38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0660 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0660  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  298  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07250  hypothetical protein  92.2 
 
 
218 aa  278  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4556  hypothetical protein  56.2 
 
 
141 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1333  hypothetical protein  56.2 
 
 
141 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.132066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4063  hypothetical protein  55.47 
 
 
141 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2121  hypothetical protein  48.57 
 
 
148 aa  156  7e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2146  hypothetical protein  47.86 
 
 
148 aa  156  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4328  hypothetical protein  50.36 
 
 
141 aa  153  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.295995  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1336  ketosteroid isomerase-like protein  50.37 
 
 
140 aa  149  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916709  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3851  hypothetical protein  54.4 
 
 
125 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.41 
 
 
288 aa  89.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6230  hypothetical protein  39.34 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_003296  RS03879  hypothetical protein  36.07 
 
 
143 aa  84.7  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4875  hypothetical protein  31.88 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0164679 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4168  hypothetical protein  32.61 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0429  hypothetical protein  31.54 
 
 
132 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434725  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0951  hypothetical protein  37.4 
 
 
282 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4253  hypothetical protein  37.01 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0446554 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4098  hypothetical protein  37.01 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204789  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4023  hypothetical protein  37.01 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0249  hypothetical protein  37.93 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150552  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3153  hypothetical protein  38.93 
 
 
286 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.285807  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0220  hypothetical protein  35.71 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.629551  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0239  hypothetical protein  30 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0915444 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05460  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2545  hypothetical protein  32.74 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05450  ketosteroid isomerase-like enzyme  27.41 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3498  Ketosteroid isomerase-like protein  32.47 
 
 
127 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.481588  normal  0.403551 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4570  Ketosteroid isomerase-like protein  32.47 
 
 
127 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.432732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3076  hypothetical protein  24.63 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499668  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2316  hypothetical protein  27.61 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0512  hypothetical protein  27.61 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.693618  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1087  hypothetical protein  27.61 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2194  hypothetical protein  27.61 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.449073  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2557  hypothetical protein  26.98 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5240  hypothetical protein  29.66 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3310  hypothetical protein  27.34 
 
 
133 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3266  hypothetical protein  27.34 
 
 
133 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>