25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3553 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3553  monooxygenase component MmoB/DmpM  100 
 
 		 89 aa  183  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4629  monooxygenase component MmoB/DmpM  100 
 
 		 89 aa  183  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5682  monooxygenase component MmoB/DmpM  96.63 
 
 		 89 aa  179  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3361  monooxygenase component MmoB/DmpM  83.15 
 
 		 89 aa  154  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0208  monooxygenase component MmoB/DmpM  82.02 
 
 		 89 aa  154  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2794  monooxygenase component MmoB/DmpM  83.15 
 
 		 89 aa  153  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2969  monooxygenase component MmoB/DmpM  76.4 
 
 		 89 aa  142  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1329  monooxygenase component MmoB/DmpM  69.66 
 
 		 89 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30740  Multi-component phenol hydoxylase, activator subunit; LapM  64.77 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3795  monooxygenase component MmoB/DmpM  61.8 
 
 		 89 aa  123  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0289368  hitchhiker  0.00231767 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3114  monooxygenase component MmoB/DmpM  57.3 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1785  monooxygenase component MmoB/DmpM  56.47 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2283  phenol hydrolase activator  57.14 
 
 		 105 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1701  monooxygenase component MmoB/DmpM  57.14 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.687174  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3307  phenol hydrolase activator  57.65 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.560355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0525  monooxygenase component MmoB/DmpM  50 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3309  monooxygenase component MmoB/DmpM  41.86 
 
 		 89 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08840  phenol hydroxylase, monooxygenase component P2  41.86 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4635  monooxygenase component MmoB/DmpM  36.9 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3559  monooxygenase component MmoB/DmpM  36.9 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5676  monooxygenase component MmoB/DmpM  36.9 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1313  monooxygenase component MmoB/DmpM  36.9 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0817  toluene monooxygenase activator  33.33 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3817  monooxygenase component MmoB/DmpM  32.93 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0643335  normal  0.059628 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2542  toluene monooxygenase activator  30.12 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.365373 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>