39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03879 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03879  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  295  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3498  Ketosteroid isomerase-like protein  65.66 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.481588  normal  0.403551 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4570  Ketosteroid isomerase-like protein  65.66 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.432732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4023  hypothetical protein  38.89 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4098  hypothetical protein  38.89 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4253  hypothetical protein  38.89 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0446554 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2146  hypothetical protein  36.88 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2121  hypothetical protein  36.43 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6230  hypothetical protein  38.89 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0429  hypothetical protein  33.85 
 
 		 132 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434725  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0239  hypothetical protein  33.82 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4875  hypothetical protein  36.57 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0164679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4063  hypothetical protein  37.9 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0660  hypothetical protein  36.07 
 
 		 141 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4113  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0220  hypothetical protein  35.77 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.629551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1336  ketosteroid isomerase-like protein  32.8 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1333  hypothetical protein  37.1 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.132066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4556  hypothetical protein  37.1 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.29 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130603 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07250  hypothetical protein  32.06 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4168  hypothetical protein  38.76 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4328  hypothetical protein  32 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.295995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3153  hypothetical protein  33.83 
 
 		 286 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.285807  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0951  hypothetical protein  35.94 
 
 		 282 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0249  hypothetical protein  34.31 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2545  hypothetical protein  35.35 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3851  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05460  hypothetical protein  28.91 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05450  ketosteroid isomerase-like enzyme  31.2 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3076  hypothetical protein  29.41 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0954  hypothetical protein  35.59 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1847  hypothetical protein  30.22 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107946  hitchhiker  0.000000216715 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4734  hypothetical protein  28.81 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1030  hypothetical protein  24.03 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.446218  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0773  hypothetical protein  23.2 
 
 		 153 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  hitchhiker  0.00671435 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0907  calcium/calmodulin dependent protein kinase II association-domain-containing protein  24.81 
 
 		 164 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3100  hypothetical protein  28.47 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1942  hypothetical protein  22.3 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4101  hypothetical protein  24.83 
 
 		 182 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>