40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6230 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6230  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  299  9e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0429  hypothetical protein  64.29 
 
 		 132 aa  175  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434725  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3153  hypothetical protein  64.57 
 
 		 286 aa  174  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.285807  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0239  hypothetical protein  57.14 
 
 		 138 aa  168  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915444 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4253  hypothetical protein  62.1 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0446554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4023  hypothetical protein  62.1 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4098  hypothetical protein  62.1 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0951  hypothetical protein  61.24 
 
 		 282 aa  167  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05460  hypothetical protein  55.2 
 
 		 129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03879  hypothetical protein  38.89 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0660  hypothetical protein  39.34 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07250  hypothetical protein  35.38 
 
 		 218 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4556  hypothetical protein  35.2 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1333  hypothetical protein  35.2 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.132066 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4570  Ketosteroid isomerase-like protein  38.83 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.432732 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3498  Ketosteroid isomerase-like protein  38.83 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.481588  normal  0.403551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4063  hypothetical protein  35.2 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.59 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130603 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2146  hypothetical protein  29.51 
 
 		 148 aa  67  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2121  hypothetical protein  29.51 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4168  hypothetical protein  31.5 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1336  ketosteroid isomerase-like protein  26.19 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4875  hypothetical protein  28.12 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0164679 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4328  hypothetical protein  27.69 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.295995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3851  hypothetical protein  31.25 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05450  ketosteroid isomerase-like enzyme  28.91 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0220  hypothetical protein  30.71 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.629551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2557  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0390  hypothetical protein  25 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0249  hypothetical protein  29.23 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4101  hypothetical protein  32.46 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46080  hypothetical protein  31.78 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.819422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3919  hypothetical protein  31.78 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0512  hypothetical protein  34.59 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.693618  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1087  hypothetical protein  34.59 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2143  Calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain protein  28.68 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5240  hypothetical protein  30.77 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2316  hypothetical protein  34.59 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2194  hypothetical protein  34.59 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.449073  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2247  hypothetical protein  28.32 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0117499  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>