27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4168 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4168  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  301  3.0000000000000004e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4875  hypothetical protein  68.53 
 
 
146 aa  213  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0164679 
 
 
-
 
NC_003296  RS03879  hypothetical protein  38.76 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4328  hypothetical protein  32.37 
 
 
141 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.295995  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2146  hypothetical protein  31.54 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0660  hypothetical protein  32.61 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4113  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2121  hypothetical protein  30.87 
 
 
148 aa  80.1  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0249  hypothetical protein  39.19 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150552  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07250  hypothetical protein  32.61 
 
 
218 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0220  hypothetical protein  37.84 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.629551  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05450  ketosteroid isomerase-like enzyme  35.46 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.77 
 
 
288 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130603 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4556  hypothetical protein  30.5 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4063  hypothetical protein  29.79 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1333  hypothetical protein  30.5 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.132066 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0239  hypothetical protein  33.59 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0915444 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3153  hypothetical protein  32.45 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.285807  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2545  hypothetical protein  33.98 
 
 
145 aa  62.8  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3851  hypothetical protein  29.69 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1336  ketosteroid isomerase-like protein  27.4 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916709  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0429  hypothetical protein  29.92 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434725  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6230  hypothetical protein  31.5 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0951  hypothetical protein  31.34 
 
 
282 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4023  hypothetical protein  28.57 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4253  hypothetical protein  28.57 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0446554 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4098  hypothetical protein  28.57 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204789  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05460  hypothetical protein  27.2 
 
 
129 aa  47  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>