30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4328 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4328  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  300  6.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.295995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1336  ketosteroid isomerase-like protein  48.92 
 
 		 140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916709  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2146  hypothetical protein  51.85 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2121  hypothetical protein  50.37 
 
 		 148 aa  156  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0660  hypothetical protein  50.36 
 
 		 141 aa  153  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07250  hypothetical protein  49.3 
 
 		 218 aa  150  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4556  hypothetical protein  47.86 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1333  hypothetical protein  47.86 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.132066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4063  hypothetical protein  47.55 
 
 		 141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3851  hypothetical protein  48.41 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4875  hypothetical protein  30.94 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0164679 
 
 
-
 
NC_003296  RS03879  hypothetical protein  32 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4168  hypothetical protein  32.37 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4253  hypothetical protein  32.54 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0446554 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4098  hypothetical protein  32.54 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4023  hypothetical protein  32.54 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0429  hypothetical protein  29.6 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434725  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05460  hypothetical protein  31.45 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0239  hypothetical protein  26.98 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0951  hypothetical protein  26.77 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3153  hypothetical protein  29.13 
 
 		 286 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.285807  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.68 
 
 		 288 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6230  hypothetical protein  27.69 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0249  hypothetical protein  29.75 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0220  hypothetical protein  27.74 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.629551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2545  hypothetical protein  31.01 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3076  hypothetical protein  28.68 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05450  ketosteroid isomerase-like enzyme  21.74 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3498  Ketosteroid isomerase-like protein  27.5 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.481588  normal  0.403551 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4570  Ketosteroid isomerase-like protein  27.5 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.432732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>