21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3498 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3498  Ketosteroid isomerase-like protein  100 
 
 		 127 aa  259  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.481588  normal  0.403551 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4570  Ketosteroid isomerase-like protein  100 
 
 		 127 aa  259  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.432732 
 
 
-
 
NC_003296  RS03879  hypothetical protein  65.66 
 
 		 143 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6230  hypothetical protein  38.83 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4023  hypothetical protein  39.08 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4253  hypothetical protein  39.08 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0446554 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4098  hypothetical protein  39.08 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0429  hypothetical protein  34.83 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434725  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0239  hypothetical protein  35.16 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915444 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2146  hypothetical protein  35.96 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3153  hypothetical protein  32.95 
 
 		 286 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.285807  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2121  hypothetical protein  34.83 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0951  hypothetical protein  34.83 
 
 		 282 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0660  hypothetical protein  32.47 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07250  hypothetical protein  31.17 
 
 		 218 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4556  hypothetical protein  29.07 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1333  hypothetical protein  29.07 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.132066 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05460  hypothetical protein  29.55 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4063  hypothetical protein  29.07 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4328  hypothetical protein  27.5 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.295995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1336  ketosteroid isomerase-like protein  33.96 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916709  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>