25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05460 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_05460  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  266  7e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3153  hypothetical protein  58.4 
 
 		 286 aa  147  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.285807  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6230  hypothetical protein  55.2 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4023  hypothetical protein  55.56 
 
 		 141 aa  144  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4098  hypothetical protein  55.56 
 
 		 141 aa  144  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4253  hypothetical protein  55.56 
 
 		 141 aa  144  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0446554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0239  hypothetical protein  52 
 
 		 138 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0429  hypothetical protein  53.72 
 
 		 132 aa  140  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434725  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0951  hypothetical protein  54.4 
 
 		 282 aa  140  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1333  hypothetical protein  38.21 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.132066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4556  hypothetical protein  38.21 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4063  hypothetical protein  38.21 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4328  hypothetical protein  31.45 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.295995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4113  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03879  hypothetical protein  28.91 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07250  hypothetical protein  32.5 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2146  hypothetical protein  28.33 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1336  ketosteroid isomerase-like protein  28 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3851  hypothetical protein  35.14 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2121  hypothetical protein  27.5 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.8 
 
 		 288 aa  57.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130603 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4570  Ketosteroid isomerase-like protein  29.55 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.432732 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3498  Ketosteroid isomerase-like protein  29.55 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.481588  normal  0.403551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4168  hypothetical protein  27.2 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4875  hypothetical protein  24.6 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0164679 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>