28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3309 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3309  monooxygenase component MmoB/DmpM  100 
 
 		 89 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08840  phenol hydroxylase, monooxygenase component P2  67.42 
 
 		 89 aa  134  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1785  monooxygenase component MmoB/DmpM  54.65 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1701  monooxygenase component MmoB/DmpM  51.69 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.687174  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3795  monooxygenase component MmoB/DmpM  48.84 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0289368  hitchhiker  0.00231767 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30740  Multi-component phenol hydoxylase, activator subunit; LapM  48.28 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2283  phenol hydrolase activator  49.41 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3114  monooxygenase component MmoB/DmpM  45.35 
 
 		 89 aa  93.6  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2794  monooxygenase component MmoB/DmpM  43.02 
 
 		 89 aa  90.9  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3307  phenol hydrolase activator  46.43 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.560355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5682  monooxygenase component MmoB/DmpM  43.68 
 
 		 89 aa  90.1  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1329  monooxygenase component MmoB/DmpM  44.19 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2969  monooxygenase component MmoB/DmpM  45.98 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4629  monooxygenase component MmoB/DmpM  41.86 
 
 		 89 aa  86.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3553  monooxygenase component MmoB/DmpM  41.86 
 
 		 89 aa  86.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3361  monooxygenase component MmoB/DmpM  41.86 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0208  monooxygenase component MmoB/DmpM  39.29 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0525  monooxygenase component MmoB/DmpM  41.98 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5676  monooxygenase component MmoB/DmpM  28.77 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4635  monooxygenase component MmoB/DmpM  27.4 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3559  monooxygenase component MmoB/DmpM  27.4 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3817  monooxygenase component MmoB/DmpM  26.97 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0643335  normal  0.059628 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2542  toluene monooxygenase activator  28.57 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0817  toluene monooxygenase activator  31.17 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0953  propane monoxygenase coupling protein  33.33 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.621894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1313  monooxygenase component MmoB/DmpM  26.32 
 
 		 104 aa  42  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1378  monooxygenase component MmoB/DmpM  30.95 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3394  phenol 2-monooxygenase  32.1 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.781882  normal  0.175672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>