30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3559 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3559  monooxygenase component MmoB/DmpM  100 
 
 		 104 aa  209  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4635  monooxygenase component MmoB/DmpM  100 
 
 		 104 aa  209  7e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5676  monooxygenase component MmoB/DmpM  93.33 
 
 		 105 aa  196  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1313  monooxygenase component MmoB/DmpM  68.27 
 
 		 104 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3817  monooxygenase component MmoB/DmpM  57.69 
 
 		 146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0643335  normal  0.059628 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2542  toluene monooxygenase activator  54.46 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0817  toluene monooxygenase activator  50.98 
 
 		 102 aa  120  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4860  monooxygenase component MmoB/DmpM  44.94 
 
 		 101 aa  87.4  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111656  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1595  toluene-4-monooxygenase system protein D  45.12 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3114  monooxygenase component MmoB/DmpM  37.35 
 
 		 89 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3307  phenol hydrolase activator  44.74 
 
 		 96 aa  67  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.560355  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2199  monooxygenase component MmoB/DmpM  37.36 
 
 		 115 aa  67  0.00000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.031469  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0543  monooxygenase component MmoB/DmpM  37.5 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.13468  normal  0.713388 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1785  monooxygenase component MmoB/DmpM  41.1 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4629  monooxygenase component MmoB/DmpM  36.9 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3553  monooxygenase component MmoB/DmpM  36.9 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5682  monooxygenase component MmoB/DmpM  36.59 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0525  monooxygenase component MmoB/DmpM  40.3 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0214  monooxygenase component MmoB/DmpM  34.07 
 
 		 101 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.222337 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2283  phenol hydrolase activator  34.15 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3795  monooxygenase component MmoB/DmpM  32.47 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0289368  hitchhiker  0.00231767 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2794  monooxygenase component MmoB/DmpM  34.67 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30740  Multi-component phenol hydoxylase, activator subunit; LapM  31.71 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1701  monooxygenase component MmoB/DmpM  37.35 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.687174  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3361  monooxygenase component MmoB/DmpM  33.33 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3309  monooxygenase component MmoB/DmpM  27.4 
 
 		 89 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0208  monooxygenase component MmoB/DmpM  32 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2969  monooxygenase component MmoB/DmpM  31.51 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4808  monooxygenase component MmoB/DmpM  31.03 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1329  monooxygenase component MmoB/DmpM  25 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>