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3541  CDS  NC_012857  86778  87824  -  1047  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  YP_002983473  normal  0.236803  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3542  CDS  NC_012857  87838  88773  -  936  acetaldehyde dehydrogenase  YP_002983474  normal  0.121527  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3543  CDS  NC_012857  88811  89602  -  792  4-oxalocrotonate decarboxylase  YP_002983475  normal  0.0271382  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3544  CDS  NC_012857  89632  90414  -  783  2-oxopent-4-enoate hydratase  YP_002983476  normal  0.127016  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3545  CDS  NC_012857  90440  91291  -  852  alpha/beta hydrolase fold protein  YP_002983477  normal  0.158387  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3546  CDS  NC_012857  91288  92742  -  1455  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  YP_002983478  normal  0.740042  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3547  CDS  NC_012857  92792  93244  -  453  protein of unknown function DUF336  YP_002983479  normal  0.220532  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3548  CDS  NC_012857  93303  94247  -  945  catechol 2,3 dioxygenase  YP_002983480  normal  0.15689  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3549  CDS  NC_012857  94271  94636  -  366  ferredoxin  YP_002983481  normal  0.171843  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3550  CDS  NC_012857  94652  95716  -  1065  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  YP_002983482  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3551  CDS  NC_012857  95720  96085  -  366  Phenol hydroxylase conserved region  YP_002983483  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3552  CDS  NC_012857  96082  97626  -  1545  methane/phenol/toluene hydroxylase  YP_002983484  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3553  CDS  NC_012857  97672  97941  -  270  monooxygenase component MmoB/DmpM  YP_002983485  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3554  CDS  NC_012857  97977  98984  -  1008  Phenol 2-monooxygenase  YP_002983486  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3555  CDS  NC_012857  99040  99249  -  210  Phenol hydroxylase subunit  YP_002983487  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3556  CDS  NC_012857  99964  101469  +  1506  methane/phenol/toluene hydroxylase  YP_002983488  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3557  CDS  NC_012857  101494  101754  +  261  Toluene-4-monooxygenase system B  YP_002983489  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3558  CDS  NC_012857  101762  102097  +  336  Rieske (2Fe-2S) domain protein  YP_002983490  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3559  CDS  NC_012857  102117  102431  +  315  monooxygenase component MmoB/DmpM  YP_002983491  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3560  CDS  NC_012857  102444  103433  +  990  methane/phenol/toluene hydroxylase  YP_002983492  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_3561  CDS  NC_012857  103471  104502  +  1032  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  YP_002983493  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 13    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>